|
|
Detekce faktorů virulence a genů rezistence bakteriálních patogenů u pacientů s cystickou fibrózou
Jandová, Oldřiška ; Melter, Oto (vedoucí práce) ; Nyč, Otakar (oponent)
Cystická fibróza je autozomálně recesivní genetické onemocnění, které je způsobeno mutacemi v genu CFTR (Cystic Fibrosis Transmembrane Conductance Regulator). Tento gen kóduje stejnojmenný protein, který pokud je narušena jeho funkce, je odpovědný za patogenezi tohoto onemocnění. Cystická fibróza je charakteristická častými respiračními infekcemi, které vedou k destrukci plicní tkáně. Tyto infekce se vyznačují přítomností typických bakteriálních patogenů např. S. aureus, P. aeruginosa a dalších. Právě S. aureus patří mezi typické oportunní patogeny, které u pacientů s cystickou fibrózou způsobují vážné komplikace. Kmeny S. aureus se vyznačují produkcí mnoha faktorů patogenity a vlivem důrazné léčby antibiotiky také rezistencí k používaným antibiotikům. Jednou z možností, jak mohou bakterie snížit svou citlivost k určitému antibiotiku je tvorba fenotypových variant SCV, které se vyskytují u skupiny pacientů, kteří jsou intenzivně léčeni antibiotiky. Pacienti s cystickou fibrózou touto skupinou bezesporu jsou. Cílem bakalářské práce bylo studium izolátů S. aureus od tří pacientů s cystickou fibrózou, kteří jsou dlouhodobě infikováni tímto patogenem. U těchto izolátů určit zda se mění jejich vlastnosti či rezistence v průběhu chronické infekce. Powered by TCPDF (www.tcpdf.org)
|
|
|
Zavedení diagnostiky nových bakteriálních patogenů Inquilinus a Pandoraea izolovaných od pacientů s cystickou fibrózou a stanovení jejich citlivosti k antibiotikům
Šulcová, Romana ; Melter, Oto (vedoucí práce) ; Nyč, Otakar (oponent)
Cystická fibróza patří mezi nejčastěji se vyskytující autozomálně recesivně dědičné onemocnění. V dnešní době mají lidé s tímto onemocněním, díky včasné diagnostice a léčbě dalších přidružených příznaků, lepší prognózu než před několika lety. CF je onemocnění, které je podmíněno mutací genu CFTR (Cystic Fibrosis Transmembrane Conductance Regulator) na chromozomu 7. Defektem proteinu CFTR dochází k poruše resorpce a sekrece elektrolytů v chloridovém kanálu a tím k tvorbě viskózního hlenu v plicích, který je hlavní příčinou chronických bakteriálních infekcí dolních dýchacích cest. Mezi nejčastějšími patogeny, které způsobují závažné infekce dýchacích cest u pacientů s CF patří: Staphylococcus aureus, Pseudomonas aeruginosa, Burkholderia cepacia komplex. U pacientů s CF se dnes prokazují v dýchacích cestách nové bakteriální druhy, jejichž biologické vlastnosti nejsou dosud známé a jejich role v etiopatogenezi onemocnění a epidemiologii nejsou přesně známé. K jejich detekci se v dnešní době používají specifické metody amplifikace a nebo sekvenace genu pro 16S rRNA. Nově se objevující patogeny patří například do rodu Pandoraea a Inguilinus, které řadíme do skupiny gramnegativních nefermentujících tyčinek, a proto jsou často zaměňovány za jiné jim fenotypově podobné bakteriální druhy, jejichž výskyt je u CF...
|
|
|
Rezistence kmenů Helicobacter pylori na antimikrobiální léčbu
Moravcová, Monika ; Keil, Radan (vedoucí práce) ; Nyč, Otakar (oponent)
Helicobacter pylori (dále H. pylori) je gramnegativní bakterie, která kolonizuje žaludeční sliznici člověka. Je jasně prokázána její role v etiopatogenezi chronické gastritidy, vředové choroby gastroduodena, MALT-lymfomu a v souvislosti se vznikem karcinomu žaludku byla označena Světovou zdravotnickou organizací (WHO) za karcinogen I. třídy. Infekci H. pylori lze diagnostikovat ze vzorků žaludeční sliznice odebraných při endoskopickém vyšetření za použití metody rychlého ureázového testu, mikroskopického vyšetření nebo kultivace bioptického materiálu, anebo lze aplikovat techniky neinvazivní (dechový test s 13 C značenou ureou, popř. detekci antigenu HpSA ve stolici). Efektivní terapie infekce H. pylori spočívá v podávání kombinace antibiotik a inhibitoru protonové pumpy. V posledních letech se v celosvětovém měřítku zvyšuje rezistence bakteriálních kmenů na užívaná antibiotika a tento trend můžeme sledovat také u H. pylori. Pokud úroveň rezistence překročí 20 % pro klaritromycin a 40 % pro metronidazol, nedoporučuje se tato antibiotika k léčbě infekcí vyvolaných touto bakterií používat. Ve skupině 61 pacientů Interní kliniky FN Motol, kteří během posledních dvou let podstoupili endoskopické vyšetření žaludku a duodena spojené s odběrem vzorku žaludeční sliznice, byla proto zjišťována citlivost...
|
|
| |
|
|
Clostridium difficile - Význam a současné možnosti laboratrní diagnostiky
Partlová, Simona ; Nyč, Otakar (vedoucí práce) ; Bártová, Markyta (oponent)
Práce se zabývá převážně problematikou diagnostiky kmenů Clostridium difficile. V úvodu je tato bakterie stručně charakterizována a v dalším textu jsou pak uvedené její obecné vlastnosti, příčiny a projevy onemocnění, které způsobuje a současné možnosti laboratorní diagnostiky v lékařské mikrobiologii. Praktická část se zabývá vyšetřením průkazu toxinů C.difficile ve stolici, které bylo v případě pozitivního výsledku doplněno kultivací. Kultivace a následné stanovení citlivosti na antibiotika není prováděna rutinně v každé laboratoři. Relativně novou metodou, dostupnou zatím jen na některých pracovištích, se stala PCR ribotypizace kmenů. Celkem bylo v laboratoři Ústavu lékařské mikrobiologie FN Motol vyšetřeno 195 pacientů s cílem prokázat přítomnost toxinů C.difficile ve stolici. Z tohoto počtu bylo 30 vzorků stanoveno jako pozitivní na přítomnost těchto toxinů. Vzorky s pozitivním nálezem byly následně kultivovány na speciálních půdách určených pro kultivaci C.difficile. Po získání čisté kultury kmene byla stanovena citlivost k metronidazolu. Powered by TCPDF (www.tcpdf.org)
|
|
|
Srovnání amplifikační a neamplifikační metody detekce HPV v klinických vzorcích
Jarolímková, Pavlína ; Nyč, Otakar (vedoucí práce) ; Dražďáková, Marcela (oponent)
Karcinom děložního čípku je druhým nejčastějším zhoubným nádorem u žen ve světě a je způsoben infekcí lidským papillomavirem. K šíření infekce HPV dochází především sexuálním stykem. V současnosti je HPV nejčastější sexuálně přenosnou infekcí. Cílem této bakalářské práce a jedním z cílů grantu IGA MZ NC 5959 bylo porovnání citlivosti a specifity metody polymerázové řetězové reakce a metody neamplifikační hc2 pro detekci HPV DNA v cervikálních stěrech pacientek se suspektním cytologickým nálezem. PCR je metodou velmi citlivou a je na ní založena řada komerčních setů. V rutinních virologických laboratořích se k detekci HPV infekce dnes nejvíce používá komerčně dostupná hybridizační souprava DNA test hc2 HPV. Powered by TCPDF (www.tcpdf.org)
|
|
|
Klasická a PCR diagnostika bakteriálních meningitid
Fárová, Marcela ; Nyč, Otakar (vedoucí práce) ; Hobstová, Jiřina (oponent)
Cílem této práce bylo vzájemné porovnání metod používaných v diagnostice bakteriálních meningitid. Bakteriální meningitida je závažné onemocnění a jeho laboratorní diagnostika by měla zahrnovat takové spektrum vyšetření, aby byla pravděpodobnost zachycení etiologického agens co nejvyšší. Vzájemně porovnána byla výtěžnost latexové aglutinace, klasické bakteriální kultivace a průkazu DNA Neisseria meningitidis, Haemophilus influenzae a Streptococcus pneumoniae. Výsledky potvrzují přínos PCR, který spočívá v rychlosti, specifičnosti a ve vysoké citlivosti. Dokladem toho je i zjištění, že v 5 případech byla reakce PCR pozitivní při negativitě ostatních použitých metod. Powered by TCPDF (www.tcpdf.org)
|
|
| |
|
|
Nozokomiální nákazy, význam, nejčastější původci, možnosti prevence
Klemensová, Vilma ; Nyč, Otakar (vedoucí práce) ; Bártová, Markéta (oponent)
Bakalářská práce shrnuje význam a prevenci nozokomiálních nákaz se zaměřením na (MRSA). V teoretické částí jsou rozebrány způsoby přenosu NN, jednotliví původci NN společně s bránami vstupu infekce. MRSA jako významný nozokomiální patogen představuje riziko závažných infekcí pro hospitalizované pacienty. Jeho laboratorní průkaz zahrnuje kombinaci rů zných metod pro dosažení co nejvyšší spolehlivosti detekce a následnou účinnou lé čbu a prevenci dalšího šířenÍ. V experimentální části jsou prezentovány výsledky sledování výskytu MRSA za rok 2006, které jsou p říznivé i ve srovnání s minulými lety. Ukazuje se, že důsledná mezioborová spolupráce je podmínkou účinných postupů zamezujících dalšímu šíření MRSA v velké nemocnici. Powered by TCPDF (www.tcpdf.org)
|
|
|
ATB rezistence, její význam v současné medicíně, možnosti prevence. Klebsiella sp. produkující esbl jako původce nozokomiálních infekcí
Vaňková, Iva ; Nyč, Otakar (vedoucí práce) ; Prusík, Filip (oponent)
Antibiotikum se v dnešní době užívá jako společný název pro přírodní i chemické látky s antimikrobiálním účinkem, které se užívají pro léčbu infekčních nemocí. Mají schopnost inhibovat růst mikroorganismu nebo ho usmrtit. Obranným procesem bakterií je mikrobiální rezistence na tyto látky. Bylo zjištěno více mechanismů rezistence. Nejčastějším podkladem rezistence je inaktivace antibiotika vlivem bakteriálních enzymů. Typické jsou zejména beta-laktamázy, které jsou schopny hydrolyzovat beta-laktamová antibiotika. Velká skupina beta-laktamů je charakteristická beta-laktamovým kruhem ve své chemické struktuře, který beta- laktamázy atakují a způsobují hydrolýzu antibiotika. Po létech intenzivního podávání, se vyvinula u četných druhů multirezistence způsobená enzymy schopnými inaktivovat širší spektrum beta-laktamáz. Souhrnně se označují ESBL (extended spectrum beta-lactamases). Tento mechanismus rezistence byl poprvé zjištěn v roce 1983. Powered by TCPDF (www.tcpdf.org)
|
host ::
RSS.