|
|
Growth and control of Pseudomonas aeruginosa in a multi-species biofilm
Hutlas, Andrej ; Kučerová, Marta (vedoucí práce) ; Konečná, Klára (oponent)
UNIVERZITA KARLOVA, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Cardiff University, School of Pharmacy and Pharmaceutical Sciences Štúdijný program: Farmácia Kandidát: Andrej Hutlas Konzultanti: PharmDr. Marta Kučerová, Ph.D. (UK); Prof. Jean-Yves Maillard (Cardiff); BSc. Katarzyna Ledwoch Ph.D. (Cardiff) Biofilmy sú základný spôsob rastu väčšiny baktérií. Mikróby sa obalia v matrici, zloženej najmä z extracelulárnych polymérnych zlúčenín. Biofilm sa môže skladať z viacerých druhov baktérií. Prostredie biofilmovej matrice indukuje rozličné fyziologické zmeny, ako zmena do latentného stavu či indukcia biofilm-špecifických génov. Vyzretý biofilm je heterogénny, kvóli rozdielom v spotrebe živín a distribúcii mikróbov naprieč biofilmom. Matrica poskytuje baktériám veľa výhod, napríklad zachytávanie a transport živín alebo ochranu pred extrémnymi podmienkami. Skúmané boli viacdruhové biofilmy z umyvadlového sifonu so zameraním na P. aeruginosa. Tento oportunistický patogén spôsobuje nozokomiálne infekcie, hlavne u imunokompromitovaných pacientov, so značnými zdravotnými a socio-ekonomickými dopadmi. Bola stanovená spojitosť medzi umývadlami a prostredím kontaminovaním P. aeruginosa. Dekontaminácia prostredia môže byť prístup ako znížiť spomínané dopady. Bola vyvinutá nová metodológia na popis vertikálneho...
|
|
|
Zavedení bezobratlého zvířecího modelu, Galleria mellonella, pro studium účinnosti in vivo, stávajících a nově syntetizovaných, kandidátních antituberkulotik
Kubíček, Jiří ; Konečná, Klára (vedoucí práce) ; Němečková, Ivana (oponent)
Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra biologických a lékařských věd Studijní obor: Farmacie Autor: Jiří Kubíček Vedoucí práce: RNDr. Klára Konečná, Ph.D. Název diplomové práce: Zavedení bezobratlého zvířecího modelu, Galleria mellonella, pro studium účinnosti in vivo, stávajících a nově syntetizovaných, kandidátních antituberkulotik. Cíl práce: Cílem této diplomové práce bylo představit bezobratlý organismus, Galleria mellonella (G. mellonella), Pyralidae, jakožto alternativní, ekonomicky výhodnější a morálně lépe akceptovatelný model pro studie účinnosti antituberkulotických látek in vivo. V experimentální části této práce byla úvodem věnována pozornost optimalizaci metodických kroků, které by měly vést k vyšší reprodukovatelnosti a validitě získaných dat. Byl hodnocen vliv disagregačního suplementu, tyloxapolu, na růst bakterie Mycobacterium aurum (M. aurum). Byl rovněž mapován růst tohoto mikrobiálního kmene v kultivačním médiu, Middlebrook 7H9, za účelem určit exponenciální fázi růstu. V rámci druhé části experimentů byla provedena infekce larev G. mellonella bakteriálním kmenem M. aurum, s následnou administrací vybraných, komerčně dostupných antituberkulotik (anti-TB). Metody: Pro mapování exponenciální fáze růstu bakterie M. aurum byla provedena kultivace...
|
|
|
Analysis of flagellar proteins in Clostridium difficile isolates of clinically relevant PCR-ribotypes
Houdková, Kateřina ; Konečná, Klára (vedoucí práce) ; Tichý, Aleš (oponent)
Univerzita Karlova Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra biochemických věd Kandidátka: Kateřina Houdková MPharm Školitelka: RNDr. Klára Konečná, Ph.D. Konzultant: PharmDr. Jiří Dresler, Ph.D. Název rigorozní práce: Analýza flagelárních proteinů klinicky reprezentativních ribotypů bakterie C. difficile Cíl práce: Kmeny C. difficile známé svou epidemiologickou důležitostí pro člověka jsou spojeny se závažnými klinickými příznaky infekce C. difficile (CDI). V této studii byly předmětem analýzy proteiny uvolněné z in vitro kultivovaného panelu osmi různých PCR- ribotypů (RT). Cílem této práce je sledovat vztah mezi sekrecí jednotlivých proteinů spojených s výstavbou a funkcí bičíků u kmenů C. difficile s variabilní virulencí. Metoda: V rámci našeho výzkumu byla preferovanou formou zkoumání kombinace shotgun proteomiky a label free quantification (LFQ). Výsledky: Ze zkoumaných proteinů bylo 17 významně zvýšeno ve funkčních anotacích. Mezi nimi bylo identifikováno několik známých faktorů souvisejících s virulencí, jako jsou proteiny spojené s výstavbou bičíků a dalších funkcí. Vyšší sekrece vybraných bičíkových proteinů jasně odlišila RT 027, 176, 005 a 012, což potvrdilo jejich patogenní roli v CDI. Závěr: Výsledkem této práce byla různá pozorování u různých kmenů se zvýšeným potenciálem...
|
|
|
Hodnocení efektivity vybraných metodických přístupů za účelem disagregace stafylokokové biofilmové biomasy
Nosková, Martina ; Konečná, Klára (vedoucí práce) ; Jílek, Petr (oponent)
Univerzita Karlova Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra biologických a lékařských věd Studijní obor: Bioanalytická laboratorní diagnostika ve zdravotnictví Autor: Bc. Martina Nosková Školitel: RNDr. Klára Konečná, Ph.D. Název diplomové práce: Hodnocení efektivity vybraných metodických přístupů za účelem disagregace stafylokokové biofilmové biomasy Cíl práce: Odhalit vliv vybraných biochemických a fyzikálních vlivů na disagregaci biofilmového společenství tvořeného bakterií Staphylococcus aureus. Pro biochemický přístup byl zvolen enzym proteinasa K, v rámci fyzikálních vlivů byl studován dopad sonikace, třepání s/bez skleněných kuliček. Metody: Stafylokokový biofilm byl formován in vitro, ve dvou metodických uspořádáních - v rámci jamek mikrotitrační destičky a na kolíčcích (analogie Calgary Biofilm Device). Pro hodnocení míry konzistence získaných dat, odrážejících homogenitu odloučených biofilmových biomas byla volena "recovery" metoda a metoda detekce metabolické aktivity pomocí indikátoru Alamar Blue. Pro vyjádření míry účinnosti volených přístupů na celkovou disagregaci biofilmového společenství byla volena metoda kvantifikace biofilmové biomasy barvením krystalovou violetí. Výsledky: V případě biochemického přístupu (enzym proteinasa K) byl prokázán statisticky významný vliv na...
|
|
| |
|
|
Testování antifungální aktivity nově syntetizovaných látek
Bláhová, Lenka ; Voxová, Barbora (vedoucí práce) ; Konečná, Klára (oponent)
Univerzita Karlova Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra biologických a lékařských věd Lenka Bláhová Školitel: PharmDr. Barbora Voxová Název diplomové práce: Testování antifungální aktivity nově syntetizovaných látek Anglický název diplomové práce: Evaluation of antifungal activity of newly synthesized compounds Cíl diplomové práce Cílem diplomové práce bylo otestovat nové molekuly na antifungální aktivitu. Celkem se testovalo 28 látek přírodního původu z katedry Farmaceutické botaniky Farmaceutické fakulty UK. Byla testována citlivost k potencionálně antifungálním látkám u 8 kmenů mikromycet, konkrétně u Candida albicans, Candida krusei, Candida parapsolosis, Candida tropicalis, Aspergillus fumigatus, Aspergillus flavus, Absidia corymbifera, Trichophyton interdigitale. Metody Molekuly byly testovány pomocí mikrodiluční bujónové metody. Výsledky Testům pro průkaz antimykotického účinku bylo podrobeno 28 nově systetizovaných látek. Jako nadějných pro další testování se ukázalo 11 z nich. U 5 molekul byla stanovena antifungální aktivita vůči všem testovacím mikromycetám a 6 molekul prokázalo antifungální aktivitu vůči alespoň jedné mikromycetě. Závěr Molekulová struktura účinných a neúčinných látek se liší v substituci benzenového jádra. V případě, že substituentem je etherická skupina,...
|
|
|
Hodnocení efektivity vybraných metodických přístupů za účelem disagregace stafylokokové biofilmové biomasy
Nosková, Martina ; Konečná, Klára (vedoucí práce) ; Jílek, Petr (oponent)
Univerzita Karlova Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra biologických a lékařských věd Studijní obor: Bioanalytická laboratorní diagnostika ve zdravotnictví Autor: Bc. Martina Nosková Školitel: RNDr. Klára Konečná, Ph.D. Název diplomové práce: Hodnocení efektivity vybraných metodických přístupů za účelem disagregace stafylokokové biofilmové biomasy Cíl práce: Odhalit vliv vybraných biochemických a fyzikálních vlivů na disagregaci biofilmového společenství tvořeného bakterií Staphylococcus aureus. Pro biochemický přístup byl zvolen enzym proteinasa K, v rámci fyzikálních vlivů byl studován dopad sonikace, třepání s/bez skleněných kuliček. Metody: Stafylokokový biofilm byl formován in vitro, ve dvou metodických uspořádáních - v rámci jamek mikrotitrační destičky a na kolíčcích (analogie Calgary Biofilm Device). Pro hodnocení míry konzistence získaných dat, odrážejících homogenitu odloučených biofilmových biomas byla volena "recovery" metoda a metoda detekce metabolické aktivity pomocí indikátoru Alamar Blue. Pro vyjádření míry účinnosti volených přístupů na celkovou disagregaci biofilmového společenství byla volena metoda kvantifikace biofilmové biomasy barvením krystalovou violetí. Výsledky: V případě biochemického přístupu (enzym proteinasa K) byl prokázán statisticky významný vliv na...
|
|
|
Zavedení bezobratlého zvířecího modelu, Galleria mellonella, pro studium účinnosti in vivo, stávajících a nově syntetizovaných, kandidátních antituberkulotik
Kubíček, Jiří ; Konečná, Klára (vedoucí práce) ; Němečková, Ivana (oponent)
Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra biologických a lékařských věd Studijní obor: Farmacie Autor: Jiří Kubíček Vedoucí práce: RNDr. Klára Konečná, Ph.D. Název diplomové práce: Zavedení bezobratlého zvířecího modelu, Galleria mellonella, pro studium účinnosti in vivo, stávajících a nově syntetizovaných, kandidátních antituberkulotik. Cíl práce: Cílem této diplomové práce bylo představit bezobratlý organismus, Galleria mellonella (G. mellonella), Pyralidae, jakožto alternativní, ekonomicky výhodnější a morálně lépe akceptovatelný model pro studie účinnosti antituberkulotických látek in vivo. V experimentální části této práce byla úvodem věnována pozornost optimalizaci metodických kroků, které by měly vést k vyšší reprodukovatelnosti a validitě získaných dat. Byl hodnocen vliv disagregačního suplementu, tyloxapolu, na růst bakterie Mycobacterium aurum (M. aurum). Byl rovněž mapován růst tohoto mikrobiálního kmene v kultivačním médiu, Middlebrook 7H9, za účelem určit exponenciální fázi růstu. V rámci druhé části experimentů byla provedena infekce larev G. mellonella bakteriálním kmenem M. aurum, s následnou administrací vybraných, komerčně dostupných antituberkulotik (anti-TB). Metody: Pro mapování exponenciální fáze růstu bakterie M. aurum byla provedena kultivace...
|
|
|
Nové sloučeniny působící na methicilin-rezistentní stafylokoky a vankomycin-rezistentní enterokoky (rešerše)
Pokorná, Anežka ; Krátký, Martin (vedoucí práce) ; Konečná, Klára (oponent)
Tématem bakalářské práce jsou sloučeniny působící na methicilin-rezistentní stafylokoky a vankomycin-rezistentní enterokoky. Popisuje v přehledu vhodná zavedená či nově používaná antibiotika, která jsou účinná v boji s rezistentními kmeny, ale také nové potenciálně využitelné sloučeniny. Teoretická část obsahuje informace o jednotlivých kmenech, jejich charakteristiky, laboratorní diagnostiku a přehled onemocnění, která způsobují, dále jsou zde informace o mechanismech rezistence vůči stávajícím antibiotikům. Znalost těchto mechanismů je důležitá pro následnou syntézu nových léčiv. Druhá část obsahuje již samotná léčiva a slibné sloučeniny ve vývoji, které jsou vhodné na jednotlivé kmeny. Práce pojednává jak o již zavedených sloučeninách, tak o potenciálních sloučeninách v různé fázi vývoje. Klíčová slova Antibiotika, biofilm, deriváty přírodního původu, methicilin, methicilin-rezistentní stafylokoky, nové sloučeniny, rezistence, vankomycin, vankomycin-rezistentní enterokoky
|
|
|
Detekce protilátek reagujících s F. tularensis v časné fázi infekce
Straková, Kristina ; Konečná, Klára (vedoucí práce) ; Janovská, Sylva (oponent)
Kristina Straková Detekce protilátek reagujících s F. tularensis v časné fázi infekce Diplomová práce Univerzita Karlova v Praze, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové studijní obor farmacie Na základě vysoké virulence a mortality se Francisella tularensis řadí mezi vojensky a teroristicky zneužitelná etiologická agens a proto je vhodným předmětem základního výzkumu. Problematika protilátkové odpovědi organismu na infekci intracelulárních patogenů v současné době nabývá na významu. Názory a výsledky vědeckých skupin nejsou jednotné a jedná se tedy o aktuální téma. Cílem naší práce bylo zjistit, zda je F. tularensis schopná vyvolat protilátkovou odpověď již velmi časně po infekci a to do 48 hodin. Testován byl virulentní kmen F. tularensis. Zároveň jsme chtěli ověřit, zda je námi použitá metodika vhodně zvolená a poskytuje dostatečně reprodukovatelné výsledky. Metody: Připravili jsme celobuněčný lyzát F. tularensis holarctica FSC200, který jsme podrobili separaci pomocí 2D elektroforézy. Po Western blotu následovala imunodetekce s použitím sér myší BALB/c odebraných 24 a 48 hodin po infekci a kontrolních sér myší, které nebyly infikovány. Srovnávací analýzou jsme hledali proteiny, které reagují pouze s imunizovanými séry a nikoli s kontrolní skupinou. Výsledky: Realizovali jsme šest nezávislých...
|
host ::
RSS.