Název:
Studium molekulárních mechanismů udržujících stabilitu genomu
Překlad názvu:
Molecular mechanisms underlying maintenance of genome stability
Autoři:
Burdová, Kamila ; Janščák, Pavel (vedoucí práce) ; Cséfalvay, Eva (oponent) ; Krejčí, Lumír (oponent) Typ dokumentu: Disertační práce
Rok:
2014
Jazyk:
eng
Abstrakt: [eng][cze] Cells in our body are challenged every day by DNA damage arising as a result of both endogenous and exogenous insults. The ability of cells to repair DNA lesions is essential for correct propagation of genetic information. The most cytotoxic DNA lesion is DNA double-strand break (DSB) while oxidative DNA damage is one of the most frequent lesions. The aim of this thesis was to improve current the knowledge of the molecular mechanisms underlying the repair of DSBs and oxidative DNA damage. The major source of oxidative damage in cells are reactive oxygen species that are constantly generated as by-products of cell metabolism. One of the most frequent lesions is 7,8- dihydro-8-oxo-guanine (8-oxo-G) that gives rise to 8-oxo-G:A mispairs during DNA replication and if left unrepaired, results in accumulation of DNA mutations. We found that Werner helicase (WRN) physically interacts with DNA polymerase λ (Polλ) and stimulates DNA gap-filling by Polλ opposite to 8-oxo-G followed by strand displacement synthesis in MutY DNA glycosylase homolog (MUTYH) initiated base excision repair (BER) of 8-oxo-G:A mispairs. There are two major pathways involved in repair of DSBs: homologous recombination (HR) and non-homologous end joining (NHEJ). NHEJ is highly error-prone while HR is error-free. There are two...Buňky v našem těle jsou každý den vystaveny poškození DNA vlivem endogenních a exogenních faktorů. Schopnost buněk opravit poškozenou DNA je důležitá pro zachování genetické informace. Mezi nejvíce cytotoxické DNA léze patří dvojvláknové zlomy DNA. Oxidační poškození DNA je jednou z nejčastějších lézí. Cílem této práce bylo prohloubit stávající znalosti molekulárních mechanismů opravy dvojvláknových zlomů DNA a oxidačního poškození DNA. Hlavním zdrojem oxidačního poškození buněk jsou reaktivní formy kyslíku, které jsou neustále generovány jako vedlejší produkty buněčného metabolismu. Jednou z nejčastěji vznikajících modifikací DNA je 7,8-dihydro-8-oxo-guanin (8-oxo-G), jež se během replikace chybně páruje s adeninem. Pokud toto poškození není opraveno, dochází k akumulaci bodových mutací. Oxidační poškození DNA je opravováno převážně vystřižením porušené báze, tzv. "base excision repair" (BER). Při odstranění špatně inkorporovaného adeninu oproti 8-oxo-G dochází v prvním kroku k jeho vystřižení MutY DNA glykosylázou (MUTYH). Naše výsledky ukazují, že v následném kroku tohoto procesu opravy DNA WRN helikáza (WRN) fyzicky interaguje s polymerázou λ a stimuluje správné přiřazení cytosinu oproti 8-oxo-G a následnou syntézu DNA vedoucí k opravě poškozené DNA. Oprava dvojvláknových zlomů DNA má dvě...