Název: Porovnání metod pro konstrukci barevných DNA spektrogramů
Překlad názvu: Comparison of methods for RGB spectrogram construction of DNA
Autoři: Postránecká, Tereza ; Provazník, Ivo (oponent) ; Kubicová, Vladimíra (vedoucí práce)
Typ dokumentu: Diplomové práce
Rok: 2013
Jazyk: cze
Nakladatel: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
Abstrakt: [cze] [eng]
Tato práce pojednává o možnostech konstrukce barevných DNA spektrogramů a o vzorech, které z nich detekujeme. Spektrogramy jako nástroje spektrální analýzy nám umožňují současný pohled na lokální frekvence napříč celou nukleotidovou sekvencí. Jsou vhodné pro identifikaci genů či jejich regionů, určování globálních vlastností celých chromozomů, ale také dávají možnost objevit nové dosud neznámé regiony s potenciálním významem. Za účelem takovéto analýzy DNA lze použít techniky číslicového zpracování signálů. Jejich použití však musí předcházet metody konvertování DNA sekvence do numerické reprezentace. Výběr správné numerické reprezentace ovlivní, jak dobře budou dané biologické vlastnosti reflektovány v numerickém zápisu potřebném pro další použití v analýze zpracování signálů. This thesis discusses about possibilities of construction colour DNA spectrograms and about patterns which can be detected there. Spectrograms as tools of spectral analysis give us a simultaneous view of the local frequency throughout the nucleotide sequence. They are suitable for gene identification or gene regions identification, determination of global character about whole chromosomes and also give us a chance for the discovery of yet unknown regions of potential significance. For purpose of this kind of DNA analysis is possible to use digital signal processing methods. We can apply them on only after conversion of DNA sequence to numerical representation. Selection of correct numerical representation affects how well will be reflected biological features in numerical record which we need for another use in digital signal analysis.
Klíčová slova: autoregresní model; DNA sekvence; Fourierova transformace; numerická reprezentace; spektrogram; autoregressive model; DNA sequence; Fourier transform; numerical representation; spectrogram

Instituce: Vysoké učení technické v Brně (web)
Informace o dostupnosti dokumentu: Plný text je dostupný v Digitální knihovně VUT.
Původní záznam: http://hdl.handle.net/11012/25943

Trvalý odkaz NUŠL: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-567241


Záznam je zařazen do těchto sbírek:
Školství > Veřejné vysoké školy > Vysoké učení technické v Brně
Vysokoškolské kvalifikační práce > Diplomové práce