Název: Analýza transkriptomu tasemnice Mesocestoides corti
Překlad názvu: Transcriptomic analysis of Mesocestoides corti
Autoři: Korená, Lucie ; Leontovyč, Roman (vedoucí práce) ; Převorovský, Martin (oponent)
Typ dokumentu: Diplomové práce
Rok: 2022
Jazyk: cze
Abstrakt: [cze] [eng]
Některé druhy parazitů včetně helmintů mohou v hostiteli inhibovat karcinogenezi. Protinádorový efekt byl v minulosti prokázán u tasemnic Taenia crassiceps a Echinococcus granulosus, u kterých byly identifikovány geny související s regresí rakoviny. V rámci výzkumu Helmintologické laboratoře katedry Parazitologie Přf UK byl zjištěn efekt suprese melanomu u tasemnicí Mesocestoides corti, avšak mechanismus účinku zatím zůstává neznámý. Pro navazující výzkum bylo důležité získat komplexní molekulární data v podobě transkriptomu vývojových stadií M. corti. Tato práce se zabývá studiem transkriptomického profilu tasemnice M. corti a rozdílem v genové expresi u tasemnic kultivovaných in vitro a v myších hostitelích (inbrední a outbrední kmen) pomocí metody RNA-seq. Cílem bylo nalézt upregulované transkripty tasemnic v myších hostitelích, které by mohly mít potenciální vliv na regresi rakoviny. Byla provedena analýza diferenciální genové exprese, ze které vyplývá, že tasemnice v myších hostitelích (bez ohledu na kmen) mají více upregulovaných transkriptů než tasemnice kultivované in vitro. Analýzou vysoce upregulovaných transkriptů tasemnic v myších hostitelích bylo identifikováno několik transkriptů, které byly zmíněny ve vědeckých článcích jako možné supresory rakoviny. Mezi ně patří například KATNA1,... Some species of parasites, including helminths, can inhibit carcinogenesis in their hosts. The antitumoral effect has been discovered in the tapeworms Taenia crassiceps and Echinococcus granulosus, which genes associated with cancer regression have been identified. The effect of melanoma suppression has also been observed in tapeworm Mesocestoides corti by the Laboratory of Helminthology, Department of Parasitology, Faculty of Science, Charles University, however the mechanism-of-action, remains unknown. For the upcoming research it was essential to have the complex molecular data such as transcriptome of the developmental stage s of M. corti. This work is focused on the transcriptomic profiling of the tapeworm M. corti and the differential gene expression in two different strains of murine hosts (inbred and outbred) using the RNA-Seq. The main goal was to identify upregulated transcripts in the tapeworms from the murine hosts that could have a potential effect on cancer regression. Differential gene expression analysis was performed, and the results showed that tapeworms in murine hosts (regardless of strain) had more upregulated transcripts than tapeworms cultured in vitro. Analysis of highly upregulated transcripts in the tapeworms that were grown in the murine hosts identified several...
Klíčová slova: bioinformatická analýza; diferenciální genová exprese; Mesocestoides corti; rakovina; tasemnice; transkriptom; bioinformatics analysis; cancer; differential gene expression; Mesocestoides corti; tapeworm; transcriptome

Instituce: Fakulty UK (VŠKP) (web)
Informace o dostupnosti dokumentu: Dostupné v digitálním repozitáři UK.
Původní záznam: http://hdl.handle.net/20.500.11956/175661

Trvalý odkaz NUŠL: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-509088


Záznam je zařazen do těchto sbírek:
Školství > Veřejné vysoké školy > Univerzita Karlova > Fakulty UK (VŠKP)
Vysokoškolské kvalifikační práce > Diplomové práce