Original title: Předzpracování obrazu 1D gelové elektroforézy
Translated title: Preprocessing of 1D gel electrophoresis image
Authors: Hlavatý, Matej ; Harabiš, Vratislav (referee) ; Vítek, Martin (advisor)
Document type: Bachelor's theses
Year: 2014
Language: cze
Publisher: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
Abstract: [cze] [eng]
Projekt sa zaoberá automatickým spracovaním výsledkov 1D gélovej elektroforézy. Študuje základné princípy elektroforézy a druhy šumu a chýb ovplyvňujúcich výsledok. Navrhovaný program slúži na automatickú detekciu stĺpcov v obraze. Z čiernobielych digitálnych snímkov elektroforézy vytvára sumačnú projekciu na vodorovnú os. Po vyhladení profilu hľadá lokálne minimá pomocou derivácie projekcie. V týchto miestach určuje hranice medzi stĺpcami dát. The aim of this project is an automatic analysis of 1D gel electrophoresis results. Basic principles of gel electrophoresis and types of errors and signal noise influencing the result are studied. The proposed algorithm serves for automatic detection of lanes in the image. Summation projection on the horizontal axis is created from black-and-white digital pictures of electrophoresis. Local minima of the profile are located after smoothing the profile. In the location of these minima borders between lanes are established.
Keywords: contrast enhancement; function local extremes; Gel electrophoresis; lane detection; median filter; detekcia stĺpcov; Gélová elektroforéza; lokálne extrémy funkcie; mediánový filter; úprava kontrastu

Institution: Brno University of Technology (web)
Document availability information: Fulltext is available in the Brno University of Technology Digital Library.
Original record: http://hdl.handle.net/11012/33145

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-244353


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Brno University of Technology
Academic theses (ETDs) > Bachelor's theses