Original title: Structure-function analysis of selected hop (Humulus lupulus L.) regulatory factors
Translated title: Structure-function analysis of selected hop (Humulus lupulus L.) regulatory factors
Authors: FÜSSY, Zoltán
Document type: Doctoral theses
Year: 2013
Language: cze
Abstract: [cze] [eng]
Práce byla soustředěna na izolaci nových transkripčních faktorů (TF) chmelu z rodin bHLH, bZIP, MYB a WRKY, které se účastní regulace metabolických drah flavonoidů lupulinových žlázek. Následně byla provedena strukturní a funkční analýza těchto faktorů. Strukturní analýza zahrnovala metody bioinformatiky pro predikci genové organizace, doménové struktury předpokládaných proteinových produktů a potencionální post-translační modifikace. Provedl jsem mutagenezi pro odhalení funkce fosforylačních míst pro stabilitu HlbZIP1A. Dále tato práce zjistila protein-DNA interakce získaných TF a podpořila vazbu komplexů MYB-bHLH-WDR na promotor chalkonsyntázy H1, klíčového enzymu syntézy flavonoidů lupulinu. Použitím bioinformatických metod, kvantitativní RT-PCR a tranzientní koexprese jsem ukázal, že chalkonsyntáza H1 je regulačním bodem při metabolické odpovědi chmelu v průběhu patogeneze viroidu zakrslosti chmelu. This work concentrated on isolation of novel hop transcription factors from bHLH, bZIP, MYB, and WRKY families involved in the regulation of lupulin flavonoid pathways, followed by their structural and functional analysis. Structural analyses included bioinformatic approaches to elucidate gene organization, domain structure of the putative protein products, and potential post-translational modifications. I performed site-directed mutagenesis to disclose the role of phosphorylation sites in HlbZIP1A stability. Further, this work determined protein-DNA interactions for obtained TFs, giving support to the binding of MYB-bHLH-WDR complexes to the promoter of chalcone synthase H1, a key enzyme of the lupulin flavonoid pathways. Employing bioinformatic approaches, quantitative RT-PCR and transient co-expression, I pointed out chalcone synthase H1 as a regulatory crossroads in the metabolic (flavonoid) responses during hop stunt viroid pathogenesis.
Keywords: flavonoid; hop stunt viroid; Humulus lupulus; trancription factors; flavonoid; Humulus lupulus; transkripční faktory; viroid zakrslosti chmele
Citation: FÜSSY, Zoltán. Structure-function analysis of selected hop (Humulus lupulus L.) regulatory factors. České Budějovice, 2013. disertační práce (Ph.D.). JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH. Přírodovědecká fakulta

Institution: University of South Bohemia in České Budějovice (web)
Document availability information: Fulltext is available in the Digital Repository of University of South Bohemia.
Original record: http://www.jcu.cz/vskp/13952

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-151840


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > University of South Bohemia in České Budějovice
Academic theses (ETDs) > Doctoral theses