|
|
Deconvolution of hemodynamic response from fMRI data
Bartoň, Marek ; Kolář, Radim (referee) ; Havlíček, Martin (advisor)
This paper deals with the variability of HRF, which may have crucial impact on outcomes of fMRI neuronal activation detection in some cases. There are three methods described - averaging, regression deconvolution and biconjugate gradient method - which provide HRF shape estimation. In frame of simulations regression method, which uses B-spline curves of 4-th order for window length of 30 s, was chosen as the most robust method. Deconvolution estimates was used as HRF models for classic analyse of fMRI data, concretely visual oddball paradigm, via general linear model. Enlargement of localizated areas was observed and after expert consultation with scientific employees from neurology clinic, outcomes was evaluated as relevant. Furthermore Matlab application, which provides confortable observation of HRF variability among brain areas, was made.
|
|
|
Signal analysis options on Arduino platform
Havlíček, Michal ; Zuth, Daniel (referee) ; Huzlík, Rostislav (advisor)
The aim of this bachelors thesis is to analyse signal with Arduino platform by creation of program which is able to perform calculations of signal´s mean value, efficiency value, Fourier transform and subsequent export of these results into computes. Furthermore it examines testing of this program and evaluation of possible limitations with usage of Arduino platform.
|
|
|
Mechatronic Approach to Vehicle Dynamics
Kučera, Pavel ; Kaplan, Zdeněk (referee) ; Havlíček, Miroslav (referee) ; Píštěk, Václav (advisor)
This theses deals with mechatronic approach to a vehicle dynamics. It is divided into two main parts. There are prepared vibration analysis, measurement and analysis of functions of truck powertrain in the first part. The second part describes the creation of computational models allowing to simulate driving conditions, vibrations of the vehicle and its extension for the development of mechatronic systems. There are shown different driving modes to control created algorithm of mechatronic system. The main tool for the development of mechatronic systems is the created simulator of vehicle enabling testing of computational models in real time.
|
|
|
Archived Data Management System
Havlíček, Martin ; Šeda, Miloš (referee) ; Máša, Vítězslav (advisor)
The goal of this work was to research the available database systems and propose a suitable database system for data archiving. Prepare the communication and processing of data between the database and delivered application Profisignal which processes the measured data from all sensors. Design architecture for the database, the storage of measured data and calculation reports on that data. At the end design the web user interface. The result of my work demonstrate possible ways of archiving data in ORACLE database, examples of calculation the reports and sample of web application, that presented the measured data.
|
|
| |
|
|
Exploring Brain Network Connectivity through Hemodynamic Modeling
Havlíček, Martin ; Hluštík, Petr (referee) ; Šmídl,, Václav (referee) ; Jan, Jiří (advisor)
Zobrazení funkční magnetickou rezonancí (fMRI) využívající "blood-oxygen-level-dependent" efekt jako indikátor lokální aktivity je velmi užitečnou technikou k identifikaci oblastí mozku, které jsou aktivní během percepce, kognice, akce, ale také během klidového stavu. V poslední době také roste zájem o studium konektivity mezi těmito oblastmi, zejména v klidovém stavu. Tato práce předkládá nový a originální přístup k problému nepřímého vztahu mezi měřenou hemodynamickou odezvou a její příčinou, tj. neuronálním signálem. Zmíněný nepřímý vztah komplikuje odhad efektivní konektivity (kauzálního ovlivnění) mezi různými oblastmi mozku z dat fMRI. Novost prezentovaného přístupu spočívá v použití (zobecněné nelineární) techniky slepé dekonvoluce, což dovoluje odhad endogenních neuronálních signálů (tj. vstupů systému) z naměřených hemodynamických odezev (tj. výstupů systému). To znamená, že metoda umožňuje "data-driven" hodnocení efektivní konektivity na neuronální úrovni i v případě, že jsou měřeny pouze zašumělé hemodynamické odezvy. Řešení tohoto obtížného dekonvolučního (inverzního) problému je dosaženo za použití techniky nelineárního rekurzivního Bayesovského odhadu, který poskytuje společný odhad neznámých stavů a parametrů modelu. Práce je rozdělena do tří hlavních částí. První část navrhuje metodu k řešení výše uvedeného problému. Metoda využívá odmocninové formy nelineárního kubaturního Kalmanova filtru a kubaturního Rauch-Tung-Striebelova vyhlazovače, ovšem rozšířených pro účely řešení tzv. problému společného odhadu, který je definován jako simultánní odhad stavů a parametrů sekvenčním přístupem. Metoda je navržena především pro spojitě-diskrétní systémy a dosahuje přesného a stabilního řešení diskretizace modelu kombinací nelineárního (kubaturního) filtru s metodou lokální linearizace. Tato inverzní metoda je navíc doplněna adaptivním odhadem statistiky šumu měření a šumů procesu (tj. šumů neznámých stavů a parametrů). První část práce je zaměřena na inverzi modelu pouze jednoho časového průběhu; tj. na odhad neuronální aktivity z fMRI signálu. Druhá část generalizuje navrhovaný přístup a aplikuje jej na více časových průběhů za účelem umožnění odhadu parametrů propojení neuronálního modelu interakce; tj. odhadu efektivní konektivity. Tato metoda představuje inovační stochastické pojetí dynamického kauzálního modelování, což ji činí odlišnou od dříve představených přístupů. Druhá část se rovněž zabývá metodami Bayesovského výběru modelu a navrhuje techniku pro detekci irelevantních parametrů propojení za účelem dosažení zlepšeného odhadu parametrů. Konečně třetí část se věnuje ověření navrhovaného přístupu s využitím jak simulovaných tak empirických fMRI dat, a je významných důkazem o velmi uspokojivých výsledcích navrhovaného přístupu.
|
|
|
The whirlpool design
Havlíček, Matěj ; Pech, Ondřej (referee) ; Štětina, Josef (advisor)
The bachelor thesis is conceived as a research of the availability of home whirlpools, their design and also as an analysis of the cost of production of the whirlpool. In the first part, there is an introduction of components and their variants for the whirlpool. The second part is focused on the author's design and the choice of components for the designed whirlpool. In conclusion, there is an expected price of the whirlpool and a comparison between buying a whirlpool or own homemade. The work contains a design in a program Autodesk Inventor.
|
|
|
Application of clustering methods for processing of biomedical data
Rozinek, Michal ; Gazárek, Jiří (referee) ; Havlíček, Martin (advisor)
The goal of this study is to learn about methods in object classification in medicine and find out what are these methods about. Focusing on functionality and reliability of these methods whith datafile from the medicine compartment after making the algorithm in MATLAB. In form of siple tests, put the touch everyone of classification procedure and find out in which they excel and in which they lags. The choice of input data parametres is very important, this will be tested and noted in conclusions.
|
|
|
Segmentation of magnetic resonance images
Hanák, Pavel ; Harabiš, Vratislav (referee) ; Havlíček, Martin (advisor)
Segmentation, magnetic resonance, grey matter, white matter, thresholding, region growing, splitting and merging, watershed, level set method.
|
|
|
The effect of tyres on the output parameters of tractors
Kopečný, Aleš ; Havlíček, Miroslav (referee) ; Bauer, František (advisor)
The thesis summarizes the results of the measurement of the output parameters of the tractor, on which were mounted three different types of tires. The measured parameters are the maximum pulling power, slippage, specific effective fuel consumption at the maximum pulling performance. The final measured and calculated results are presented in tables and graphs. The results of the measurements were processed by the use of regressive analysis.
|
guest ::
RSS feed.