|
|
Human parvovirus B19 genotype study among the patients of Motol Univeristy Hospital
Dubišová, Mária ; Hubáček, Petr (vedoucí práce) ; Limberková, Radomíra (oponent)
Parvovírus B19 je bežný ľudský patogén, ktorý typicky infikuje erytroidné progenitory a spôsobuje hematologické problémy ako sú najmä anémia a aplastická kríza. Klinická manifestácia pacienta najčastejšie závisí od jeho imunologického statusu. U imunokompromitovaných pacientov po transplantácií môže spôsobiť závažné klinické problémy. V tejto práci bolo testovaných viac ako 1500 vzoriek od 90 pacientov, ktorí v roku 2015 podstúpili HSCT, na prítomnosť PVB19. Práca popisuje incidenciu vírusu a zároveň dve typické obdobia nástupu infekcie u pacientov po transplantácií. Napriek tomu, že viaceré zdroje uvádzajú negatívny vplyv infekcie PVB19 na prežitie alogenného štepu pacientov, táto práca toto tvrdenie nepotvrdila. Taktiež výsledky tejto práce naznačujú, že alogénny-štep nie je zdrojom transmisie, ale že sa jedná pravdepodobne o reaktiváciu po dlhodobej perzistentnej, prípadne latentnej, PVB19 infekcií. PVB19 sa člení do 3 genotypov. Genotyp 1 je najrozšírenejší, genotyp 2 je za posledné 10-ročia v oblastiach Európy veľmi vzácny a genotyp 3 sa vyskytuje najmä v tropických lokalitách. Táto práca ako prvá popisuje rozloženie genotypov v Českej republike. Viac ako 130 vzoriek od 125 PVB19 pozitívnych pacientov, uskladnených vo FN Motol od roku 2004 do 2017, bolo genotypizovaných na základe analýzy...
|
|
| |
|
|
Detection and pathological impact of human Parvovirus B19 in the general population and in the immunocompromissed host
Dubišová, Mária ; Hubáček, Petr (vedoucí práce) ; Šmahelová, Jana (oponent)
Parvovírus B19 je neobalený jednovláknový DNA vírus, patriaci do čeľade Parvoviridae. Parvovírusy sú jedny z najmenších DNA vírusov, pričom viaceré z nich sú schopné infikovať ľudí. Infekciu parvovírusom B19 prekonala väčšina ľudí , no u zdravých jedincov prebieha zvyčajne bez ťažkostí. Najčastejšie sú infikované deti, u ktorých symptomatická infekcia vyvoláva piatu detskú chorobu - erythema infectiosum (EI), avšak u pacientov s oslabenou imunitou, u pacientov s poruchami krvotvorby a tiež u tehotných žien môžu nastať vážne komplikácie. Táto práca sa zameriava na štruktúru vírusu, priebeh infekcie, infekčné ochorenia vyvolané parvovírusom B19 a jednotlivé genotypy, pričom hlavný dôraz je kladený na patogenéziu konkrétnych ochorení. Kľúčové slová: Parvovírus B19, jednovláknový DNA vírus, progenitor erytroidných buniek, Gb4, imunokompromitovaný hostiteľ, anémia
|
|
|
Metylace regulačních oblastí HPV 16 u tonsilárních karcinomů s integrovanou a extrachromozomální formou viru
Pokrývková, Barbora ; Tachezy, Ruth (vedoucí práce) ; Hubáček, Petr (oponent)
Lidské papilomaviry jsou spojeny s indukcí karcinomu hrdla děložního a řadou dalších karcinomů v anogenitální oblasti a také s významnou částí nádorů hlavy a krku. Přítomnost virových onkoproteinů E6 a E7 může v buňce navodit trasnformovaný stav, jejich zvýšená hladina je způsobena inaktivací regulačního proteinu E2. Předmětem současného studia jsou mechanismy, kterými je inaktivace E2 způsobena. Jednou z možností je integrace virové DNA do genomu hostitele, ke které dochází v oblasti genu E2. Byly však nalezeny karcinomy, kde se virus nachází v extrachromozomální formě. Ukazuje se, že při vzniku tohoto typu nádorů mohou hrát roli epigenetické změny, zejména DNA metylace, či mutace v regulační oblasti viru. Byla provedena analýza stupně metylace u vzorků tonsilárních karcinomů s extrachromozomální a integrovanou formou viru, dále v obou skupinách porovnána virová nálož a potvrzena exprese E6 a E7 genu. Výsledky metylační analýzy ukazují zvýšenou metylaci viru s integrovanou DNA, avšak pro některé oblasti nejsou signifikantní. Mutace ve vazebných místech E2 proteinu jsme neodhalili. Exprese virových onkogenů byla potvrzena u všech nádorů bez ohledu na formu virového genomu. Mechanismus indukce nádorů, zejména pro virus s extrachromozomální formou viru, zůstává předmětem dalšího výzkumu. Klíčová...
|
|
|
Genotypová analýza lidského cytomegaloviru u pacientů po allogenní transplantaci kmenových buněk krvetvorby.
Javornická, Tereza ; Hubáček, Petr (vedoucí práce) ; Španielová, Hana (oponent)
U pacientů po alogenní transplantaci hematopoetických kmenových buněk (HSCT) je lidský cytomegalovirus (CMV) jedním z nejzávažnějších virových patogenů. Jeho bližší určení by mohlo poskytnout informace o vlivu jednotlivých CMV genotypů na celkové přežití pacienta a některé závažné komplikace, jako je například reakce štěpu proti hostiteli (GvHD). Tato diplomová práce se zabývá retrospektivní genetickou analýzou 1877 vzorků od pacientů transplantovaných na Klinice dětské hematologie a onkologie FN Motol a Ústavu hematologie a krevní transfúze od roku 2002. DNA z biologických vzorků (především plné krve) byla izolována kitem Qiagen Blood DNA Mini, případně Qiagen DNA Mini a ve vzorcích byla prospektivně detekována přítomnost CMV DNA. Vzorky byly následně uchovány při -20 řC. Genotypizace byla provedena pomocí real-time PCR technologie zaměřené na geny 2 strukturních proteinů glykoproteinu B a glykoproteinu H za použití sekvenčně specifických primerů a sond. U 1343 vzorků (71,6 %) od 390 pacientů jsme prokázali infekci pouze jedním kmenem CMV, u 256 (13,6 %) vzorků od 113 pacientů jsme prokázali smíšenou infekci, způsobenou dvěma a více kmeny CMV. Nejčastěji prokázaný genotyp v "single" infekci byl u dětských i dospělých pacientů gB1/gH2 detekovaný u 118 (28,4 %) pacientů. Nejčastěji prokázanou...
|
|
|
Detekce lidských respiračních DNA virů ve vzorcích dýchacích cest u imunokompromitovaných pacientů.
Blagoevová, Kateřina ; Hubáček, Petr (vedoucí práce) ; Hirsch, Ivan (oponent)
Onemocnění respiračního traktu patří k nejběžnějším onemocněním vyskytujícícm se v dětské i dospělé populaci po celém světě. Nejčastěji je způsobováno viry. U zdravých imunokompetentních jedinců je průběh onemocnění způsobeného infekcí respiračních virů zpravidla bez větších komplikací. Jinak je tomu u imunokompromitovaných pacientů, jako jsou například pacienti po transplantacích, které i běžné infekce mohou ohrožovat na životě. Polyomaviry KI (KIPyV) a WU (WUPyV) a lidský bocavirus (HBoV) jsou nejčastěji detekovány v respiračních vzorcích od dětí s akutním respiračním onemocněním a u imunosuprimovaných pacientů, nicméně jejich patogeneze je stále nejasná. V této práci bylo retrospektině testováno na přítomnost KIPyV, WUPyV a HBoV pomocí kvantitativní real-time PCR 822 (745 od dospělých a 77 od dětí) vzorků z dýchacích cest od 380 (326 dospělých a 54 dětí) imunokomprimovaných pacientů a 84 vzorků periferní krve. Nejčastěji se vyskytoval HBoV (6,32 % pozitivních pacientů), dále KIPyV (5,79 % pozitivních pacientů)a WUPyV (0,53 % pozitivních pacientů). Pouze HBoV byl součastně detekován i v několika vzorcích krve. Studie potvrdila výskyt polyomavirů WU a KI a lidského bocavirus v české populaci a to u dětských i dospělých imunosuprimovaných pacientů. Klíčová slova: respirační virus, lidský bocavirus,...
|
|
|
Výskyt a biologická souvislost chromozomálně integrovaného šestého lidského herpesviru (HHV6) v české populaci
Hrdličková, Alena ; Hubáček, Petr (vedoucí práce) ; Lengerová, Martina (oponent)
7 Abstrakt Šestý lidský herpesvirus (HHV-6) je komplexem dvou blízce příbuzných DNA virů: HHV- 6A a HHV-6B. Primoinfekce probíhá už v raném dětském věku ať již ve formě šesté exantémové nemoci, nebo asymptomaticky. Oba viry HHV-6 jsou schopny se rekombinačními mechanismy integrovat do lidského genomu. Tato vlastnost je vzhledem k ostatním lidským herpetickým virům jedinečná. Tato diplomová práce se věnuje studiu Ci-HHV-6 ve zdravé populaci a ve skupině s maligním onemocněním. Testovali jsme 812 pacientů s maligním onemocněním a 420 osob ze zdravé populace. Přítomnost HHV-6 DNA jsme určili pomocí real-time PCR, lokalizaci integrace viru jsme pak detekovali pomocí fluorescenční hybridizace in situ (FISH). Srovnávací studií jsme nezjistili statisticky významný rozdíl ve frekvenci Ci-HHV-6 u pacientů s maligním onemocněním (1,11%) a zdravé kontrolní skupiny (0,95%) (P=0,8). U potvrzených integrací jsme dále prokázali dědičnost tohoto fenoménu u rodinných příslušníků. Pomocí FISH jsme lokalizovali Ci-HHV-6 do telomerických oblastí chromozomů 2 a 18. Otestovali jsme také tvorbu virových proteinů u nosičů Ci-HHV-6 pomocí detekce mRNA. V rámci této práce jsme provedli první epidemiologickou studii výskytu Ci-HHV-6 v populaci zdravých dárců v České republice a zavedli jsme nové metody k lepší charakteristice tohoto...
|
|
| |
|
|
DNA virové infekce u pacientů po alogenní transplantaci kostní dřeně"
Hubáček, Petr ; Cinek, Ondřej (vedoucí práce) ; Šterzl, Ivan (oponent) ; Mayer, Jiří (oponent) ; Žák, Pavel (oponent)
Infekční komplikace jsou po alogenní transplantaci hematopoetických kmenových buněk (HSCT) velmi časté. Mimo bakteriálních a mykotických infekcí, se u těchto pacientů na morbiditě a mortalitě podílí významně také virové infekce. Z nich jsou pak nejčastější infekce DNA viry. Od ledna 2001 do října 2008 jsme vyšetřili vzorky od 217 dětských a 382 dospělých pacientů po alogenní HSCT. Vyšetřili jsme celkem 15 757 vzorků (medián 31 vzorků u dětí, 20 u dospělých). Z nich bylo 14 867 vzorků periferní krve a 890 vzorků dalších biologických materiálů (moč, stolice, likvor apd.). Kvantita HSV, VZV, CMV, HHV-6, HHV-7, EBV, adenovirů skupin A-C, BKV a genu lidského albuminu byla ve vzorcích testována pomocí kvantitativní real-time PCR. V případě CMV, HHV-6, HHV-7 a EBV jsme výsledky normalizovali na 10 000 lidských genomických ekvivalentů. HSV a VZV jsme detekovali pouze v malém počtu vzorků. Hranici virostatické terapie CMV reaktivace 100 normalizovaných kopií jsme detekovali u 55 dětí a 123 dospělých, z nich se přes terapii symptomatická CMV nemoc objevila u 68 pacientů. Pokročilá CMV nemoc samostatně, či v souvislosti s dalšími komplikacemi po HSCT se pak projevila u 20 pacientů, u 17 s fatálními následky. U 4 dětských pacientů jsme také prokázali výskyt ganciklovir rezistentní mutanty CMV, což vedlo k modifikaci...
|
|
|
Restaurace s vyhlídkou
Bittman, Jaroslav ; Hubáček, Petr (oponent) ; Hubáčková, Blažena (vedoucí práce)
Cílem zadaného tématu diplomové práce „ Restaurace s vyhlídkou“ je vypracovat projektovou dokumentaci pro provedení stavby. Objekt se nachází v městské části Brno – Veveří. Jedná se o novostavbu, na místě nynější autodílny ležící na konci ulice Rybkova. Objekt má dvě nadzemní podlaží. Nosný systém je kombinací nosného zdiva z keramických tvárnic Porotherm a monolitického železobetonového skeletu. Skelet je tvořen sloupy a podélnými průvlaky. Strop tvoří monolitická železobetonová deska. Střechy nad oběma podlažími jsou ploché pochůzné, s hydroizolační vrstvou z modifikovaných asfaltových pásů a pochůznou vrstvou z betonové dlažby na rektifikačních terčích. Projekt řeší také přípravu na možné umístění dřevěné rozhledny na střechu druhého nadzemního podlaží. Dřevěná rozhledna byla řešena pouze v rámci studie.
|
host ::
RSS.