|
|
Vztah struktury a funkce a využití RTX proteinů gramnegativních bakterií
Sadílková, Lenka
Označení RTX (Repeat in ToXin) spojuje početnou a stále se rozrůstající skupinu proteinů rozličných funkcí. Pro všechny její členy, mezi něž se řadí například toxiny, metaloproteasy, lipasy, proteiny S-vrstvy, bakteriociny a proteiny s dosud neobjasněnou funkcí, jsou typické následující charakteristiky: i) přítomnost nonapeptidové a na glycin bohaté vápník-vazebné konsensus sekvence GGXGXDX[L/I/V/W/Y/F]X (kde X může být jakýkoliv aminokyselinový zbytek) v různém počtu opakování (6-50) v C-koncové části proteinu; ii) k sekreci proteinu z buňky dochází bez přítomnosti periplasmatického intermediátu mechanismem zahrnujícím rozpoznání C-koncového sekrečního signálu proteiny asociovanými s cytoplasmatickou membránou, které následně exportují protein do kanálu procházejícího skrze celou bakteriální buněčnou stěnu ven z buňky (sekreční systém typu I); iii) geny pro syntézu strukturního proteinu, jeho aktivaci a sekreci jsou většinou uskupeny v tzv. RTX operonu. Nejrozsáhlejší skupinu rodiny RTX proteinů tvoří RTX toxiny. Většinou se jedná o proteiny o molekulové hmotnosti mezi 100-200 kDa, posttranslačně modifikované acylací mastnou kyselinou. Acylace je zprostředkována specifickým aktivačním proteinem. Tato posttranslační modifikace je naprosto nezbytná pro aktivaci molekuly toxinu a jeho funkci a...
|
|
|
Meningokokové infekce
Malá, Markéta ; Vejsová, Marcela (vedoucí práce) ; Konečná, Klára (oponent)
6 1. ABSTRAKT Autor: Markéta Malá Název: Meningokokové infekce Bakalářská práce Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Studijní obor: Zdravotnická bioanalytika Klíčová slova: Neisseria meningitidis, meningokok, meningokokcémie, meningitida Cíl: Cílem této bakalářské práce bylo shrnout poznatky o meningokokových infekcích a jejich původci, kterým je Neisseria meningitidis. Dále podat informace o vývoji v oblasti vakcín, léčby a diagnostiky meningokokových infekcí. Hlavní poznatky: N. meningitidis se dostává do organismu z nosohltanu, kde překonává epitelové buňky a vstupuje do krevního řečiště. Podle toho, jak výkonný je imunitní systém hostitele a o jaký kmen se jedná, dochází k rozvoji různě závažného meningokokového onemocnění. Meningokok má pro průnik do organismu účinné nástroje v podobě mnoha faktorů virulence. Při propuknutí nemoci je důležité včasné rozpoznání klinických projevů a rychlé laboratorní potvrzení původce. Dnes lze meningokokovým onemocněním již předcházet konjugovanou tetravalentní vakcínou v kombinaci s vakcínou proti séroskupině B. Závěry: Infekce způsobené N. meningitidis mají širokou škálu, zahrnují běžné nasofaryngitidy, bakterémii a smrtelné akutní hnisavé meningitidy. N. meningitidis je bakterie, která se přizpůsobila lidskému hostiteli jako žádná jiná. V...
|
|
|
Vztah struktury a funkce a využití RTX proteinů gramnegativních bakterií
Sadílková, Lenka
Označení RTX (Repeat in ToXin) spojuje početnou a stále se rozrůstající skupinu proteinů rozličných funkcí. Pro všechny její členy, mezi něž se řadí například toxiny, metaloproteasy, lipasy, proteiny S-vrstvy, bakteriociny a proteiny s dosud neobjasněnou funkcí, jsou typické následující charakteristiky: i) přítomnost nonapeptidové a na glycin bohaté vápník-vazebné konsensus sekvence GGXGXDX[L/I/V/W/Y/F]X (kde X může být jakýkoliv aminokyselinový zbytek) v různém počtu opakování (6-50) v C-koncové části proteinu; ii) k sekreci proteinu z buňky dochází bez přítomnosti periplasmatického intermediátu mechanismem zahrnujícím rozpoznání C-koncového sekrečního signálu proteiny asociovanými s cytoplasmatickou membránou, které následně exportují protein do kanálu procházejícího skrze celou bakteriální buněčnou stěnu ven z buňky (sekreční systém typu I); iii) geny pro syntézu strukturního proteinu, jeho aktivaci a sekreci jsou většinou uskupeny v tzv. RTX operonu. Nejrozsáhlejší skupinu rodiny RTX proteinů tvoří RTX toxiny. Většinou se jedná o proteiny o molekulové hmotnosti mezi 100-200 kDa, posttranslačně modifikované acylací mastnou kyselinou. Acylace je zprostředkována specifickým aktivačním proteinem. Tato posttranslační modifikace je naprosto nezbytná pro aktivaci molekuly toxinu a jeho funkci a...
|
|
|
Vztah struktury a funkce a využití RTX proteinů gramnegativních bakterií
Sadílková, Lenka ; Šebo, Peter (vedoucí práce) ; Stulík, Jiří (oponent) ; Weiser, Jaroslav (oponent)
Označení RTX (Repeat in ToXin) spojuje početnou a stále se rozrůstající skupinu proteinů rozličných funkcí. Pro všechny její členy, mezi něž se řadí například toxiny, metaloproteasy, lipasy, proteiny S-vrstvy, bakteriociny a proteiny s dosud neobjasněnou funkcí, jsou typické následující charakteristiky: i) přítomnost nonapeptidové a na glycin bohaté vápník-vazebné konsensus sekvence GGXGXDX[L/I/V/W/Y/F]X (kde X může být jakýkoliv aminokyselinový zbytek) v různém počtu opakování (6-50) v C-koncové části proteinu; ii) k sekreci proteinu z buňky dochází bez přítomnosti periplasmatického intermediátu mechanismem zahrnujícím rozpoznání C-koncového sekrečního signálu proteiny asociovanými s cytoplasmatickou membránou, které následně exportují protein do kanálu procházejícího skrze celou bakteriální buněčnou stěnu ven z buňky (sekreční systém typu I); iii) geny pro syntézu strukturního proteinu, jeho aktivaci a sekreci jsou většinou uskupeny v tzv. RTX operonu. Nejrozsáhlejší skupinu rodiny RTX proteinů tvoří RTX toxiny. Většinou se jedná o proteiny o molekulové hmotnosti mezi 100-200 kDa, posttranslačně modifikované acylací mastnou kyselinou. Acylace je zprostředkována specifickým aktivačním proteinem. Tato posttranslační modifikace je naprosto nezbytná pro aktivaci molekuly toxinu a jeho funkci a...
|
|
|
Integrated structural study of the FrpD protein from Neisseria meningitidis
SVIRIDOVA, Ekaterina
Neisseria meningitidis (N. meningitidis) is a Gram-negative commensal bacterium colonizing nasopharynx of about 10 % of healthy individuals, which can cause invasive diseases, such sepsis and meningitis, upon occasional penetration into bloodstream. Pathogenesis of N. meningitidis appears to be directly related to conditions of limited iron availability. Under these conditions two proteins of unknown function: FrpC and FrpD, are synthesized. FrpD is a highly conserved lipoprotein of N. meningitidis anchored to the bacterial outer membrane. It is known that FrpD tightly binds the FrpC protein, which belongs to the Repeat-in-Toxin (RTX) protein family and may act as bacterial exotoxin. However, the mechanism of FrpD-FrpC interaction and the exact function of this complex are unknown due to the absence of structural information on these proteins. Therefore, we set out to determine the structure of FrpD and provide insights into its interaction mechanism with FrpC and structure-functional relationships of these two proteins. We determined the first crystal and solution structures of the FrpD protein. We found that atomic structures of FrpD reveal a novel protein fold. We uncovered the structure-function relationships underlying the mechanism of interaction between the FrpD and FrpC proteins and tested the putative function of the FrpD-FrpC1-414 complex in vitro. Finally, we proposed the putative function of the FrpD-FrpC1-414 complex as a new minor adhesin of N. meningitidis, which mediates the bacterial adhesion to the host epithelial cells and facilitate the colonization. Our work constitutes the first step in clarifying the molecular basis of the FrpD-FrpC interaction and sets the base for further investigation of the role of FrpD and FrpC in the virulence mechanism of N. meningitidis.
|
|
|
Invazivní meningokoková onemocnění v podmínkách přednemocniční neodkladné péče
MASOPUSTOVÁ, Jana
Invazivní meningokokové onemocnění je jednou z nejobávanějších infekčních chorob v České Republice. Jedná se o stav, kdy je člověk napaden některým ze sérotypů bakterie Neisseria meningitidis, která způsobuje životu nebezpečnou meningokokovou sepsi. Infekce meningokokového typu řadíme i v dnešní vyspělé medicíně bohužel ke světovým zdravotnickým problémům. Život ohrožující forma invazivního meningokokového onemocnění vede bez léčby k úmrtí. Cílem práce bylo zmapovat znalosti postupů zdravotnických záchranářů v souvislosti s invazivním meningokokovým onemocněním v podmínkách přednemocniční neodkladné péče, kteří se s tímto onemocněním většinou potkávají v první linii. Práce se zaměřila v kvantitativním šetření na pracovníky Zdravotnické záchranné služby Jihočeského kraje. Byla použita technika dotazníku, která nám pomohla zmapovat znalosti postupů zdravotnických záchranářů v souvislosti s invazivním meningokokovým onemocněním. Z výsledků výzkumu vyplynulo, že zdravotničtí záchranáři jsou skutečně znalí postupů v přednemocniční neodkladné péči. Většina otázek v dotazníkovém šetření byla zodpovězena nadprůměrně správně. Kontrolními otázkami se povedlo také odhalit drobné nedostatky jako nedostatečnost školení této problematiky ze strany zaměstnavatele a možnosti zpětné vazby dalšího osudu klienta převáženého s tímto onemocněním. Myslím si, že toto specifické onemocnění svou rychlou invazivitou v organismu vyžaduje důkladnou znalost z pohledu zdravotnického personálu, což se povedlo verifikovat. Tímto se potvrdilo, že zdravotničtí záchranáři Jihočeského kraje jsou připraveni poskytovat odbornou zdravotnickou péči našim pacientům s co největší odborností a profesionalitou.
|
|
|
Porovnání metod stanovení Neisseria meningitidis v Nemocnici ČB a.s.
SKOŘEPOVÁ, Lucie
Molekulárně biologické metody mají velký význam pro běžnou diagnostiku infekčních onemocnění. V této práci byly porovnávány dvě molekulárně biologické metody pro diagnostiku Neisseria meningitidis v Nemocnici ČB a.s.. Při stanovení hypotézy jsem vycházela z předpokladu, že real-time PCR je rychlejší než nested PCR. Obě tyto metody se používají v Nemocnici ČB a.s. pro diagnostiku Neisseria meningitidis. Během experimentu jsem zjistlila, že se v Nemocnici ČB a.s. používá jiná rychlejší metoda - latexová aglutinace, která vykazuje oproti molekulárně biologickým metodám vyšší procento falešně negativních výsledků. Tyto falešně negativní výsledky mohou být způsobeny napřiklad degradací Neisseria meningitidis ve vzorku. Usmrcení Neisseria meningitidis neovlivňuje výsledky molekulárně biologických metod, neboť stanovují bakteriální DNA narozdíl od latexové aglutinace, která prokazuje imunologickou reakci živé bakterie. U jednotlivých metod PCR jsem porovnávala čas potřebný pro průkaz Neisseria meningitidis. Experimentem jsem potvrdila, že real-time PCR je rychlejší než nested PCR. Dále jsem zjistila, že real-time PCR je o jeden řád citlivější než nested PCR.
|
|
| |
|
| |
|
| |
host ::
RSS.