Original title: Analýza dat z DNA čipů
Translated title: Microarray Data Analysis
Authors: Vogel, Ivan ; Smrž, Pavel (referee) ; Šilhavá, Jana (advisor)
Document type: Bachelor's theses
Year: 2008
Language: cze
Publisher: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií
Abstract: [cze] [eng]
Cieľom tejto bakalárskej práce je popísať technológiu a analýzu komplementárnych DNA čipov. Predstavené sú niektoré algoritmy využívané pri analýze. Podrobnejšie sa venuje problematike zhlukovania dát, predovšetkým rozoberá varianty hierarchického zhlukovania. Ďalej predstavuje prehľad dostupného komerčného aj nekomerčného softvéru z tejto oblasti. Zahŕňa návrh vlastnej implementácie hierarchických metód. V závere sú porovnané výsledky s podobným nekomerčným softvérom. The aim of this bachelor thesis is to describe the DNA microarray technology. Several analytical algorithms are discussed. It describes closely the clustering methods, especially several hierarchical clustering modifications. It gives a summary of available commercial and uncommercial software for microarray analysis. The thesis describes own implementation design of hierarchical methods. At the end, results are compared with similar uncommercial software.
Keywords: clustering; correlation coefficient; dendrogram; DNA microarray; hybridisation; similarity matrix; dendrogram; DNA čip; hybridizácia; korelačný koeficient; matica podobností; zhlukovanie

Institution: Brno University of Technology (web)
Document availability information: Fulltext is available in the Brno University of Technology Digital Library.
Original record: http://hdl.handle.net/11012/55365

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-238315


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Brno University of Technology
Academic theses (ETDs) > Bachelor's theses