Original title: Fylogeografie a genetická diverzita populací druhu Gobius niger (Gobiiformes: Gobiidae)
Translated title: Phylogeography and genetic diversity of the populations of Gobius niger (Gobiiformes: Gobiidae)
Authors: Hradečný, Jakub ; Vukićová, Jasna (advisor) ; Perdices, Anabel (referee)
Document type: Master’s theses
Year: 2023
Language: eng
Abstract: [eng] [cze]
Gobies (Gobiiformes: Gobiidae) are the most speciose fish family and the most abundant fish group of the European seas. Yet, the population genetic diversity has been studied in only a few European goby species. Although the ocean is seemingly a continuous habitat, there are barriers to gene flow in marine environment in form of e.g. straits or marine currents. The black goby (Gobius niger) is a demersal marine fish with planktonic larvae, inhabiting the coastal waters of Europe, north Africa and the Mediterranean and Black Sea coast of the Middle East. The current work examined individuals from 28 localities across the distribution range of the species in order to study the population genetic diversity. The analyses of two mitochondrial markers (cytochrome b and D loop) revealed a complex structuring of the population and a pronounced intraspecific diversity (maximum uncorrected p-distance 6.1 %). The population is divided into four very diverse haplotype groups, with unexpected geographic pattern. While the population inhabiting the Atlantic Ocean and the North Sea is generally genetically homogeneous, with all examined individuals bearing haplotypes belonging to a single haplotype group, the Mediterranean population is very complex, displaying a presence of four haplotype groups, some of which... Hlaváči (Gobiiformes: Gobiidae) jsou nejpočetnější rybí čeledí a nejvíce zastoupenou skupinou ryb obývající evropské pobřeží. Genetická diverzita evropských hlaváčů byla doposud studována pouze u několika málo druhů. Ačkoli se mořské prostředí jeví jako homogenní, existují zde bariéry bránící genovému toku, například v podobě průlivů či mořských proudů. Hlaváč černý (Gobius niger) obývá pobřežní vody Evropy, severní Afriky a také středozemní a černomořské pobřeží Blízkého východu. Jedná se o bentický druh hlaváče, který má v rámci životního cyklu planktonní larvální stadia. V rámci této práce byli studovaní jedinci z 28 lokalit napříč areálem rozšíření, s cílem studia vnitrodruhové genetické diverzity. Analýza dvou mitochondriálních genů (cytochrom b a D loop) odhalila komplexní populační strukturu a výraznou vnitrodruhovou diverzitu (maximální p-distance 6,1 %). Populace je rozčleněna na čtyři velmi rozdílné haplotypové skupiny, s neočekávaným geografickým rozložením. Zatímco populace obývající Atlantský oceán a Severní moře je geneticky homogenní a všichni studovaní jedinci nesou haplotypy patřící do stejné haplotypové skupiny, středomořská populace je velmi komplexní, a vykazuje přítomnost čtyř haplotypových skupin, z nichž některé jsou sdílené i mezi vzdálenějšími regiony. V západním středomoří...
Keywords: goby; marine fish; Mediterranean Sea; molecular data; population structure; hlaváč; molekulární data; mořské ryby; populační struktura; Středozemní moře

Institution: Charles University Faculties (theses) (web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository.
Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/179682

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-521395


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Charles University > Charles University Faculties (theses)
Academic theses (ETDs) > Master’s theses