|
|
3D rekonstrukce objektů z multiskopických snímků
Řehoř, Jan ; Odstrčilík, Jan (oponent) ; Jakubíček, Roman (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá 3D rekonstrukcí objektů z multiskopických snímků. Je rozdělena na pět kapitol. První kapitola se týká teoretického seznámení problematiky, tedy, co je 3D rekonstrukce, popis geometrie kamery a rekonstrukční algoritmy. Dále je práce tvořena praktickou částí, ve které jsou popsány jednotlivé kroky realizace 3D rekonstrukce, tedy akvizice snímků, kalibrace a použitých algoritmech. Poslední část práce tvoří diskuze a závěr, ve které jsou diskutovány a shrnuty výsledky pokusu.
|
|
|
Detekce a segmentace lumbálních obratlů v 3D CT datech
Nemček, Jakub ; Kolář, Radim (oponent) ; Jakubíček, Roman (vedoucí práce)
Práca sa zaoberá detekciou a segmentáciou lumbálnych stavcov v CT obrazových dátach. Popísaná detekčná metóda je založená na používaní natrénovaného SVM klasifikátora a histogramoch orientovaných gradientov ako obrazových príznakoch. Detekcia je aplikovaná na dvojrozmerné sagitálne rezy CT obrazu. Segmentácia je realizovaná metódou deformovania trojuholníkových mriežkových modelov získaných zo spriemerovaných stavcov z reálnych CT dát. V prvej časti práce sú popísané potrebné teoretické poznatky o anatómii osového skeletu, počítačovej tomografii, metódach spracovania obrazu a o problematike detekcie a segmentácie. Druhá časť obsahuje postup realizácie algoritmov, ďalej vyhodnotenie a diskusiu výsledkov u detekčného a segmentačného algoritmu. Na záver je diskutované možné využitie algoritmov v CAD systémoch. Aplikácia všetkých praktických bodov je realizovaná v programovacom prostredí Matlab.
|
|
|
Segmentace míšního kanálu a meziobratlových plotének v MRI datech
Koban, Martin ; Odstrčilík, Jan (oponent) ; Jakubíček, Roman (vedoucí práce)
Práca sa venuje vývoju metódy pre segmentáciu spinálneho kanálu a intervertebrálnych diskov v objemových MRI dátach. Cieľom je čo najvyšší stupeň automatizácie postupu a presnosť umožňujúca spoľahlivé kvantitatívne hodnotenie výsledkov. Základ segmentačného algoritmu tvorí model náhodnej prechádzky v kombinácii so špecifickou metódou aktívnych kontúr formulovanou prostredníctvom konceptu level set. Navrhnutý postup je testovaný na databáze trojrozmerných T2-váhovaných MRI snímok, ktorej súčasťou je aj referenčná manuálna segmentácia intervertebrálnych diskov.
|
|
|
Identifikace 2D CT axiálních řezů pomocí konvolučních neuronových sítí
Vavřinová, Pavlína ; Harabiš, Vratislav (oponent) ; Jakubíček, Roman (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá klasifikací 2D axiálních CT řezů pacientských dat do šesti kategorií. K tomuto záměru byla využita oblast konvolučních neuronových sítí. Pro snadnější porozumění této problematice jsou nejprve vysvětleny základy neuronových sítí obecně a poté principy hlubokého učení zahrnující konvoluční neuronové sítě. Pro účely identifikace axiálních řezů byla vybrána konkrétně síť AlexNet, která byla po uzpůsobení otestovaná na vytvořené datové sadě. Celková úspěšnost klasifikace dosáhla 86%, po finálních úpravách došlo k mírnému zlepšení, kdy identifikační schopnost činila 87%.
|
|
|
Hodnocení vlivu mrkání na výsledek fúze simultánních EEG-fMRI dat
Dobiš, Lukáš ; Jakubíček, Roman (oponent) ; Labounek, René (vedoucí práce)
Práce se zabývá základní teorií k simultánní fúzi EEG-fMRI dat. Principy akvizice jednotlivých dat a jejich artefakty s rozsáhlým zaměřením na jejich předzpracování. Konkrétně na potlačení artefaktu mrkání z EEG dat a metodou analýzy nezávislých komponent. Dále se zabývá technikou fúze dat v obecném lineárním modelu a vytvořením aktivačních map statisticky významných korelací. Práce obsahuje popis metodiky potřebné na analýzu výsledků. Jsou popsány parametry použitých dat. Je navržen a aplikován proces předzpracování EEG dat, včetně potlačení artefaktu a fúze s vyhodnocením v prostředí MATLAB. Výsledky vyhodnocení prokázaly větší vliv mrkacího artefaktu na výsledky počítané z relativního výkonu a neúplnost kompletního potlačení artefaktu z dat pro testovanou metodu.
|
|
|
Modelování polohy hlavy pomocí stereoskopické rekonstrukce
Hříbková, Veronika ; Jakubíček, Roman (oponent) ; Kolář, Radim (vedoucí práce)
Tato práce se zabývá detekcí polohy lidské hlavy ve stereo datech. Teoretická část poskytuje podklady pro porozumění geometrii kamery, jejím parametrům a způsobu kalibrace. Dále jsou popsány principy stereo analýzy a tvorby disparitních map. V rešeršní části jsou představeny metody používané pro modelování polohy hlavy a je uveden rozbor vybraných publikovaných článků. V rámci diplomové práce byl navržen systém dvou kamer pro stereoskopická snímání pohybu hlavy a bylo realizováno několik měření. Získaná data byla upravena pro tvorbu disparitních map a další zpracování. Na základě detekce obličejových příznaků, konkrétně vnitřních a vnějších koutků očí a koutků úst, a jejich korespondencí byl vytvořen jednoduchý geometrický model ve tvaru trojúhelníku, který znázorňuje sklon obličejové roviny v prostoru. Výpočtem úhlů sklonu ve třech osách je získána aktuální poloha hlavy. Pohyb je modelován sledováním detekovaných bodů v průběhu video sekvencí.
|
|
|
Detekce anatomických struktur v CT datech s využitím konvolučních neuronových sítí
Kozlová, Dominika ; Jan, Jiří (oponent) ; Jakubíček, Roman (vedoucí práce)
Tato diplomová práce se zabývá problematikou detekce anatomických struktur v medicínských obrazech s využitím konvolučních neuronových sítí (CNN). Nejprve jsou popsány metody strojového učení, konvoluční neuronové sítě a vybrané přístupy k detekci s využitím CNN. V rámci práce byla vytvořena databáze anotovaných CT snímků deseti anatomických struktur (hlava, srdce, aorta, levá a pravá plíce, páteř, játra, levá a pravá ledvina, slezina). Dále byla navržena metoda umožňující jejich detekci, která obsahuje dva postupy získání oblastí ze snímku, CNN a závěrečné zpracování pro získání výsledku detekce. Navržený algoritmus byl implementován v programovacím jazyce Python s využitím knihovny TensorFlow. Získané výsledky validace sítě a výsledky detekce jsou uvedeny a diskutovány v poslední kapitole.
|
|
|
Segmentace kortikálních částí obratlů
Janštová, Michaela ; Kolář, Radim (oponent) ; Jakubíček, Roman (vedoucí práce)
Práce se zabývá segmentací kortikálních částí obratlů z CT obrazových dat v programovém prostředí MATLAB. Popsána je problematika segmentačních technik, zejména metody „level-set” a její modifikace DRLSE. Tato metoda byla zvolena na základě informací získaných z článků publikovaných v odborných časopisech a také díky hojnému využití v praxi a uspokojivým výsledkům právě v oblasti segmentace kostních tkání. V závěru práce je navržená metoda testovaná na CT obrazových datech.
|
|
|
Rozšiřující modul platformy 3D Slicer pro segmentaci tomografických obrazů
Chalupa, Daniel ; Jakubíček, Roman (oponent) ; Mikulka, Jan (vedoucí práce)
Tato práce pojednává o využití strojového učení při úlohách klasifikace medicínských obrazů. Obsahuje literární rešerši pojednávající o klasických a moderních metodách segmentace obrazů. Hlavním cílem práce je navržení a vytvoření rozšíření pro platformu 3D Slicer. Rozšíření využívá strojové učení ke klasifikaci obrazů dle zadaných parametrů. Testování rozšíření probíhá na reálných tomografických obrazech z nukleární magnetické rezonance a sleduje přesnost klasifikace a využitelnost v praxi.
|
|
|
Detekce a identifikace typu obratle v CT datech onkologických pacientů
Věžníková, Romana ; Harabiš, Vratislav (oponent) ; Jakubíček, Roman (vedoucí práce)
Automaticka detekce a segmentace patere nebo obratlu z CT snimku je narocnym ukolem z nekolika duvodu. Jednim z duvodu jsou nejasne hranice obratlu ve snimcich a nezretelne hranice mezi jednotlivymi obratli, dale artefakty, vyskytujici se v obrazech, ale take anatomicka slozitost. Tato prace se zabyva navrhem a realizaci detekce a klasifikace typu obratle v CT snimcich onkologickych pacientu, coz pridava na slozitosti z duvodu pritomnosti deformaci nekterych obratlu. Pri samotne segmentaci obratlu je vyuzita Otsuova metoda. Detekce obratlu je zalozena na hledani hranic oddelujici jednotlive obratle vsagitalnich rezech. Pro identifikaci potom slouzi rozhodovaci stromy nebo zobecnena Houghova, pricemz jsou obratle hledany v rezech CT snimku na zaklade podobnosti tvaru s modely jednotlivych obratlu.
|
host ::
RSS.