|
|
The role of microRNA in physiology and pathology
Janáková, Barbora ; Matoušková, Petra (vedoucí práce) ; Pávek, Petr (oponent) ; Dostálová Merkerová, Michaela (oponent)
Univerzita Karlova Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra biochemických věd Kandidát: Mgr. Barbora Hanousková Školitel: doc. Ing. Petra Matoušková, Ph.D. Název disertační práce: Úloha mikroRNA ve fyziologii a patologii MikroRNA (miRNA), malé jednořetězcové nekódující molekuly RNA, se významně podílejí na regulaci genové. Jsou evolučně vysoce konzervované a vyskytují se v genomu všech eukaryotických organismů, což naznačuje jejich důležitost ve fyziologických procesech. Vzhledem k jejich tkáňové specifitě a zapojení do patogeneze různých onemocnění jsou miRNA hojně studované v souvislosti s jejich potenciálním využitím jako specifických a časných biomarkerů, případně jako terapeutický cíl. Disertační práce, sepsána formou komentovaného souboru publikací se zabývala studiem miRNA v různých systémech in vitro a in vivo se zaměřením na jejich roli v adipogenezi i jejich využití jako biomarkerů patologických stavů. Práce v úvodu shrnuje teoretické informace o epigenetické regulaci s detailnějším zaměřením na miRNA. Pak následují komentáře k jednotlivým publikacím autorky a stručné závěry. Ve dvou studiích využívajících myší modely bylo odhaleno několik miRNA, jejichž expresní profil byl důsledkem patologického stavu změněn, a které by bylo zajímavé studovat hlouběji. Například ve studii zaměřené...
|
|
|
Novel bile acid derivatives as a promising therapeutic approach for liver and metabolic disorders
Štefela, Alžbeta ; Pávek, Petr (vedoucí práce) ; Vítek, Libor (oponent) ; Juřica, Jan (oponent)
V ČESKÉM JAZYCE Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmakologie a toxikologie Kandidát: Mgr. Alžbeta Štefela Školitel: Prof. PharmDr. Petr Pávek, PhD. Název disertační práce: Nové deriváty žlučových kyselin jako slibný terapeutický přístup jaterních a metabolických onemocnění Žlučové kyseliny (ŽK) jsou amfipatické steroidní molekuly, které, jak je obecně známo, usnadňují trávení a vstřebávání lipidů a látek rozpustných v tucích. Kromě toho, nedávný výzkum ukázal, že ŽK představují důležité signalizační molekuly zapojené do řízení lipidového, glukózového a energetického metabolismu a imunitní odpovědi. ŽK vykazují tyto role aktivací intracelulárních jaderných receptorů, jako jsou receptory farnesoidní X (FXR), pregnanový X (PXR) anebo vitaminový D receptory. Navíc, ŽK fungují jako endokrinní signální molekuly a aktivují řadu biologických kaskád prostřednictvím membránového receptoru spojeného s G-proteinem, nazývaného jako TGR5. V důsledku těchto zjištění, struktura ŽK byla extenzívně modifikována s cílem identifikovat sloučeniny se specifickým zaměřením na výše zmíněné receptory jako slibný terapeutický přístup k léčbě různých jaterních a metabolických poruch včetně cholestázy, biliární cirhózy, nealkoholické steatohepatitidy nebo cukrovky. Hlavním cílem této...
|
|
|
Novel bile acid derivatives as a promising therapeutic approach for liver and metabolic disorders
Štefela, Alžbeta ; Pávek, Petr (vedoucí práce) ; Vítek, Libor (oponent) ; Juřica, Jan (oponent)
V ČESKÉM JAZYCE Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmakologie a toxikologie Kandidát: Mgr. Alžbeta Štefela Školitel: Prof. PharmDr. Petr Pávek, PhD. Název disertační práce: Nové deriváty žlučových kyselin jako slibný terapeutický přístup jaterních a metabolických onemocnění Žlučové kyseliny (ŽK) jsou amfipatické steroidní molekuly, které, jak je obecně známo, usnadňují trávení a vstřebávání lipidů a látek rozpustných v tucích. Kromě toho, nedávný výzkum ukázal, že ŽK představují důležité signalizační molekuly zapojené do řízení lipidového, glukózového a energetického metabolismu a imunitní odpovědi. ŽK vykazují tyto role aktivací intracelulárních jaderných receptorů, jako jsou receptory farnesoidní X (FXR), pregnanový X (PXR) anebo vitaminový D receptory. Navíc, ŽK fungují jako endokrinní signální molekuly a aktivují řadu biologických kaskád prostřednictvím membránového receptoru spojeného s G-proteinem, nazývaného jako TGR5. V důsledku těchto zjištění, struktura ŽK byla extenzívně modifikována s cílem identifikovat sloučeniny se specifickým zaměřením na výše zmíněné receptory jako slibný terapeutický přístup k léčbě různých jaterních a metabolických poruch včetně cholestázy, biliární cirhózy, nealkoholické steatohepatitidy nebo cukrovky. Hlavním cílem této...
|
|
|
Vliv biotransformace a transportu na účinky chemoterapie a prognózu rakoviny prsu
Hubáčková, Miluše ; Souček, Pavel (vedoucí práce) ; Pávek, Petr (oponent) ; Janatová, Markéta (oponent)
Vliv biotransformace a transportu na účinky chemoterapie a prognózu rakoviny prsu Abstrakt: Úvod: Cílem této práce bylo sledování vlivu biotransformačních enzymů a enzymů mnohočetné lékové rezistence na prognózu a účinky chemoterapie u pacientek s karcinomem prsu. První část se zabývala genetickými faktory, a to vlivem genetických polymorfismů ve vybraných biotransformačních genech a v genu ABCB1 a jejich vlivu na vznik a prognózu karcinomu prsu. V další části byly analyzovány expresní profily těchto genů a jsou sledovány jejich případné vztahy ke genotypu, prognóze, a predikci odpovědi na onkologickou léčbu. Materiál a metody: Polymorfismy biotransformačních genů byly stanoveny pomocí real- time PCR a polymorfismy genu ABCB1 byly stanoveny pomocí metody NanoChip Assay, která byla provedena na spolupracujícím pracovišti. V obou případech byly polymorfismy stanoveny v DNA získané z krve pacientek. Exprese genů byly stanoveny metodou kvantitativní real-time PCR v párových vzorcích nádorové a okolní nenádorové tkáně. Exprese proteinu NQO1 a p53 byla stanovena imunohistochemicky ve vzorcích nádorové tkáně. Výsledky: Frekvence studovaných polymorfismů se významně nelišily od dříve publikovaných výsledků, zajímavým však byl SNP SOD3 rs1799895, u kterého nebyly nalezeny nosičky variantní alely. Pro gen NQO1 byly v...
|
|
|
Kvantitativní analýza inhibitorů tyrozinkinázy metodou kapalinové chromatografie s hmotnostní detekcí
Maier, Jan ; Pávek, Petr (vedoucí práce) ; Lochman, Lukáš (oponent)
Předložená diplomová práce je věnována kvantitativnímu stanovení inhibitorů tyrozinkinázy, konkrétně imatinibu a nilotinibu, metodou kapalinové chromatografie s hmotnostní detekcí. Za účelem sledování hladin těchto léčivých látek v séru či plazmě zejména pacientů s chronickou myeloidní leukémií, v menší míře pak pacientů s gatrointestinálním stromálním tumorem, byla na Ústavu klinické biochemie a diagnostiky Fakultní nemocnice v Hradci Králové vyvinuta nová metoda pro jejich stanovení a monitorování. Hlavním úkolem v souladu s vypracováváním diplomové práce bylo metodu plně optimalizovat a validovat. Tato metoda pro stanovení inhibitorů tyrozinkinázy byla na pracovišti nejdříve prováděná pomocí vysokoúčinné kapalinové chromatografie se spektrofotometrickou (UV) detekcí. V rámci modernizace laboratorní technologie se postupem času přešlo na metodu prováděnou pomocí vysokoúčinné kapalinové chromatografie s hmotnostní detekcí. Analyty s jejich vnitřními standardy byly nejprve zpracovány extrakčním postupem kapalina-kapalina, poté byly isokraticky separovány na koloně C18 s reverzní fází. Následně byly oba analyty detekovány s využitím tandemové hmotnostní spektrometrie typu trojitého kvadrupólu s ESI iontovým zdrojem v pozitivním módu. V rámci validace metody byla ověřena její preciznost a správnost,...
|
|
|
Farmakologické ovlivnění nukleárních receptorů při terapii diabetes mellitus
Draský, Jakub ; Pávek, Petr (vedoucí práce) ; Bárta, Pavel (oponent)
Univerzita Karlova Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmakologie a toxikologie Student: Jakub Draský Školitel: prof. PharmDr. Petr Pávek, Ph.D. Název diplomové práce: Farmakologické ovlivnění nukleárních receptorů při terapii diabetes mellitus Nukleární receptory přísluší do superrodiny transkripčních faktorů, mezi jejich hlavní funkce patří regulace exprese cílových genů. Ve svojí práci jsem se věnoval hlavně skupině sirotčích receptorů, konkrétně pregnanovému X receptoru (PXR) a konstitutivnímu androstanovému receptoru (CAR). Společným znakem těchto receptorů je jejich aktivace pomocí specifického ligandu. CAR i PXR mají nezbytnou funkci jako biologické senzory hydrofobních xenobiotik, když indukují enzymy I. a II. fáze metabolismu. Zásadní význam mají také při regulaci glukoneogeneze, inzulínové odpovědi, adipogeneze, homeostáze cholesterolu, mastných kyselin, triglyceridů a glykogenu. Cílem této experimentální práce bylo zavést metodu luciferázové reportérové eseje pro dva DNA konstrukty obsahující promotorovou oblast genů PEPCK a CYP7A1. Pro aktivaci PXR jsme použili známého agonistu rifampicin a antagonistu SPA70. Jako agonistu CAR receptoru jsme použili látku CITCO. Funkčnost metody luciferase reporter gene assay jsme si nejdříve ověřili s luciferázovým vektorem pro gen CYP3A4....
|
|
|
Viral hepatitis: novel insights and novel therapeutic interventions.
Davidovová, Eva ; Pávek, Petr (vedoucí práce) ; Trejtnar, František (oponent)
Univerzita Karlova Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra Farmakológie a toxikológie Študentka: Bc. Eva Davidovová Školiteľ: prof. PharmDr. Petr Pávek, Ph.D. Názov diplomovej práce: Vírusové hepatitídy: nové poznatky a nové možnosti liečby. Vírusové hepatitídy sú všeobecne známym celosvetovým problémom. Vírus hepatitídy B (HBV) a vírus hepatitídy C (HCV) sú charakteristické vznikom závažných komplikácií, najmä čo sa týka prechodu do chronického štádia ochorenia, ktoré je spojené s rozvojom fibrózy, cirhózy a hepatocelulárneho karcinómu (HCC). Interakcie medzi vírusmi a hostiteľskými bunkami sú vcelku komplikované a nie vždy úplne pochopené. Vo všeobecnosti je infekčný cyklus vírusov viackrokovým procesom. Bližšie pochopenie celého životného cyklu vírusu je hlavným predpokladom na vynájdenie účinných liečiv. Vírusová hepatitída B a C bola dlhú dobu liečená najmä interferónom alfa. Neskôr sa pridal do liečby HCV aj ribavirín a pri HBV sa začali používať nukleozidové / nukleotidové analógy (NA). Interferón sa neskôr pegyloval, čím sa jeho vlastnosti vylepšili. Tieto liečivá však neposkytovali dostatočnú účinnosť a navyše boli spojené s množstvom nežiadúcich účinkov. Práve kvôli týmto nevýhodám doterajšej liečby sa vyvinula snaha na vynájdenie nových a účinnejších terapeutík. Vynájdenie nových...
|
|
|
DNA methylation changes in oropharyngeal carcinoma
Birknerová, Natália ; Matoušková, Petra (vedoucí práce) ; Pávek, Petr (oponent)
utická fa á é Katedra biochemických věd Kandidát: Natália Birknerová Školitel: doc. Petra Matoušková, Ph.D. Název diplomové práce: Zmeny v metylácií DNA u orofaryngeáneho karcinó Orofaryngeálny karcinóm sa radí medzi karcinómy hlavy a krku, ktoré sú siedmym ajčastejším malígnym ochorením v celosvetovom meradle. Prevažná väčšina ( sú karcinómy skvamóznych buniek. Orofaryngeálny karcinóm zahŕňa nádory jazyka, mandlí, mäkkého podnebia a hltanu. tradičných rizikových v, ľudský papillomavírus bol aný ako ďalší rizikový faktor pre vývoj týchto nádorov. Epigenetické zmeny sú dedičné zmeny v génovej expresii, pri ktorých nedochádza k zmenám môžu prispievať ku karcinogenéze. Zahrňujú DNA metyláciu, modifikáciu histónov transkripčnú génovú reguláciu pomocou mi Cieľom tejto štúdie bolo preskúmať hladiny metylácie vybraných tumor supresorových génov u spinocelulárneho karcinómu orofaryngeálnych buniek (OPS v porovnaní s nenádorovým kontrolnými Hladiny metylácie DNA vybraných tumor supresorových génov boli analyzované metylačne špecifi amplifikáci sond záv slej od ligácie (MS MLPA) v nádorových vzorkách ich prislúchajúcich metastázach, nemetastázujúcich nádorových vzorkách a kontrolných vzorkách (nenádorové mandle). Pomocou 15% medznej hodnoty pre metyláciu sme pozorovali štatisticky významne vyššiu metyláciu v génoch...
|
|
|
Změny exprese dlouhých nekódujících RNA u hepatocelulárního karcinomu
Krhutová, Magdaléna ; Pávek, Petr (vedoucí práce) ; Matoušková, Petra (oponent)
Univerzita Karlova Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra Farmakologie a toxikologie Studentka: Bc. Magdaléna Krhutová Školitel: prof. PharmDr. Petr Pávek, Ph.D. Název diplomové práce: Změny exprese dlouhých nekódujících RNA u hepatocelulárního karcinomu Hepatocelulární karcinom (HCC) je globálně jedním z vysoce prevalentních nádorových onemocnění, jehož počet případů, tak jako počet úmrtí na něj, každoročně narůstá. Molekulární mechanismy vzniku HCC jsou intenzivně studovány, avšak stále nejsou plně pochopeny. Mimo genetických vlivů se na patogenezi HCC podílí i vlivy epigenetické. Dlouhé nekódující RNA (lncRNA) jsou molekuly RNA bez schopnosti kódovat proteiny a s délkou minimálně 200 nukleotidů. Řada studií odhalila lncRNA zapojené do tumorigeneze prostřednictvím vazby na DNA, RNA i proteiny. Nové studie ukazují také na významné změny v expresi biotransformačních enzymů u HCC a i zde na interakce s mikroRNA (miRNA) a lncRNA. Předkládaná diplomová práce se věnuje problematice dlouhých nekódujících RNA ve vztahu k HCC. Shrnuje epidemiologickou situaci, rizikové faktory, aktuální možnosti diagnostiky a terapie tohoto onemocnění. Dále se zabývá genetickými a epigenetickými mechanismy přispívajícími k rozvoji HCC, se zaměřením na miRNA a lncRNA. Předmětem studia této problematiky je také...
|
|
|
The impact of apixaban on overall hemostatic potential.
Cablíková, Ladislava ; Pávek, Petr (vedoucí práce) ; Carazo Fernández, Alejandro (oponent)
Univerzita Karlova Farmaceutická fakulta v Hradci Králové Katedra farmakologie a toxikologie Studentka: Bc. Ladislava Cablíková Školitelé: Ass. Prof. Mojca Božič-Mijovski, Ph.D., prof. PharmDr. Petr Pávek, Ph.D., RNDr. Jana Nekvindová, Ph.D. Název diplomové práce: Vliv apixabanu na celkový hemostatický potenciál Poruchy na určitých úrovních komplikovaného hemostatického systému mohou vést jak ke krvácení, tak i k nadměrnému srážení krve. Tyto patologické stavy jsou léčeny antikoagulačními látkami, které svým působením korigují nadměrnou koagulaci. Ovšem tradiční antikoagulační léčba nese nemálo omezení, tudíž bylo snahou vyvinout orální antikoagulancia, která by vykazovala lepší profil. Antikoagulancii nové generace jsou tzv. přímá perorální antikoagulancia - Direct Oral AntiCoagulans, zkráceně DOAC. Apixaban, jako jeden z xabanů, má předvídatelnou farmakokinetiku a farmakodynamiku, a proto nevyžaduje běžné laboratorní monitorování účinku léčby. V naléhavých klinických situacích je ovšem jeho vyhodnocení nezbytné. Klasické screeningové testy koagulace, jako je PT (protrombinový test) a APTT (aktivovaný parciální tromboplastinový test) plně neodrážejí skutečný stav léčiva. Proto je snahou nalézt relativně jednoduchý a rychlý hemostatický test korelující se skutečným stavem pacienta. Jedním z nich by...
|
host ::
RSS.