Název: Kultivace viru KE \kur{in vivo} v přítomnosti inhibitoru glykosylace: vliv na nukleotidovou sekvenci genů virových proteinů.
Překlad názvu: Cultivation of tick-borne encephalitis virus in the presence of inhibitor of glycosylation: its effect on nucleotide sequence of genes encoding viral proteins.
Autoři: FARKOVÁ, Karolína
Typ dokumentu: Bakalářské práce
Rok: 2008
Jazyk: cze
Abstrakt: [cze] [eng]
V mé práci jsem porovnávala nukleotidovou sekvenci virových genů a výslednou aminokyselinovou sekvenci virových proteinů viru klíšťové encefalitidy varianty Hypr3TM s původní variantou viru Hypr50/CB. Identifikovala jsem čtyři nukleotidové záměny; tři z nich způsobovaly změnu v aminokyselinové sekvenci. Po porovnání s málo pasážovanou variantou Hypr5 se tři z těchto změn shodovaly s touto variantou. Jedna aminokyselinová záměna je unikátní pro variantu Hypr3TM. Tato záměna způsobila změnu v elektrostatickém potenciálu receptorové domény proteinu E, což může ovlivnit proteinové interakce v homodimerech a homotrimerech na povrchu proteinu a interakce proteinu E s receptorem pro virus KE na hostitelské buňce. In this work I compared nucleotide sequences of virus genes and the resulting aminoacid sequences of viral proteins of TBE virus variant Hypr3TM with the parental virus Hypr50/CB. This comparison serves for identification of nucleotide/aminoacid substitutions resulting for virus replication in an enviroment with inhibited protein glycosylation. I identified four nucleotide substitutions; three of them caused also changes in amino acid sequence. When compared to a low-passaged variant Hypr5, three of the nucleotide substituions were identical with this variant. One amino acid substitution is unique for variant Hypr3TM. This substitution caused changes in electrostatic potencial of receptor domain of protein E and thus can affect the protein-protein interactions within homodimers and homotrimers at the surface of the protein and the interaction of the E protein with host-cell receptors for the TBE virus.
Klíčová slova: glykosylace; virus klíšťové encefalitidy; glycosylation; Tick-borne encephalitis
Citace: FARKOVÁ, Karolína. Kultivace viru KE \kur{in vivo} v přítomnosti inhibitoru glykosylace: vliv na nukleotidovou sekvenci genů virových proteinů.. České Budějovice, 2008. bakalářská práce (Bc.). JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH. Přírodovědecká fakulta

Instituce: Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích (web)
Informace o dostupnosti dokumentu: Plný text je dostupný v digitálním repozitáři JČU.
Původní záznam: http://www.jcu.cz/vskp/9754

Trvalý odkaz NUŠL: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-48918


Záznam je zařazen do těchto sbírek:
Školství > Veřejné vysoké školy > Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích
Vysokoškolské kvalifikační práce > Bakalářské práce