Original title: Biodegradace environmentálních polutantů - charakterizace mutantní halogenalkandehalogenasy DhaA31 z Rhodococcus rhodochrous NCIMB 13064
Translated title: Biodegradation environmental pollutans - characterization of mutant haloalkan dehalogenase DhaA31 of Rhodococcus rhodochrous NCIMB 13064
Authors: MALCHER, Pavel
Document type: Bachelor's theses
Year: 2013
Language: cze
Abstract: [cze] [eng]
Cílem práce bylo naučit se používat metody proteinové krystalografie v praxi a pokusit se připravit krystaly mutantní formy halogendehalogenasy DhaA31 a modelového proteinu Thermolysinu pomocí základních a pokročilých krystalizačních metod a následně vyřešit a graficky zobrazit jejich struktury pomocí počítačových nástrojů používaných pro molekulární modelování. Výsledkem projektu bylo vypěstování krystalů obou proteinů a popis struktury a aktivního místa proteinu DhaA31, který byl připraven z důvodu zvýšení rychlosti katalytické reakce při odbourávání chlorovaných derivátů uhlovodíků, především 1,2,3-trichlorpropanu (TCP) z volných vod. The project was focused on using of protein crystallography practically and mainly on preparation of crystals of model protein Thermolysin and haloalkan dehalogenase mutant variant DhaA31 with the use of standard and advanced crystallization methods. Later the DhaA31 structure was solved and graphically visualized using the molecular modeling programs as well as the structure of Thermolysin. Obtaining the crystals of both studied proteins and description of the DhaA31 structure, active site and dehalogenation reaction were results of the project. DhaA31 mutant variant was prepared to increase the catalytic reaction during degradation of halogenated compounds such as 1,2,3-trichloropropane (TCP) from water sources.
Keywords: crystallization; dehalogenase; halogenalkandehalogenáza; krystalizace
Citation: MALCHER, Pavel. Biodegradace environmentálních polutantů - charakterizace mutantní halogenalkandehalogenasy DhaA31 z Rhodococcus rhodochrous NCIMB 13064. České Budějovice, 2013. bakalářská práce (Bc.). JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH. Fakulta rybářství a ochrany vod

Institution: University of South Bohemia in České Budějovice (web)
Document availability information: Fulltext is available in the Digital Repository of University of South Bohemia.
Original record: http://www.jcu.cz/vskp/27786

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-154918


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > University of South Bohemia in České Budějovice
Academic theses (ETDs) > Bachelor's theses