Original title:
Biodegradace environmentálních polutantů Strukturní charakterizace nového typu halogenalkandehalogenasy LinB32 ze Sphingobium japonicum UT26
Translated title:
Biodegradation of environmental pollutants - Structural characterization of a new type of haloalkane LinB32 from Sphingobium japonicum UT26
Authors:
NĚMEC, Pavel Document type: Bachelor's theses
Year:
2013
Language:
cze Abstract:
[cze][eng] Cílem této práce bylo seznámit se s metodami proteinové krystalografie a pokusit se o krystalizaci modelového proteinu Thaumatinu a nově připravené halogenalkandehalogenasy LinB32 ze Sphingobium japonicum UT26. Krystalizace byla provedena metodami sedící a visící kapky, krystalizací pod olejem a krystalizací v kapilárách. Po změření difrakčních dat byla struktura LinB32 modelována ve volně dostupných verzích softwarových nástrojů pro vizualizaci a řešení strukturních dat WinCoot a VMD.The main aim of this thesis was focused on protein crystallography and attempt to crystallize model protein Thaumatin and a new prepared haloalkane dehalogenase LinB32 of Sphingobium japonicum UT26. Crystallization trials were performed using the sitting and hanging drop vapour diffusion methods, crystallization under oil and crystallization in the capillaries. After measuring of diffraction data, the structure of LinB32 was modeled by the use of visualizing molecular modeling programs WinCoot and VMD.
Keywords:
crystallization methods; haloalkane dehalogenase; protein crystallography; protein structure; halogenalkandehalogenasy; krystalizační metody; proteinová krystalografie; struktura proteinu Citation: NĚMEC, Pavel. Biodegradace environmentálních polutantů Strukturní charakterizace nového typu halogenalkandehalogenasy LinB32 ze Sphingobium japonicum UT26. České Budějovice, 2013. bakalářská práce (Bc.). JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH. Fakulta rybářství a ochrany vod
Institution: University of South Bohemia in České Budějovice
(web)
Document availability information: Fulltext is available in the Digital Repository of University of South Bohemia. Original record: http://www.jcu.cz/vskp/27787