Original title:
Zpracování obrazu Petriho misek
Translated title:
Processing of Images of Petri Dishes
Authors:
Adámek, Jakub ; Hradiš, Michal (referee) ; Zemčík, Pavel (advisor) Document type: Master’s theses
Year:
2015
Language:
cze Publisher:
Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií Abstract:
[cze][eng]
Tato práce se zabývá zpracováním obrazu na Petriho miskách. V první části práce je souhrn odborných výrazů a postupů v laboratorní praxi. Následuje přehled zařízení a algoritmů pro analýzu obrazu Petriho misek. V druhé části je návrh a implementace vlastní aplikace pro automatické počítání bakteriálních kolonií, která byla vyvíjena ve spolupráci s mikrobiologickou laboratoří. Aplikace je určena pro mobilní zařízení s operačním systémem Android. Součástí práce je také návrh a vytvoření dvou osvětlovacích jednotek, které slouží jako příslušenství pro dosažení lepších výsledků při analýze Petriho misky. V závěru práce jsou uvedeny dosažené výsledky, porovnání osvětlovacích jednotek a různých typů mobilních zařízení, na kterých byla aplikace testována.
This master thesis deals with image processing of Petri dishes. The first part is about terms and procedures in laboratory practice. The following part is about devices and algorithms for image analysis of Petri dishes. The second part is about draft and implementation of own colony counting application, which was developed in cooperation with the microbiological laboratory. The application is developed for mobile devices running Android OS. The master thesis also includes the design and creation of two lighting units, which uses as an accessory for better results in the analysis of Petri dishes. In conclusion are presented results, compared lighting units and various types of mobile devices, on which the application was tested.
Keywords:
agar; bacterial colony; colony counting; ColonyCatcher; devices for colony counting; image processing; microbiology; morphology operations; Petri dish; thresholding; watershed; agar; ColonyCatcher; kolonie bakterií; mikrobiologie; morfologické operace; nástroje pro počítání kolonií; Petriho miska; počítání kolonií; prahování; watershed; zpracování obrazu
Institution: Brno University of Technology
(web)
Document availability information: Fulltext is available in the Brno University of Technology Digital Library. Original record: http://hdl.handle.net/11012/64082