Original title: Metodika identifikace původců fuzarióz klasu pomocí PCR
Translated title: Method of identification of Fusarium species causing head blight by PCR
Authors: Sumíková, Taťána ; Gabrielová-Slezáková, Ludmila ; Žabka, Martin
Document type: Methods
Year: 2009
Language: cze
Publisher: Výzkumný ústav rostlinné výroby, v.v.i.
Abstract: [cze] [eng]
Cílem navrhované metodiky je uvedení kompletních protokolů k detekci následujících druhů r. Fusarium - F. avenaceum, F. culmorum, F. poae, F. graminearum, F. pseudograminearum, F. sporotrichioides - pomocí multiplex PCR. Sekvence použitých druhově specifických primerů jsou převzaté z literatury a byly vybrány tak, aby bylo možné je vzájemně a libovolně kombinovat, což umožňuje detekci jednoho nebo až všech šesti výše uvedených druhů v jedné PCR reakci. Reakce jsou optimalizovány pro použití v běžné laboratoři molekulární biologie. V metodice je nově zavedena technika pěstování mikromycet ve formě povrchových kultur na celofánu. Tato technika je speciálně určena pro následnou izolaci DNA z houbového mycelia. Technika pěstování povrchových kultur na celofánu umožňuje optimální manipulaci s napěstovaným myceliem, které se z celofánu snadno odstraní pomocí skalpelu, přičemž nedochází k nežádoucí kontaminaci vzorku agarovým kultivačním médiem nebo nečistotami z přirozeného substrátu (z napadeného vzorku). 1. Multiplex PCR reaction with reliable published primers, enabling an easy detection of selected Fusarium species in one reaction, without time consuming optimalization. 2. Method of micromycetes cultivation using medium covered with cellophane, that is very suitable for following DNA extraction (easier harvesting of mycelia, minimal risk of medium contamination).
Keywords: fusarium head blight; micromycetes;; modulated signal detection; molecular biology; reaction; detekce; Fusarium sp.;; fuzarióza klasu; mikromycety;; molekulární biologie; PCR;; reakce
Project no.: QG50076 (CEP), MZe0002700604
Funding provider: Ministerstvo zemědělství ČR, Ministerstvo zemědělství ČR
Rights: This work is protected under the Copyright Act No. 121/2000 Coll.

Institution: Crop Research Institute (web)

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-123850


The record appears in these collections:
Research > Scientific research institutions > Crop Research Institute
Analytical and methodological materials > Methods