|
|
Komparace dat fyziologických parametrů generovaných přístrojem Metalyzer 3B v laboratoři s přístrojem Metamax 3B pro použití v terénním výzkumu
Kříž, Tomáš ; Nohel, Michal (oponent) ; Chlíbková, Daniela (vedoucí práce)
Se stále větším tlakem na kvalitu sportovních výkonu narůstá potřeba sportovců získávat data pro svůj trénink v podmínkách přirozených pro jejich disciplínu. Tím vzniká tlak na výrobce různých diagnostických zařízení, aby své produkty vyráběli nejen pro měření v laboratořích, ale i ve venkovním prostředí. To s sebou nese nutnost zařízení co nejvíce miniaturizovat, snižovat jejich váhu a celkově je přizpůsobit tak, aby sportovce při výkonu nijak neomezovala. Otázkou zůstává, zda nebudou tyto nezbytné úpravy snižovat přesnost měření. Je skutečně výhodnější upřednostnit přirozené prostředí pro daný sport před přesnými výsledky získanými z laboratoře? Cílem této bakalářské práce bylo zjistit rozdíly v naměřených fyziologických parametrech dvou rozdílných přístrojů při použití stejného zátěžového protokolu. Jeden z testů probíhal v laboratoři s nepřenosným přístrojem Metalyzer 3B a druhý ve venkovním prostředí s přenosným analyzátorem plynů Metamax 3B. Oba přístroje používané v práci jsou od firmy Cortex. Teoretická část představuje přístroje pro měření výměny plynů od různých výrobců a přestavuje různé způsoby stanovení VO2max. Praktická část zahrnuje změření sledovaných parametrů na obou přístrojích při identickém testovém protokolu. Bylo využito statistických testu (T-test) ke zjištění, zda se výsledky měření u různých parametrů přístrojem Metamax 3B významně odlišují od dat naměřených laboratorním přístrojem Metalyzer 3B. Výsledky statistických testů (V'O2 p = 0,54 ; V'CO2 p = 0,087; SF p = 0,49; V'E p = 0,2; DF p = 0,28; čas p = 0,59) na hladině významnosti = 0,05.
|
|
|
Validita přístroje VO2 Master Pro pro predikci maximální spotřeby kyslíku a měření klidového metabolismu
Goldschmidt, Tobiáš ; Nohel, Michal (oponent) ; Chlíbková, Daniela (vedoucí práce)
Meranie maximálnej spotreby kyslíku a kľudového metabolizmu sú jedným zo základných stavebných kameňov v testovaní športovcov a medicínskych pacientov. Na toto meranie sa využívajú analyzátory dýchacích plynov. Tieto analyzátory sú väčšinou neprenosné nálkadné zariadenia. VO2 Master Pro je na druhej strane prenosný prístroj s rádovo nižšou cenou. Jeho nevýhodou je však že obshuje len O2 senzor a nie aj CO2 senzor narozdiel od prístrojov chápané ako medicínsky štandard. Cieľom tejto práce bolo stanoviť validitu a odchýlku prístroja VO2 Master Pro pre meranie maximálnej spotreby kyslíku a kľudového metabolizmu. Odchýlka pre meranie maximálnej spotreby kyslíku bola 4,15 ± 4,41 %. Pre meranie kľudového metabolizmu bola odchýlka 41,20 ± 11,44 %. Pre meranie maximálnej spotreby kyslíku je VO2 Master Pro validný ale pre meranie kľudového metabolizmu validný nie je. Takisto bolo dokázané že veľkosť nameranej hodnoty má nelieneárny vzťah ku veľkosti odchýlky pri meraní maximálnej spotreby kyslíku.
|
|
|
Analýza časového vývoje léčených nádorů páteře v CT datech
Nohel, Michal ; Jan, Jiří (oponent) ; Jakubíček, Roman (vedoucí práce)
Tato diplomová práce se zabývá časovým vývojem léčených nádorů páteře v CT datech. V teoretické části se zabývá anatomií, fyziologií a patofyziologií páteře a těl obratlů. Dále popisuje diagnostické a terapeutické možnosti detekce a léčby nádorů páteře. Její součástí je přehled současného stavu využití časové analýzy v onkologii. Jsou diskutovány problémy dostupných anotací a jsou vytvořeny nové databáze pro následnou analýzu. Dále je navržena metodologie časové analýzy podle tvarové charakterizace a velikosti postižení obratle. Na vytvořené databáze jsou aplikovány navržené metodické přístupy extrakce příznaků. Jejich volba a vhodnost je diskutována, včetně jejich potenciálu pro případné využití pro klinickou praxi sledování vývoje a odvozování charakteristických závislostí příznaků na prognóze pacienta.
|
|
|
Image filtration effect on quality of subtractive angiography-based CT brain images of blood-vessels
Šipula, Samuel ; Nohel, Michal (oponent) ; Chmelík, Jiří (vedoucí práce)
The aim of the bachelor thesis is to design filtering methods for the resulting quality of digital subtraction angiography. The role of filtration in this case is to suppress noise and strong structures to enhance vessel anatomy. Real patient data obtained using a computed tomography system are available for this purpose. In this work, the emphasis is mainly on noise suppression. Individual filtration techniques were implemented in MATLAB. The work further acquaints the reader with the theory of vascular supply to the brain, its imaging methods and the description of filters as discrete operators.
|
|
|
Synchronizace elektroporačních pulzů se srdečním rytmem
Nohel, Michal ; Mézl, Martin (oponent) ; Novotná, Veronika (vedoucí práce)
Bakalářská práce se zabývá principem buněčné elektroporace a jejími druhy. Dále popisuje termální a netermální ablační techniky se zaměřením na ireverzibilní elektroporaci. Její součástí je přehled oblastí, ve kterých se využívá synchronizace lékařských úkonů s EKG signálem, přehled technik a měření elektrokardiografického signálu. Dále je diskutována citlivost lidského těla na elektroporační pulzy. Při elektroporaci jsou do pacienta aplikovány krátké vysokonapěťové pulzy. Pokud by byly tyto pulzy aplikovány do vulnerabilní fáze srdečního rytmu, mohla by vzniknout fibrilace komor. Z důvodu bezpečnosti při klinickém využití je proto nezbytná synchronizace aplikace pulzů se srdeční aktivitou pacienta. Součástí praktické části je vytvoření programu v LabVIEW právě pro tento typ synchronizace. Vytvořený program byl testován a dosažené výsledky byly vyhodnoceny z hlediska možnosti praktického použití.
|
|
|
Predikce odpovědi na radioterapii u karcinomu rekta pomocí MR
Chmela, Radek ; Nohel, Michal (oponent) ; Mézl, Martin (vedoucí práce)
Tato diplomová práce se zabývá problematikou predikce odezvy rakoviny rekta na radioterapii. Práce je rozdělena do čtyř kapitol. V prvních dvou je popsána anatomie rekta, typy nádorových onemocnění a jednotlivé diagnostické metody, společně s algoritmy pro detekci objektů v obrazech. Ve třetí kapitole je popis řešení pro automatickou segmentaci a predikci účinnosti radioterapie. Ve čtvrté kapitole jsou pak diskutovány dosažené výsledky.
|
|
|
Implementation of a deep learning model for vertebral segmentation in CT data
Blažkova, Lenka ; Nohel, Michal
This paper deals with the problem of vertebral segmentationin CT data with the use of deep learning approaches.Automatic segmentation of vertebrae is a very complex issueand would simplify the work of radiologists and doctors. Thepaper is focused on one of the models published and submittedto the Large Scale Vertebrae Segmentation Challenge (VerSe) in2020 from C. Payer et al. – Improving Coarse to Fine VertebraeLocalisation and Segmentation with SpatialConfiguration-Netand U-Net and its implementation and modification. The modelis evaluated on the corresponding public and hidden dataset. Itsmodification shows an improvement of the results in comparisonwith the published results, a mean Dice score improved from0.9165 to 0.9302 on the public dataset and from 0.8971 to 0.9264on the hidden dataset.
|
|
|
Implementace modelu hlubokého učení pro segmentaci obratlů v CT datech
Blažková, Lenka ; Chmelík, Jiří (oponent) ; Nohel, Michal (vedoucí práce)
Tato bakalářská práce se věnuje problematice segmentace obratlů v CT datech s využitím hlubokého učení. Nejprve je vytvořena teoretická rešerše zaměřená na anatomii a patologie páteře a obratlů, na CT systémy a na modely hlubokého učení pro segmentaci obratlů z 3D dat. Další část obsahuje podrobnější popis vybraného modelu pro segmentaci obratlů. V páté části je popsána samotná implementace vybraného modelu a navržená modifikace společně s výsledky na příslušné databázi. Nakonec je model s modifikací použit na klinická data poskytnutá vedoucím a popsána jeho úspěšnost na nich.
|
|
|
Segmentace optického disku v obrazových datech sítnice
Nohel, Michal ; Drahanský, Martin (oponent) ; Kolář, Radim (vedoucí práce)
Diplomová práce se zabývá segmentací optického disku a cupu v obrazových datech sítnice. V teoretické části se práce zabývá popisem optického disku a cupu a její součástí je přehled současného stavu využití metod strojového učení pro segmentaci optického disku a cupu. Dále jsou popsány základní principy a bloky konvolučních neuronových sítí. Na vytvořených databázích byly natrénovány konvoluční neuronové sítě U-Net a její modifikace nnU-Net. Tyto modely byly testovány a dosažené výsledky byly diskutovány a srovnány s vybranými publikovanými metodami. Závěrem byly modely vyhodnoceny z~hlediska možnosti jejich praktického využití.
|
|
|
Predikce odpovědi na radioterapii u karcinomu rekta pomocí MR
Chmela, Radek ; Nohel, Michal (oponent) ; Mézl, Martin (vedoucí práce)
Tato diplomová práce se zabývá problematikou predikce odezvy rakoviny rekta na radioterapii. Práce je rozdělena do čtyř kapitol. V prvních dvou je popsána anatomie rekta, typy nádorových onemocnění a jednotlivé diagnostické metody, společně s algoritmy pro detekci objektů v obrazech. Ve třetí kapitole je popis řešení pro automatickou segmentaci a predikci účinnosti radioterapie. Ve čtvrté kapitole jsou pak diskutovány dosažené výsledky.
|
host ::
