Název: Signal Based Processing Of Metagenomic Data From Nanopore Sequencing
Autoři: Kupková, Kristýna
Typ dokumentu: Příspěvky z konference
Jazyk: eng
Nakladatel: Vysoké učení technické v Brně, Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií
Abstrakt: The revolutionary sequencing technology introduced by Oxford Nanopore Technologies – MinION holds a great promise in the field of metagenomics due to its low cost, produced long reads and small size, which makes it available also for field work. The only problem preventing this technology from reaching its full potential is the lack of available computational tools for handling the produced data. Here we present an algorithm for processing of the raw signal sequences generated by nanopore sequencing for metagenomic purposes allowing to remove viral sequences from a contaminated metagenomic sample.
Klíčová slova: metagenomics; Oxford Nanopore; signal processing; WMS
Zdrojový dokument: Proceedings of the 23st Conference STUDENT EEICT 2017, ISBN 978-80-214-5496-5

Instituce: Vysoké učení technické v Brně (web)
Informace o dostupnosti dokumentu: Plný text je dostupný v Digitální knihovně VUT.
Původní záznam: http://hdl.handle.net/11012/187119

Trvalý odkaz NUŠL: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-414779


Záznam je zařazen do těchto sbírek:
Školství > Veřejné vysoké školy > Vysoké učení technické v Brně
Konferenční materiály > Příspěvky z konference