Název:
Druhová identifikace páskovek (Cepaea) pomocí molekulárně-genetických metod
Autoři:
Dratvová, Lenka Typ dokumentu: Diplomové práce
Rok:
2017
Jazyk:
cze
Abstrakt: [cze][eng] Tato diplomová práce se zabývá výběrem a ověřením vhodných mitochondriálních markerů pro druhovou identifikaci měkkýšů rodu Cepaea. Byla provedena optimalizace metody izolace genomové DNA, PCR amplifikace s použitím mitochondriálních markerů 12S a 16S a metoda automatického sekvenování PCR produktů. Data získaná sekvenací byla vyhodnocena pomocí programů a SeqScape Software v2.7, Sequence Scanner Software v1.0, MEGA7 a databáze BLAST. Cílem práce je pomocí molekulárně-genetických metod ověřit, zda jsou pro rozlišení jednotlivých druhů páskovek vhodné mitochondriální markery 12S a 16S.This thesis deals with selection and verification of suitable mitochondrial markers for species identification of Cepaea molluscs. Optimisation of genomic DNA extraction method, PCR amplification using the 12S and 16S mitochondrial markers and automated sequencing of PCR products were performed. Data was evaluated using SeqScape Software v2.7, Sequence Scanner Software v1.0, MEGA7 programs and BLAST database. The aim of this thesis is to determinate whether the mitochondrial markers 12S and 16S are suitable for DNA barcoding of Cepaea.
Klíčová slova:
12S; 16S; biodiverzita; Cepaea; DNA barcoding