Original title: Isoflavonsynthasa: přítomnost a aktivita v bobovitých a nebobovitých rostlinách
Translated title: Isoflavonsynthasa: přítomnost a aktivita v bobovitých a nebobovitých rostlinách
Authors: Pičmanová, Martina ; Honys, David (advisor) ; Vaňková, Radomíra (referee)
Document type: Master’s theses
Year: 2010
Language: eng
Abstract: [eng] [cze]
Isoflavone synthase (IFS; CYP93C) plays a key role in the biosynthesis of the plant secondary metabolites, isoflavonoids. These phenolic compounds, which are well-known for their multiple biological effects, are produced mostly in leguminous plants (family Fabaceae). However, at least 225 of them have also been described in 59 other families, without any knowledge of orthologues to hitherto known IFS genes from legumes (with the single exception of sugar beet - Beta vulgaris, from the family Chenopodiaceae). In view of these facts, this masters thesis has focused on two main objectives: (1) to identify isoflavone synthase genes in selected leguminous and non-leguminous plants exploiting the PCR strategy with degenerate and non-degenerate primers, and (2) to find a system for the verification of the correct function of these genes. Our methodology for the identification of IFS orthologues was successfully demonstrated in the case of two examined legumes - Phaseolus vulgaris L. and Pachyrhizus tuberosus (Lam.) Spreng, in the genomic DNA of which the complete IFS sequences have been newly identified. To design a procedure for ascertaining the correct function of these genes and others once they have been completely described, a pilot study with IFS from Pisum sativum L. (CYP93C18; GenBank number... Isoflavonsynthasa (IFS; CYP93C) hraje klíčovou roli v biosyntéze rostlinných sekundárních metabolitů - isoflavonoidů. Tyto fenolické látky, známé díky širokému spektru svých biologických účinků, jsou produkovány především rostlinami z čeledi bobovitých (Fabaceae). Ačkoliv bylo nejméně 225 isoflavonoidů popsáno i v 59 dalších čeledích, ortolog známých IFS z bobovitých rostlin byl doposud popsán pouze v jediné nebobovité rostlině - Beta vulgaris (čeleď Chenopodiaceae). Tato diplomová práce si na základě zmíněných poznatků kladla za cíl (1) identifikovat ortologní geny pro isoflavonsynthasu ve vybraných bobovitých a nebobovitých rostlinách a (2) vytvořit sytém pro ověřování správné funkce těchto genů. Naše metodika pro identifikaci ortologů IFS se osvědčila v případě dvou zkoumaných bobovitých rostlin - Phaseolus vulgaris L. a Pachyrhizus tuberosus (Lam.) Spreng, v jejichž genomické DNA byly nově identifikovány kompletní sekvence genu pro IFS. Aby bylo možno v budoucnu ověřit správnou funkci těchto a dalších případných genů pro IFS, byla provedena pilotní studie s IFS isolované z Pisum sativum L. (CYP93C18; GenBank number AF532999). Gen pro CYP93C18 byl identifikován, klonován s využitím Gateway™ technologie a vnesen do Arabidopsis thaliana - rostliny postrádající biosyntetickou dráhu isoflavonoidů....
Keywords: CYP93C18; cytochrome P450; endoplasmic reticulum membrane; gene over-expression; GFP; isoflavone synthase; Pachyrhizus tuberozus (Lam.) Spreng; Phaseolus vulgaris L; Pisum sativum L; CYP93C18; cytochrom P450; genová overexprese; GFP; isoflavonsynthasa; membrána endoplasmatického retikula; Pachyrhizus tuberozus (Lam.) Spreng; Phaseolus vulgaris L; Pisum sativum L

Institution: Charles University Faculties (theses) (web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository.
Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/31393

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-295880


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Charles University > Charles University Faculties (theses)
Academic theses (ETDs) > Master’s theses