Název:
Mikrobiální společenstva v půdě dlouhodobě kontaminované těžkými kovy
Překlad názvu:
Microbial communities of soils affected by long-term heavy metal contamination
Autoři:
Průchová, Pavla ; Kopecký, Jan (vedoucí práce) ; Matyska Lišková, Petra (oponent) Typ dokumentu: Bakalářské práce
Rok:
2012
Jazyk:
cze
Abstrakt: [cze][eng] Tato práce se zabývá mikrobiálními společenstvy, žijícími v půdě dlouhodobě vystavené působení těžkých kovů. Ve dvou lokalitách na Příbramsku s odlišným stupněm kontaminace byly provedeny odběry půdy. U vzorků byla změřena respirace in vitro po přídavku zdrojů uhlíku a za různé míry zátěže kadmiem, jedním z kovů, jimiž je lokalita kontaminována. Z půdy po inkubaci se zdroji uhlíku a z kontroly bez přídavku byly odebrány vzorky a z nich izolována enviromentální DNA. Ze vzorků enviromentální DNA byl amplifikován gen kódující 16S rRNA u aktinobakterií, získaný směsný amplikon byl analyzován stanovením polymorfismu délky terminálního restrikčního fragmentu. Získané profily byly použity ke srovnání aktinobakteriálních společenstev v obou skupinách vzorků půd a v jednotlivých ošetřeních. Analýza ukázala jasné odlišení dvou různě kontaminovaných lokalit a různě výrazné posuny ve složení společenstev po přidání substrátu.This work is focused on microbial communities living in the soil affected by long-term exposure to heavy metals. The soil was sampled at two sites with different levels of contamination near Příbram. In the samples, respiration rate was measured in vitro after addition of carbon sources and at different levels of cadmium, one of the contaminating metals found in the soil. After the incubation with carbon sources, soil samples were collected for environmental DNA isolation. Gene coding for 16S rRNA in Actinobacteria was amplified from the environmental DNA samples and the amplicon composition was assessed by terminal restriction fragment length polymorphism analysis. The resulting profiles were used to compare actinobacterial communities in both groups of soil samples and in individual treatments. The analysis showed a clear distinction between the two sites differing in the contamination level and shifts in the community composition of various intesity depending on the added substrate.
Klíčová slova:
Aktinobakterie; diversita; houby; respirace; těžké kovy; Actinobacteria; diversity; fungi; heavy metals; respiration