Název: Hledání guaninových kvadruplexů v DNA pomocí rozhodovacích stromů
Překlad názvu: Finding guanine quadruplexes in DNA using decision trees
Autoři: Kotrys, Kryštof ; Šťastný, Jiří (oponent) ; Kaura, Patrik (vedoucí práce)
Typ dokumentu: Bakalářské práce
Rok: 2022
Jazyk: cze
Nakladatel: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta strojního inženýrství
Abstrakt: [cze] [eng]
Tato bakalářská práce se zaměřuje na vytvoření funkčního modelu rozhodovacího stromu pro detekci guaninových kvadruplexů v DNA. První část práce se věnuje shrnutí poznatků z oblasti lokálních struktur DNA, výpočetní predikce guaninových kvadruplexů a teorie rozhodovacích stromů. Druhá část práce se zabývá tvorbou modelu rozhodovacího stromu pro detekci kvadruplexů a následně statistickým porovnáním výsledků této metody s algoritmem G4Hunter. This bachelor’s thesis is focused on creating a functional decision tree model for detection of guanine quadruplexes in the DNA. The first part of the thesis summarizes theoretical knowledge in the fields of local DNA structures, computational prediction methods of guanine quadruplexes and decision trees. The second part describes the creation of a decision tree model, followed by a statistical comparison of the results with the G4Hunter algorithm.
Klíčová slova: DNA; G4Hunter; guaninový kvadruplex; nukleová báze; Python; Rozhodovací strom; XGBoost; Decision tree; DNA; G4Hunter; guanine quadruplex; nucleobase; Python; XGBoost

Instituce: Vysoké učení technické v Brně (web)
Informace o dostupnosti dokumentu: Plný text je dostupný v Digitální knihovně VUT.
Původní záznam: http://hdl.handle.net/11012/205885

Trvalý odkaz NUŠL: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-503459


Záznam je zařazen do těchto sbírek:
Školství > Veřejné vysoké školy > Vysoké učení technické v Brně
Vysokoškolské kvalifikační práce > Bakalářské práce