Original title: Charakterizace genu pop-1 u Caenorhabditis elegans
Translated title: Characterization of the Caenorhabditis elegans pop-1 gene
Authors: Jakšová, Soňa ; Vacík, Tomáš (advisor) ; Macůrková, Marie (referee)
Document type: Master’s theses
Year: 2019
Language: slo
Abstract: [eng] [cze]
The TCF/LEF transcriptional factors regulate the target genes of the Wnt signalling pathway - one of the key signalling mechanisms involved in development of multicellular organisms. The TCF/LEF genes produce a number of various protein isoforms, which consequently leads to a great functional diversity of the TCF/LEF proteins. In this diploma project we focused on the Caenorhabditis elegans gene pop-1, the ortholog of the TCF/LEF genes, whose isoforms have not been studied yet. Using the Northern blot analysis we tried to identify alternative isoforms of the pop-1 mRNA in C. elegans. Using quantitative RT-PCR we also analyzed the pop-1 mRNA levels during seven developmental stages of C. elegans. Further, we also determined the expression profile of two important partners of pop-1, the bar-1 and sys-1 genes, whose protein products function as transcriptional co-activators. Key words: canonical Wnt signaling pathway, TCF/LEF transcription factors, Caenorhabditis elegans, pop-1 Transkripční faktory TCF/LEF regulují cílové geny signální dráhy Wnt - klíčového mechanismu ve vývoji mnohobuněčných organismů. Geny TCF/LEF produkují mnoho různých proteinových izoforem, čímž rozšiřují pole působnosti TCF/LEF proteinů. Diplomová práce využívá modelový organismus Caenorhabditis elegans, u kterého studuje gen pop-1, ortolog TCF/LEF. Žádná alternatívní izoforma proteinu POP-1 nebyla doposud identifikovaná. Hybridizační metodou Northern blot jsme se pokusili ověřit přítomnost alternativní pop-1 mRNA. Pomocí kvantitativního RT-PCR jsme analyzovali hladinu pop-1 mRNA v sedmi vývojových stádiích C. elegans. Kromě toho jsme stanovili expresní profil dvou významných interačních partnerů proteinu POP-1 - genů bar-1 a sys-1, jejichž proteinové produkty mají ve Wnt signalizaci úlohu transkripčních koaktivátorů. Klíčová slova: kanonická Wnt signální dráha, transkripční faktory TCF/LEF, Caenorhabditis elegans, pop-1
Keywords: alternative isoforms; gene expression; transcriptional regulation; Wnt signaling; alternativní izoformy; genová exprese; transkripční regulace; Wnt signalizace

Institution: Charles University Faculties (theses) (web)
Document availability information: Available in the Charles University Digital Repository.
Original record: http://hdl.handle.net/20.500.11956/110018

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-451001


The record appears in these collections:
Universities and colleges > Public universities > Charles University > Charles University Faculties (theses)
Academic theses (ETDs) > Master’s theses