|
|
Studium post translačních modifikací fosducinu
Šimůnek, Jiří ; Obšil, Tomáš (vedoucí práce) ; Alblová, Miroslava (oponent)
Předkládaná diplomová práce se zabývá studiem úlohy posttranslačních modifikací fosducinu na jeho interakci s proteinem 14-3-3 a dále posouzení vlivu tvorby komplexu na tyto modifikace. Fosducin je 33kDa protein nacházející se ve fotoreceptorových buňkách sítnice, ale také v jiných tkáních. Přes mnohé experimenty jsou však jeho fyziologické funkce stále řešeným tématem. Spekuluje se o jeho vlivu při regulaci signální dráhy oční sítnice, krevního tlaku a exprese G-proteinů. Funkce fosducinu je regulována proteinem 14-3-3, jenž hraje roli v mnohých biochemických procesech. Tvorba komplexu mezi proteinem 14-3-3 a fosducinem vyžaduje fosforylaci dvou serinových zbytků v N-terminální doméně molekuly fosducinu. Úloha vazby proteinu 14-3-3 v regulaci funkce fosducinu je ovšem stále nejasná. V rámci této diplomové práce byly exprimovány proteiny 14-3-3ζ∆C a fosducin (s mutací Q52K) a úspěšně purifikovány. Ke studiu vlivu tvorby komplexu na posttranslační modifikace fosducinu bylo využito limitované proteolýzy a defosforylace. Experimenty ukázaly, že tvorba komplexu způsobuje významné zpomalení defosforylace Ser-54 i Ser-73 a proteolytické degradace, což indikuje protektivní funkci vazby proteinu 14-3-3ζ∆C. Úloha obou 14-3-3ζ∆C vazebných motivů obsahujících Ser-54 a Ser-73 pro interakci fosducinu s...
|
|
|
Studium interakce fosducinu s proteinem 14-3-3
Šimůnek, Jiří ; Obšil, Tomáš (vedoucí práce) ; Alblová, Miroslava (oponent)
Tato bakalářská práce se zabývá interakcí proteinu 14-3-3 a fosducinu, které se podílejí na regulaci přenosu signálu v oční sítnici obratlovců. Tento přenos a zároveň i zesílení signálu jsou zprostředkovány G-proteinovou signální dráhou. Přenos signálu v závislosti na intenzitě světla je regulován dalšími proteiny včetně fosducinu. Fosducin je 33kDa protein, který je exprimován v mnoha tkáních, především ve fotoreceptorových buňkách oční sítnice. Jeho regulační funkce spočívá v inhibici funkce G-proteinu (transducinu). Při přenosu signálu je nutný rozpad transducinu Gtαβγ na podjednotku α (Gtα) a komplex βγ (Gtβγ). Pro opětovnou funkci je nutná reasociace heterotrimeru Gtαβγ, čemuž zabraňuje fosducin, a to vazbou na komplex Gtβγ. Nepřítomnost kompletního transducinu má za následek přerušení signální dráhy a snížení přenosu signálu. Při slabém osvětlení je nutné přenášený signál zesílit, a proto je v sítnici adaptované na tmu fosducin fosforylován, což rozruší jeho vazbu s Gtβγ podjednotkou a obnoví funkci transducinu. Fosforylovaný fosducin je vázán proteinem 14-3-3. Úloha proteinu 14-3-3 v regulaci funkce fosducinu je však stále nejasná. Protein 14-3-3 je 28 kDa protein, který je exprimován ve všech eukaryotických buňkách. Jedná se o protein s rigidní strukturou, který váže a reguluje funkce více...
|
|
|
Role of Magnetosheath Parameters on Magnetopause Processes
Tkachenko, Oksana ; Šafránková, Jana (vedoucí práce) ; Kulhánek, Petr (oponent) ; Šimůnek, Jiří (oponent)
Název práce: Vliv parametrů přechodové oblasti na procesy na magnetopauze Autor: Oksana Tkachenko Katedra: Katedra fyziky povrchů a plazmatu Vedoucí disertační práce: Prof. RNDr. Jana Šafránková, DrSc. e-mail address: Jana.Safrankova@mff.cuni.cz Abstrakt: Předkládaná dizertační práce je zaměřena na dvě oblasti, jež jsou důležité pro interakci slunečního větru s zemskou magnetosférou: kasp ve vysokých geomagnetických šířkách a subsolární magnetopauza v nízkých šířkách. Průnik slunečního plazmatu do zemské magnetosféry může probíhat podél kaspů. Oblast přilehlá k magnetopauze v blízkosti kaspu je velmi turbu- lentní, vyplněná horkým plazmatem z přechodové oblasti s nízkou driftovou rychlostí. V první části dizertační práce se proto věnujeme detailnímu rozboru vírové struktury ve vhloubení magnetopauzy nad kaspem za použití dat družic Interball-1 a Magion-4. Popsali jsme nezbytné podmínky a možný mechanismus vzniku této struktury. Druhá část práce se týká for- mování a prostorové struktuře hraniční vrstvy nízkých šířek (Low-latitude Boundary Layer, dále LLBL) a jejím časovým změnám. Ačkoliv LLBL hraje klíčovou roli v přenosu hmoty, hybnosti a energie ze slunečního větru do magnetosféry,...
|
|
|
Magnetopause: location,shape and structure
Dušík, Štefan ; Šafránková, Jana (vedoucí práce) ; Kulhánek, Petr (oponent) ; Šimůnek, Jiří (oponent)
Pre štúdium interakcie slnečný vietor-magnetosféra je magnetopauza kľúčovou oblasťou. Predpovede jej polohy a znalosť jej štruktúry za širokého rozsahu parametrov sln. vetra je dôležitá pre ďalší pokrok v tejto oblasti. Predkladaná práca sa zaoberá štatistickou štúdiou polohy magnetopauzy ako aj štúdiom jednotlivých prípadov štruktúry magnetopauzy a LLBL. Na základe simultánnych meraní družíc Themis, Geotail, Interball a Magion sme spracovali štúdiu možných zdrojov odchýliek od modelov magnetopauzy vo vysokých aj nízkych geomagnetických šírkach. Zistili sme výraznú deformáciu povrchu magnetopauzy v oblasti kaspu vo vysokých geom. šírkach a závislosť polohy subsolárnej magnetopauzy na "cone" uhle medzipl. magn. poľa. Analýza jednotlivých udalostí prechodu LLBL za použitia tzv. n-T plotov priniesla nové výsledky spojené s mechanizmom formovania LLBL. Zistili sme, že počas severne orientovaného medzipl. magn. poľa, prepojenie siločiar za kaspom vytvorí vonkajšiu podvrstvu LLBL, kým za južnej orientácie poľa táto podvrstva vymizne.
|
|
|
Systémový přístup ke spokojenosti a věrnosti zákazníků ve vybrané firmě
Šimůnek, Jiří ; Krejčí, Igor (vedoucí práce) ; Horáková, Tereza (oponent)
Bakalářská práce se věnuje aplikaci systémové dynamiky v oblasti věrnosti a spokojenosti zákazníků vůči firmě Florbal.com.
V teoretické části je stručně popsána historie systémové dynamiky, její vývoj a samotná definice systémové dynamiky. Dále je teoretická část zaměřena na změnu lineárního myšlení na nelineární, neboli systémové a na popis a význam mentálních modelů.
Popsána je i tvorba příčinně smyčkového diagramu a diagramu stavů a toků, rozdíly mezi oběma diagramy a jejich výhody a nevýhody.
V praktické části je samotná tvorba modelu v softwaru Vensim PLE, kde byl nejprve vytvořen příčinně smyčkový diagram, který nastíní, jak by mohl vypadat diagram stavů a toků, také odhalí zpětnovazební smyčky a jejich působení na model. Dále tvorba diagramu stavů a toků doplněného o matematický aparát, vytvoření několika politik. Dalším krokem je spuštění simulací pro jednotlivé politiky. Zakončení praktické části spočívá v interpretaci výsledků a doporučení nejvhodnější politiky.
|
|
|
Právo stavby a věcná břemena - účetní, daňový a právní pohled
Šimůnek, Jiří ; Molín, Jan (vedoucí práce) ; Müllerová, Libuše (oponent)
Tato diplomová práce se zabývá právními, účetními a daňovými konsekvencemi práva stavby a věcných břemen podle právního řádu České republiky. Popis právních souvislostí obou institutů je zaměřen na tuzemský vývoj, stejně jako na historický exkurz do jurisdikcí jiných států a evidenci v katastru nemovitostí. Dále je rozebrán přístup české účetní legislativy a také mezinárodních účetních standardů IAS/IFRS k vykazování práva stavby a věcných břemen. Tato část se soustředí zejména na zachycení práva stavby v rozvaze účetní jednotky s přihlédnutím ke změně mezi roky 2014 a 2015 a na způsob vykázání práva stavy ve standardech IAS/IFRS. Daňová kapitola se zabývá zdaněním rozebíraných institutů daněmi z příjmů, daní z přidané hodnoty, daní z nabytí nemovitých věcí podle českého daňového práva včetně daňového zatížení spojeného s děděním a darováním.
|
|
| |
|
| |
|
|
Sources of the cusp plasma for the different sign of IMF By
Šimůnek, Jiří ; Šafránková, J. ; Němeček, Z. ; Wing, S.
The importance of the interplanetary magnetic field (IMF) direction for the cusp formation was dicovered a long time ago. A sign of the IMF Bz component is believed to be responsible for a location of the plasma entry into the cusp. The paper uses the INTERBALL-1 and MAGION-4 data to study the high-altitude cusp topology for different IMF By orientations. The study reveals the importance of IMF horizontal components on the cusp configuration as well as on small-scale processes at the outer cusp. We discuss an influence of the tilt angle of the Earth's dipole on these processes.
|
|
|
Response of the outer cusp to the IMF rotation
Šimůnek, Jiří ; Šafránková, J. ; Němeček, Z.
The paper uses the INTERBALL-1 and MAGION=4 data to study the topology and dynamics of high-altitude cusp regions under changing solar wind conditions and interplanetary magnetic field (IMF) orientation. Preliminary analysis of the MAGION-4 ion energy spectra indicates the presence of the magnetosheath-like plasma well below the expected magnetopause position and a large region occupied by low-temperature dense plasma with the very low bulk velocity near the magnetopause.
|
host ::
RSS.