Original title: Comparison of molecular diagnostic approaches for the detection and differentiation of the intestinal protist Blastocystis sp. in humans
Authors: ŠLOUFOVÁ, Martina
Document type: Rigorous theses
Year: 2022
Language: eng
Abstract: [eng] [cze]
Blastocystis is the most commonly found intestinal protist in the world. Accurate detection and differentiation of Blastocystis including its subtypes (arguably species) is essential for understanding its epidemiology and role in human health. We compared the sensitivity of conventional PCR (cPCR) and qPCR in a set of 288 DNA samples obtained from stool samples of gut-healthy individuals and subtype diversity as detected by next-generation sequencing (NGS) versus Sanger sequencing. Blastocystis sp. je v současné době nejrozšířenějším střevním prvokem na světě. Přesná diagnostika a určení jednotlivých subtypů je zásadní pro pochopení epidemiologie Blastocystis sp. jeho a role v lidském zdraví. V této práci byla porovnána citlivost konvenční PCR (cPCR) a qPCR v souboru 288 vzorků DNA získaných ze vzorků lidské stolice. Dále byla posuzována diverzita subtypů na základě dle Next-generation sekvenování (NGS) a Sangerova sekvenování.
Keywords: Blastocystis; konvenční PCR; kvantifikace; NGS; qPCR; senzitivita
Citation: ŠLOUFOVÁ, Martina. Comparison of molecular diagnostic approaches for the detection and differentiation of the intestinal protist Blastocystis sp. in humans. České Budějovice, 2022. rigorózní práce (RNDr.). JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH. Přírodovědecká fakulta

Institution: University of South Bohemia in České Budějovice (web)
Document availability information: Fulltext is available in the Digital Repository of University of South Bohemia.
Original record: http://www.jcu.cz/vskp/69396

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-519758


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > University of South Bohemia in České Budějovice
Academic theses (ETDs) > Rigorous theses