Original title: Změny proteinové exprese vyvolané kyselinou valproovou u lidské T-lymfocytární linie MOLT-4
Translated title: Alterations in protein expression induced by valproic acid in human T-lymphocyte cell line MOLT-4
Authors: Tichá, Zuzana ; Kvasničková, Eva (advisor) ; Řezáčová, Martina (referee)
Document type: Master’s theses
Year: 2009
Language: cze
Abstract: [cze] [eng]
Univerzita Karlova Farmaceutická fakulta Katedra biochemických věd ZMĚNY PROTEINOVÉ EXPRESE PO OVLIVNĚNÍ KYSELINOU VALPROOVOU U LIDSKÉ T-LYMFOCYTÁRNÍ BUNĚČNÉ LINIE MOLT-4. Kyselina valproová (VA) je inhibitor histon deacetylasy (HDACI) a při kultivaci leukemických buněk vede k zástavě jejich růstu a indukci apoptózy. Cílem práce bylo stanovit změny exprese proteinů po ovlivnění nádorových buněk VA. Lyzáty ilzolovaných jader po 4 hodinové inkubaci buněk s 2 a 4 mmol/l VA byly použity pro detekci změn hladiny proteinů. Proteiny buněčných lyzátů byly v první dimenzi separovány izoelektrickou fokusací na imobilizovaném pH gradientu. Po proběhnutí fokusace byly proteiny separovány elektroforeticky na 9-16% gradientovém DS gelu. Po proběhnuté elektroforéze byly proteiny detekovány barvením stříbrem a proteinová mapa digitalizována pomocí laserového denzitometru. Vyhodnocení proteinových map bylo provedeno pomocí programu Melanie 3. Identifikace proteinů byla provedena na MALDI hmotnostním spektrometru. Vyhledávání proteinů v databázích bylo provedeno podle programů ProFound a PeptIdent. Identifikace proteinů, které se po ovlivnění VA statisticky signifikantně měnily pomůže pochopit molekulární cesty, pomocí kterých ovlivňuje VA leukemické buňky. V našich experimentech sledující změny jednotlivých proteinů po... Univerzita Karlova Farmaceutická fakulta Katedra biochemických věd EFFECT OF VALPROIC ACID (VA) ON CHANGES IN EXPRESSION OF PROTEINS OF HUMAN T-LYMPHOCYTE LEUKEMIA CELL LINE MOLT-4 Valproic acid (VA) is histondeacetylase inhibitor (HDACI) and it leads to inhibition in proliferation and apoptosis induction during incubation with leukemia cells. The aim of our article was to determine the changes in expression of proteins after incubation leukemia cells with VA. After 4-hours-long incubation of MOLT-4 cells with 2 and 4 mmol/l VA, the nuclear extracts from MOLT-4 cells were used to detection of changes in levels of proteins. The nuclear extracts were separated for first dimension-IEF in immobilized pH 4-7 gradient. Immediately after being focused, the proteins were separated for electophoretic way in the second dimension, 9-16% gradient DS was used. Proteins separated by 2D electrophoresis were visualized by silver staining , and silver-stained gels were digitized using a laser personal densitometer. Protein maps were quantified using a Melanie 3 software package. Proteins were identified by MALDI mass spectrometer. The finding protein process was finished by using ProFound and PeptIdent programs. Identification process of protein spots exhibiting significant abundance alterations induced by VA help to...

Institution: Charles University Faculties (theses) (web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository.
Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/24243

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-279123


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Charles University > Charles University Faculties (theses)
Academic theses (ETDs) > Master’s theses