Original title: Vizualization of large biological tissue specimens using confocal laser scanning microscopy
Translated title: Vizualizace velkých biologických tkáňových vzorků s použitím laserové konfokální mikroskopie
Authors: Čapek, Martin ; Kubínová, Lucie ; Hána, K. ; Smrčka, P.
Document type: Papers
Conference/Event: Annual university-wide seminar WORKSHOP 2006 /13./, Prague (CZ), 2006-02-20 / 2006-02-24
Year: 2006
Language: eng
Abstract: [eng] [cze]
In biology there is often necessary to visualize a biological specimen which size is greater when compared with the field of view of a used optical acquisition instrument. The visualization of such the specimen can be achieved by volume reconstruction. We study biological specimens by using a confocal laser scanning microscope which is able to capture a digital volume representation of the specimen. We investigate great specimens containing, for example, a human tooth pulp, an epithelial layer and a vascular bed of chick embryonic gut or chick embryonic kidneys Objemová rekonstrukce je metoda sloužící k vizualizaci trojrozměrné struktury biologických vzorků, jejichž velikost může být větší než je horizontální či axiální zorné pole snímacího systému (v našem případě laserového konfokálního mikroskopu). Velké vzorky je nutné nařezat na tenké fyzické řezy. Pak se snímají všechny sousedící a překrývající se objemové obrazy v rámci jednotlivých fyzických řezů (kompenzace omezeného horizontálního zorného pole). Takové sousedící obrazy se dále získají pro všechny sériové fyzické řezy (kompenzace omezeného axiálního zorného pole)
Keywords: confocal microscopy; volume reconstruction; volume visualization
Project no.: CEZ:AV0Z50110509 (CEP), IAA100110502 (CEP), KJB6011309 (CEP), IAA600110507 (CEP)
Funding provider: GA AV ČR, GA AV ČR, GA AV ČR
Host item entry: Proceedings of Workshop 2006, ISBN 80-01-03439-9

Institution: Institute of Physiology AS ČR (web)
Document availability information: Fulltext is available at the institute of the Academy of Sciences.
Original record: http://hdl.handle.net/11104/0140812

Permalink: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-36400


The record appears in these collections:
Research > Institutes ASCR > Institute of Physiology
Conference materials > Papers