Original title:
Stanovení anaerobní houby rodu Anaeromyces v mikrobiálním ekosystému metodou kvantitativní polymerázové reakce
Translated title:
Quantitative monitoring of anaerobic rumen fungus Anaeromyces in complex microbial ecosystem of anaerobic fermenter
Authors:
Fliegerová, Kateřina ; Mrázek, Jakub ; Štrosová, Lenka Document type: Methods
Year:
2012
Language:
cze Abstract:
[cze][eng] Cílem předkládaného metodického postupu je kvantitativní monitorování mikroskopické anaerobní vláknité houby rodu Anaeromyces ve složitém mikrobiálním ekosystému anaerobního fermentoru. Metoda je založena na kvantitativní PCR metodě s použitím primerů forward ITS1F a reverzního primeru. Amplifikace se provádí pomocí komerčního kitu qPCR 2x SYBR Master mixu (Top-Bio, ČR) na přístroji Mx3005P (Stratagene, USA).The aim of method is quantitative monitoring of anaerobic rumen fungus Anaeromyces in complex microbial ecosystem of anaerobic fermenter. Method is based on qPCR approach using following primer pair: forward ITS1F and reverse NeoQPCR rev. Amplification is performed using commercial kit qPCR 2x SYBR Master mix (Top-Bio, Czech Republic) by quantitative PCR cycler machine Mx3005P (Stratagene, USA).
Keywords:
Anaeromyces Project no.: QI92A286 (CEP) Funding provider: GA MZe
Institution: Institute of Animal Physiology and Genetics AS ČR
(web)
Document availability information: Fulltext is available at the institute of the Academy of Sciences. Original record: http://hdl.handle.net/11104/0212134