Název: Structural and functional characterization of giant plant Ogre-like retrotransposons
Překlad názvu: Structural and functional characterization of giant plant Ogre-like retrotransposons
Autoři: STEINBAUEROVÁ, Veronika
Typ dokumentu: Disertační práce
Rok: 2012
Jazyk: cze
Abstrakt: [cze] [eng]
Ogre elementy představují zvláštní skupinu rostlinných Ty3/gypsy LTR retrotranspozónů. Jejich charakteristickým rysem je přítomnost nadbytečného ORF s neznámou funkcí a nekódující sekvence nacházející se mezi proteázou a reverzní transkriptázou. Tato práce analyzuje sestřih této nekódující sekvence a zároveň se zabývá studiem nadbytečného ORF nejen u Ogre retrotranspozónů, ale i u celé skupiny Ty3/gypsy elementů. Ogre elements represent a distinct group of Ty3/gypsy LTR retrotransposons occurring in a range of dicot plants. They are characterized by two specific features ? presence of long extra open reading frame in 5´ untranslated region with unknown function and a non-coding sequence containing several stop codons separating protease and reverse transcriptase domains which was proposed to be removed by splicing. This thesis describes the functional analysis of intron splicing in Ogre retrotransposons. Further, it investigates additional coding information not only in Ogre retrotransposons but in the whole group of Ty3/gypsy retroelements.
Klíčová slova: gag-pol; LTR retrotranspozóny; nadbytečný ORF; rostlinný genom; sestřih; transkripce; additional ORFs; gag-pol; LTR retrotransposons; plant genome; splicing; transcription
Citace: STEINBAUEROVÁ, Veronika. Structural and functional characterization of giant plant Ogre-like retrotransposons. České Budějovice, 2012. disertační práce (Ph.D.). JIHOČESKÁ UNIVERZITA V ČESKÝCH BUDĚJOVICÍCH. Přírodovědecká fakulta

Instituce: Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích (web)
Informace o dostupnosti dokumentu: Plný text je dostupný v digitálním repozitáři JČU.
Původní záznam: http://www.jcu.cz/vskp/5078

Trvalý odkaz NUŠL: http://www.nusl.cz/ntk/nusl-112206


Záznam je zařazen do těchto sbírek:
Školství > Veřejné vysoké školy > Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích
Vysokoškolské kvalifikační práce > Disertační práce