Original title:
Molekulární detekce Mycoplasma gallisepticum na základě celogenomových dat
Translated title:
Molecular detection of Mycoplasma gallisepticum based on whole genome data
Authors:
KURÁŽ, Jakub Document type: Master’s theses
Year:
2024
Language:
cze Abstract:
[cze][eng] Tato práce shrnuje základní poznatky o druhu Mycoplasma gallisepticum a navrhuje detekčně-rozlišovací metodu, která odlišuje tento druh od ostatních druhů rodu Mycoplasma. Optimalizací metody real time PCR bylo umožněno zpřesnění a zvýšení efektivity detekce unikátních sekvencí z genomu M. gallisepticum. Funkčnost a správnost metody byla posléze ověřena detekcí M. gallisepticum ve směsných vzor-cích ptačích a myších mykoplazem.This thesis reviews the basic knowlegde of a bacteria Mycoplasma gallisepticum and attempts to propose a functional detection protocol to distinguish M. gallisepticum from related species of the genus Mycoplasma. Real time PCR optimalization has refined the specificity and increased the efficiency of detection of selected genomic loci for M. gallisepticum. The functionality and accuracy of the method was verified in laboratory experiments by detecting the occurrence of M. gallisepticum in mixed Mycoplasma samples.
Keywords:
bacteria; detection; glpK; MAMA; mg2; Mollicutes; multiplex PCR; Myco-plasma anatis; Mycoplasma gallisepticum; Mycoplasma imitans; Mycoplasma meleagridis; Mycoplasma pulmonis; Mycoplasma synoviae; plpA; potC; poultry disease; pvpA; real time PCR; vaccine; virulence factors; bakterie; detekce; faktory viru-lence; glpK; MAMA; mg2; Mollicutes; multiplex PCR; Mycoplasma anatis; Mycoplasma gallisepticum; Mycoplasma imitans; Mycoplasma meleagridis; Mycoplasma pulmonis; Mycoplasma synoviae; onemocnění drůbeže; plpA; potC; pvpA; real time PCR; vakcína Citation: KURÁŽ, Jakub. Molekulární detekce Mycoplasma gallisepticum na základě celogenomových dat. České Budějovice, 2024. diplomová práce (Ing.). JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH. Fakulta zemědělská a technologická
Institution: University of South Bohemia in České Budějovice
(web)
Document availability information: Fulltext is available in the Digital Repository of University of South Bohemia. Original record: http://www.jcu.cz/vskp/68016