|
|
Promyelocytic leukemia protein function in normal, tumor and senescent human cells
Rossmeislová, Lenka ; Hozák, Pavel (vedoucí práce) ; Forstová, Jitka (oponent) ; Anděra, Ladislav (oponent)
Protein promyelocytární leukémie (PML) gen kóduje jaderný protein lokalizovaný do nukleoplasmy. PML je nyní považováno za gen s tumor-supresivními vlastnostmi, protože je funkčně propojen s mnoha funkcemi, ovlivňujících jadernou buněčnou proliferaci, apoptózu a stárnutí. Předkládaná práce je součástí širšího projektu, jehož cílem je objasnit regulaci exprese promyelocytární leukémie proteinů a zkoumá roli PML bílkovin v buněčné stárnutí. Konkrétní cíle PhD. projektu bylo vyhodnocení nových in vitro modelů pro studium PML, objasnění vlivu inhibitorů histon deacetyláz PML na expresi genů.
|
|
|
Apoptóza nádorových buněk: role TRAILu a kaspásy 10
Truxová, Iva ; Živný, Jan (vedoucí práce) ; Anděra, Ladislav (oponent)
Jednou z klíčových vlastností nádorových buněk je schopnost uniknout programované buněčné smrti (apoptóze). V mnoha typech nádorových buněk byly nalezeny somatické mutace proapoptotických genů, které deregulují (inaktivují) apoptózu. Kaspáza 10 je iniciátorová kaspáza, jejíž fyziologická funkce není stále dobře prozkoumána. Také její schopnost nahradit kaspázu 8 v apoptotické signalizaci indukované receptory smrti zůstává kontroverzní. Ovšem některé nalezené mutace v CASP10 genu, které byly spojeny s defekty v apoptóze (79, 81), napovídají, že i tato kaspáza by mohla být klíčová pro iniciaci apoptózy. V naší laboratoři byla u Jurkat (lidská T-buněčná akutní lymfoblastická leukémie) klonu rezistentního na TRAIL - J-TR1 nalezena heterozygotní mutace v CASP10 genu, která ovlivňuje aminokyselinové složení poblíž aktivního místa enzymu. Cílem této práce bylo potvrdit mutaci ARMS-PCR a zjistit, zda bude nadprodukce normální (nemutované) resp. mutované kaspázy 10 D v TRAIL senzitivních resp. TRAIL rezistentních Jurkat buňkách (J-WT resp. J-TR1) ovlivňovat apoptózu indukovanou TRAILem. Mutace byla potvrzena. Byly vypěstovány stabilní klony J-WT resp. J-TR1 buněk transfekované expresním vektorem s vloženou nemutovanou resp. mutovanou CASP10 D (CASP10 D WT resp. MUT). Nadprodukce mutované kaspázy 10 D v J-WT klonech...
|
|
|
Canonical and non-canonical signalling triggered by activated TRAIL receptors in human cells
Nahácka, Zuzana ; Anděra, Ladislav (vedoucí práce) ; Rudolf, Emil (oponent) ; Vondráček, Jan (oponent)
TRAIL ligand spouští apoptózu interakcí se svými dvěma pro-apoptotickými receptory TRAIL- R1 (DR4) a TRAIL-R2 (DR5). Jeho schopnost indukovat apoptózu nezávisle na statusu p53 a selektivně zabíjet rakovinné buňky in vitro a in vivo zapříčinila, že tento ligand patřící do rodiny cytokinů TNF se jevil atraktivním cílem výzkumu terapie nádorových onemocnění. Avšak rezistence mnoha primárních nádorových buněk, neuspokojivý výsledek klinických testů a nedávné studie, které ukazují protichůdné výsledky a to konkrétně, že TRAIL může za specifických podmínek podporovat místo toho, aby inhiboval progresi nádorů, vyvolaly v oblasti výzkumu signalizace indukované ligandem TRAIL nové množství otázek, které je potřeba zodpovědet. Ačkoliv jsou oba receptory DR4 a DR5 rovnoměrne exprimovány, různé typy nádorů vykazují preferenci pro jeden nebo druhý z receptorů. Relativní účast signalizace DR4 a DR5 indukované TRAIL ligandem je málo známá. Abychom analyzovali signalizaci ligandu TRAIL specifickou pro jednotlivé receptory, připravili jsme trimerizované varianty rekombinantního lidského ligandu TRAIL, značené pomocí Strep-tag, s vysokou afinitou pro receptory DR4 nebo DR5. Zjistila jsem, že narozdíl od pankreatických rakovinových buňek PANC-1 rezistentních k apoptóze indukované ligandem TRAIL, probíhá tvorba...
|
|
|
Molekulární a funkční charakterizace receptoru DR 6
Klíma, Martin ; Anděra, Ladislav (vedoucí práce) ; Živný, Jan (oponent) ; Kovář, Marek (oponent)
Receptor DR6 ("receptor smrti-6", TNFRsf21/CD358) je členem rodiny TNFR, který se pravěpodobně účastní regulace proliferace a diferenciace T- a B-lymfocytů a neurálních buněk. Lidský DR6 je 655 aminokyselin dlouhý transmembránový protein typu I, který obsahuje čtyři domény CRD ve své extracelulární části a po jedné doméně DD a CARD v části cytoplazmatické. Nadprodukce DR6 v některých nádorových buňkách vede k apoptóze, a/nebo aktivaci transkripčního faktoru NF-κB a kináz rodiny JNK. V první naší práci jsme se věnovali charakterizaci molekulárních vlastností receptoru DR6 včetně analýzy jeho posttranslačních modifikací. Zjistili jsme, že DR6 je extenzivně modifikovaný protein a jeho posttranslační modifikace zahrnují S-palmitylaci a jak N-, tak i O-glykosylaci. Šest N- glykosylačních a jedno S-palmitylační místo jsme zamapovali do příslušných aminokyselinových zbytků. Spojovací část mezi doménami CRD v extracelulární části DR6 a jeho transmembránovou doménou, která obsahuje oblast bohatou na serin, threonin a prolin se seskupenými predikovanými O-glykosylačními místy, je nezbytná pro transport DR6 na plazmatickou membránu. N-glyko- sylace, ale překvapivě nikoli S-palmitylace, může hrát roli ve směřování DR6 do lipidových raftů. V další části této práce jsme shrnuli výsledky studie analyzující regulaci...
|
|
|
Úloha mitochondriální dráhy v indukci apoptózy taxany u buněk nádorů prsu
Schmiedlová, Martina ; Kovář, Jan (vedoucí práce) ; Anděra, Ladislav (oponent)
Apoptóza je jedním z mechanismů programované buněčné smrti, ke které dochází u nádorových buněk prsu po aplikaci taxanů. K její indukci může principielně docházet buď vnější nebo vnitřní dráhou. Diplomová práce má za cíl přispět k objasnění úlohy a mechanismů vnitřní mitochondriální dráhy indukce apoptózy po aplikaci taxanů (paclitaxel a SB-T-1216) na modelu buněčných linií karcinomu prsu SK-BR-3 (nefunkční protein p53, funkční kaspáza 3) a MCF-7 (funkční protein p53, nefunkční kaspáza 3). Konkrétně jsme sledovali vliv obou testovaných taxanů na mitochondriální membránový potenciál, hladinu ROS, expresi a lokalizaci proteinů regulujících vnitřní mitochondriální dráhu. U buněčné linie SK-BR-3 vedla aplikace obou taxanů k zhroucení mitochondriálního membránového potenciálu, avšak ne u buněčné linie MCF-7. Zjistili jsme, že se po aplikaci obou taxanů nemění exprese proteinu Bax a ani Smac/DIABLO u obou testovaných linií. U linie SK-BR-3 došlo na rozdíl od linie MCF-7 po aplikaci taxanů k poklesu exprese proteinu Bid. Po aplikaci taxanů nedošlo k translokaci proteinů Bax a Bid (tBid) z cytosolu na mitochondrie ani u jedné z testovaných linií. Nezjistili jsme také uvolňování proteinu Smac/DIABLO z mitochondrií do cytosolu. U buněčné linie SK-BR-3 jsme však pozorovali po aplikaci taxanů uvolňování...
|
|
|
Buněčnou smrt regulující microRNA a jejich role ve vývoji a patologickych procesech.
Běhounek, Matěj ; Anděra, Ladislav (vedoucí práce) ; Seifertová, Eva (oponent)
MikroRNA jsou malé protein nekódující dsRNA dlouhé ~22 nukleotidů. Jejich hlavní úlohou je potlačovat genovou expresi pomocí odstranění/destabilizace mRNA či její degradace. Tyto malé RNA hrají významnou roli v regulaci mnoha buněčných procesů a bylo zjištěno, že ovlivňují expresi více než 30 % lidských genů. Mezi procesy, na které mají vliv, patří i programovaná buněčná smrt. Třebaže je tato práce zaměřena zejména na analýzu a charakterizaci role miRNA v regulaci apoptotické buněčné smrti, miRNA se mohou účastnit regulace i autofagické buněčné smrti či programované nekrózy. MiRNA mohou zvyšovat citlivost buněk k apoptóze potlačením exprese genů receptorů smrti, ale mohou také působit přímo pro-apoptoticky regulací exprese např. anti- apoptotického proteinu Bcl-2. V mnoha různých organismech jsou popsány tisíce miRNA a desítky z nich se účastní regulace buněčné smrti. Špatná, či narušená funkce miRNA, a s tím související změna signálů v apoptóze, vede k mnoha patologickým procesům, například k tumorigenezi či špatnému vývoji a homeostázi tkání. Pochopení, jak miRNA funguje v buněčné smrti, a případná praktická aplikace těchto znalostí by mohlo vést k významnému pokroku v léčení rakoviny, infarktu myokardu nebo jiných patalogických stavů.
|
|
|
Charakterizace vlivu senescence na indukci a regulaci smrti nádorových buněk
Nováková, Gita ; Anděra, Ladislav (vedoucí práce) ; Truksa, Jaroslav (oponent)
5 Abstrakt Senescence je stav, kdy se bu ka p estane d lit, m ní expresi n kterých gen a je trvale zastavena v ur ité fázi bun ného cyklu. Nenádorové bu ky vystupují z cyklu po ur itém po tu bun ných d lení, nebo jsou-li poškozeny natolik, že jejich další d lení již není žádoucí. U nádorových bun k m že být senescence indukována podprahovým stresem nap . subletálními dávkami chemoterapeutik. Nádorové bu ky tak neumírají, ale z stávají v tkáni a m ní sv j fenotyp na fenotyp charakteristický sekrecí faktor , které tká dále ovliv ují. Stav senescence tedy m že m nit odpov nádorových bun k na lé bu pomocí apoptózu indukujících terapeutik. V této práci jsme se sout edili na analýzu rozdíl v apoptotické signalizaci mezi proliferujícími a senescentními nádorovými bu kami indukované r znými proapoptotickými látkami. Pomocí bromodeoxyuridinu (BrdU) jsme u nádorových pankreatických (PANC-1) a mesoteliálních (H28) bun k indukovali replika ní stres, jehož vlivem se bu ky p estaly d lit a získaly fenotyp senescentních bun k. U t chto bun k jsme pozorovali zvýšenou rezistenci v i apoptóze indukované ligandem TRAILem v kombinaci s homoharringtoninem (HHT) a zvýšenou senzitivitu senescentních bun k v i Fas ligandu, camptothecinu a mVESu. Tyto bu ky take vykazovaly zvýšenou expresi antiapoptotického proteinu c-FLIP a zm ny...
|
|
|
TRAIL-induced Apoptosis in Populations of Colon Cancer Cell Lines under Various Cultivation Conditions
Nevařil, Leonard ; Anděra, Ladislav (vedoucí práce) ; Neužil, Jiří (oponent)
Tumor Necrosis Factor-Related Apoptosis Inducing Ligand (TRAIL) is a cytokine of TNF family, which participates in the non-exclusive regulation of survival and proliferation of mainly hematopoietic cells. Shortly after its discovery it also brought significant attention as specific and potent inducer of apoptosis of cancer cells of various origins, and since then it has been investigated as a potential novel anti-tumor therapeutics. Recently, cancer stem cells (CSCs) were suggested to be a distinct subset of tumor cells that could be responsible at least in some tumors for their sustainment, recurrence and drug resistance. These cells in the "hierarchic" model of tumorigenesis thus represent an important and attractive target for efficient tumor therapy. In this study we use several colorectal adenocarcinoma cell lines as an experimental model for the analysis of CSC-prone cultivation conditions on TRAIL-induced apoptosis of these cells. For enrichment of eventual cancer stem cells we cultivated cell lines in a serum-free medium, originally developed for cultivation of neural stem cells, and assessed the expression of putative CSC markers CD133 and ABCG2 by flow cytometry (FACS). Simultaneously, we tested the expression of TRAIL receptors and susceptibility to TRAIL-induced apoptosis in these cells. We...
|
|
|
Analýza buněčné signalizace zprostředkované adaptérovým proteinem Daxx
Švadlenka, Jan ; Anděra, Ladislav (vedoucí práce) ; Forstová, Jitka (oponent) ; Stopka, Tomáš (oponent)
1 Abstrakt Multifunkční protein Daxx se jako adaptér či histonový chaperon podílí na značném množství buněčných pochodů zahrnujících regulaci apoptotické či stresové signalizace, antivirové odpovědi, transkripce a dalších pochodů spojených s chromatinem. Procesy, které souvisejí s chromatinem, Daxx ovlivňuje pomocí své interakce s DNA-metyltrans- ferázou-1, histondeacetylázami a s ATPázou remodelující chromatin ATRX. V kom- plexu s ní Daxx působí jakožto histonový chaperon pro histon-3.3, důležitý pro udržo- vání konstitutivního heterochromatinu například v oblasti centromer a telomer. Hlavním cílem této dizertační práce byla hlubší analýza buněčných funkcí proteinu Daxx za pomoci identifikace a funkční charakterizace nových proteinů, které s ním in- teragují. K jejich vyhledání byl použit kvasinkový dvojhybridní systém a výsledkem byla identifikace několika nových interagujících proteinů, převážně jaderných a spoje- ných zejména s regulací chromatinu. Detailněji byla analyzována interakce proteinu Daxx s ATPázou remodelující chromatin Brg1. Ta byla potvrzena jak in vitro, tak i v ži- vých buňkách, kde spolu oba proteiny nejvíce asociovaly v komplexech s vyšší relativní molekulovou hmotností. Tyto předpokládané remodelační komplexy obsahovaly vedle Brg1 i další s ním asociované faktory (BAF)....
|
|
|
The analysis of cancer invasion plasticity in a 3D environment
Škarková, Aneta ; Brábek, Jan (vedoucí práce) ; Anděra, Ladislav (oponent) ; Bryja, Vítězslav (oponent)
iv Abstrakt Buňky si vyvinuly řadu mechanismů buněčného pohybu, od přesunu velkých buněčných kohort po specializovanou migraci jednotlivých buněk. Tuto širokou škálu invazivních fenotypů využily nádorové buňky ve svůj prospěch, čímž učinily metastatický proces těžko porazitelným. Pro lepší porozumění plasticitě invazivity nádorových buněk jsme studovali buňky využívající protáhlý, mesenchymální způsob migrace, který je závislý na proteolýze a adhezi, a buňky využívající kulatý, na proteázách a adhezivitě nezávislý améboidní pohyb i buňky využívající kombinaci obou. Pro přímé studium plasticity invazivity jsme zavedli dva modelové systémy mezenchymálně-améboidního přechodu (MAT), které umožňují regulovanou indukci MAT v 3D prostředí in vitro. S využitím těchto systémů jsme indukovali MAT v buňkách fibrosarkomové linie HT1080 a zároveň potvrdili přechod na funkční, invazivní améboidní fenotyp. Pomocí digitálního holografického mikroskopu jsme detailněji popsali mesenchymální i améboidní pohyb v 3D kolagenu. Dále jsme provedli proteomickou a transkriptomickou srovnávací analýzu HT1080 před a po MAT. Porovnání genové exprese a hladin proteinů v mezenchymálních a améboidních buňkách odhalilo aktivaci signalizace spojené se zánětem u améboidních buněk. Abychom toto zjištění potvrdili, testovali jsme účinek...
|
host ::
RSS.