Název: Výpočet atributů pro předpověď důsledku mutace na funkci proteinu
Překlad názvu: Attributes Calculating for Prediction of Effects of Mutation on Protein Function
Autoři: Matějíček, Jiří ; Burgetová, Ivana (oponent) ; Jaša, Petr (vedoucí práce)
Typ dokumentu: Bakalářské práce
Rok: 2009
Jazyk: cze
Nakladatel: Vysoké učení technické v Brně. Fakulta informačních technologií
Abstrakt: [cze] [eng]
Tato bakalářská práce se pohybuje v oblasti bioinformatiky a zabývá se problematikou získávání atributů proteinů užitečných pro předpověď vlivu mutace na jejich funkci. Práce má především za cíl vytvořit uživatelsky přívětivou aplikaci, která pomocí specializovaných algoritmů jako je FoldX umožní snadno získat atributy mutací ze sekvence a struktury proteinů. Vyvinutá aplikace poskytuje standardizované rozhraní, které umožňuje rozšiřovat sadu výpočetních metod a získat tak rozmanité sady atributů z různých zdrojů. Tyto sady pak mohou být vstupem predikčních metod a mohou tak přispět ke zlepšení predikce škodlivosti mutace. This bachelor thesis deals with the bioinformatics techniques for the acquisition of attributes useful for prediction of mutation effects on the protein function. The work primarily aims to develop a user-friendly application for calculation of attributes of mutations from the protein sequence and structure. The developed application serves for integration of specialized tools such as FoldX. The standardized interface enables to implement additional computational tools and collect a diverse set of attributes from different sources. These attribute sets can then serve as an input for different prediction methods and help to improve predictions of mutation effects.
Klíčová slova: ARFF; atribut; bioinformatika; DNA; FoldX; Genetika; mutace; PDB; predikce; protein; WEKA; ARFF; atribute; bioinformatics; DNA; FoldX; Genetics; mutations; PDB; prediction; protein; WEKA

Instituce: Vysoké učení technické v Brně (web)
Informace o dostupnosti dokumentu: Plný text je dostupný v Digitální knihovně VUT.
Původní záznam: http://hdl.handle.net/11012/54690

Trvalý odkaz NUŠL: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-237640


Záznam je zařazen do těchto sbírek:
Školství > Veřejné vysoké školy > Vysoké učení technické v Brně
Vysokoškolské kvalifikační práce > Bakalářské práce