|
|
Struktura a funkce invazního aparátu mikrosporidií
Dohnálek, Vít ; Doležal, Pavel (vedoucí práce) ; Vávra, Jiří (oponent)
Mikrosporidie jsou obligátní intracelulární parazité, kteří jsou významní z medicínského a hospodářského hlediska. Vyvinul se u nich vysoce specializovaný invazní aparát, který nemá u žádných jiných organismů obdoby. Při invazi dochází k uvolnění sporoplasmy z obalu spory a jejímu přenosu polární trubicí do cytoplasmy hostitelské buňky. Současný výzkum tohoto aparátu je zaměřen především na polární trubici, která je jeho nejviditelnější strukturou. Funkčně neméně významný polaroplast a posteriorní vakuola zůstávají mimo hlavní zájem výzkumu, přestože hrají klíčovou roli v aktivaci a exekuci invaze. Při optimální kombinaci vnějších faktorů dochází ke změnám v organizaci polaroplastu, zvětšování objemu posteriorní vakuoly a vystřelení polární trubice. Sporoplasma je následně vytlačena rostoucí posteriorní vakuolou skrze trubici do hostitelské buňky. Mechanismus tohoto procesu zatím není objasněn, ale existuje řada teorií snažících se průběh germinace vysvětlit. V této práci jsou shrnuty dosavadní poznatky a teorie o struktuře a funkci jednotlivých částí invazního aparátu. Klíčová slova: Mikrosporidie, invaze, polární trubice, intracelulární parazitismus, germinace
|
|
|
HPMC-based liposomal mucoadhesive films with model peptide as target API
Belcáková, Hedviga ; Nobilis, Milan (vedoucí práce) ; Doležal, Pavel (oponent)
Univerzita Karlova, Farmaceutická fakulta v Hradci Králové, Katedra farmaceutické chemie a farmaceutické analýzy Kandidát: Hedviga Belcáková Školiteľ: Prof. Milan Nobilis, CSc; Vernika Fidelj (Heidelberg Universität, Institut für Pharmazie und Molekulare Biotechnologie) Názov diplomovej práce: Lipozomální mukoadhezivní filmy na bázi HPMC s modelovým peptidem jako cílovým API Predmetom diplomovej práce je preliminárna formulačná fáza mukoadhezívnych bukálnych filmov určených k transmukozálnemu podaniu peptidových liečiv. Skúšobné metódy zahŕňajú hodnotenie hrúbky, pevnosti v ťahu, elongácie, reziduálnej vlhkosti, in vitro 'swelling' parametru a podisolučnej integrity lipozómov. Zvolený polymér (hydroxypropyl methylcelulóza) preukázala optimálne vlastnosti v koncentrácii 10 % v kombinácii s polyethylenglykolom (5 %) ako plasticizérom. Použitá koncentrácia lipozómov bola 2 %. Vyvinutá metóda prípravy vykazovala uspokojivú reprodukovateľnosť s priestorom pre optimalizáciu v oblasti homogenizácie. Výber solventu (H2O vs. PBS) preukázal silný vplyv na mechanické vlastnosti formulácie vedúce k značnej strate elasticity a mukoadhezívnej sily. Prídavok lipozómov v tretej fáze bol úspešný. Následná disolúcia mala len mierny vplyv na ich integritu.
|
|
|
Proteom encystačních váčků Giardia intestinalis.
Marková, Lenka ; Doležal, Pavel (vedoucí práce) ; Tůmová, Pavla (oponent)
Proces encystace je nedílnou a důležitou součástí životního cyklu mnoha organismů. Jedním z nich je i Giardia intestinalis, významný jednobuněčný parazit obratlovců včetně člověka. Během encystace se u něj objevují speciální organely nazvané jako encystační váčky. Ty slouží k akumulaci a transportu materiálu pro budoucí stěnu cysty. Hlavními proteiny, které se nacházejí v encystačních váčcích a tvoří hlavní stavební komponenty stěny cysty, jsou CWP1, CWP2 a CWP3. Právě jim se blíže věnuje tato práce. Struktura a vlastnosti těchto proteinů byly využity k řešení hlavního cíle, kterým byla identifikace dalších proteinů asociovaných s encystačními váčky. V experimentální části se podařilo vytvořit systém, který umožňuje cíleně charakterizovat proteiny a buněčné kompartmenty, a to za využití biotin ligázy z Escherichia coli. Pro tento systém byly vytvořeny konstrukty, které byly úspěšně vneseny do plasmidů a do buněk G. intestinalis. Pro účel klonování byla dále optimalizována metoda místně specifické mutageneze. Exprese zvolených proteinů byla úspěšně detekována během in vitro navozené encystace. Mimo jiné byla také prokázána přirozená tvorba komplexů CWP1 s neznámým proteinem. V neposlední řadě práce uvádí do souvislosti složení stěny cysty G. intestinalis s ostatními komponentami cystové stěny u...
|
|
|
Structure and mechanical properties biodegradable Mg-3Zn-2Ca alloy processed by ECAP
Havlíček, Štěpán-Adam ; Podrábský, Tomáš (oponent) ; Doležal, Pavel (vedoucí práce)
The present study focused on mechanical behavior and microstructure of biodegradable magnesium alloy Mg-3Zn-2Ca processed by equal channel angular pressing (ECAP). Each specimen differ by number of passes. Path of pass is Bc. Processed alloy exhibit improvement of stress and deformation characteristics, but with raising number of passes deformation characteristics starts to decrease underneath the value of unprocessed gravity cast alloy. Applied ECAP processing resulted refinement of grains, elongation in the direction of extrusion. The assessment of microstructure was performed by light microscopy and mechanical properties were determined by tensile tests.
|
|
|
Objemové materiály na bázi Zn a Mg pro biomedicínské aplikace
Ryšťák, Jaroslav ; Fintová, Stanislava (oponent) ; Doležal, Pavel (vedoucí práce)
Tématem diplomové práce je proces přípravy objemového materiálu Zn-Mg slinováním při lisování za tepla z práškových směsí. Objemové materiály byly hodnoceny z hlediska struktury, porozity a fyzikálně mechanických charakteristik připraveného materiálu. Výsledky těchto hodnocení a jejich interpretace vzhledem k přípravě materiálu byly použity pro následnou optimalizaci jednotlivých parametrů procesu přípravy objemového materiálu. Řešení je zaměřeno na studium a řízení procesů při přípravě objemového materiálu a popis těchto dějů z fyzikálně-chemického hlediska s ohledem na tvorbu struktury a výsledné vlastnosti.
|
|
|
Biogenesis of Giardia intestinalis mitosomes
Voleman, Luboš ; Doležal, Pavel (vedoucí práce) ; Faso, Carmen (oponent) ; Dawson, Scott C. (oponent)
8 ABSTRAKT Mitochondrie opisthokont neustále fúzují a dělí se v průběhu celého buněčného cyklu. Udržení těchto dvou procesů v rovnováze je pro buňku zásadní. Mitochondriální fúze i dělení jsou řízeny dynaminovými GTPázami, které jsou konzervovány napříč všemi organismy. Jak mitochondriální fúze a dělení probíhá mimo zmíněnou skupinu organismů téměř není známo. V naší práci jsme se zabývali zavedením fluorescenčního značení pro live imaging do organismů G. intestinalis a T. vaginalis, jednobuněčných parazitů ze skupiny Excavata. Pomocí této metody jsme poté zkoumali dynamiku mitosomů, nejjednodušších forem mitochondrií, u G. intestinalis. Zjistili jsme, že dělení mitosomů probíhá během mitozy, se kterou je absolutně synchronizováno, a že ke stejné synchronizaci dochází také během encystace parazita. Dále jsme objevili, že během buněčného cyklu jsou mitosomy spojené s endoplasmatickým retikulem, nicméně charakter tohoto spojení není znám, jelikož genom Giardie nekóduje žádný ze známých proteinů zodpovědných za zprostředkování tohoto kontaktu. Prozatím jediným proteinem nalezeným v místech kontaktu mitosomů a endoplasmatického retikula je acyl-CoA syntetáza 4, enzym biosyntézy lipidů. Také jsme se zabývali hledáním dalších potenciálních mitosomálních ...
|
|
|
Characterization of the protein import into Giardia Intestinalis mitosomes
Pyrihová, Eva ; Doležal, Pavel (vedoucí práce) ; Tsaousis, Anastasios (oponent) ; Stairs, Courtney (oponent)
Pohlcení eubakterie a její přeměna v mitochondrii je klíčovým okamžikem v evoluci eukaryot. Jejich proteom se postupně vyvinul v jedinečnou kombinaci původních bakteriálních komponent s eukaryotickými evolučními novinkami. Dnes můžeme u eukaryot najít obrovskou variabilitu mitochondriálních forem - od klasických mitochondrií s kristy a složitým proteinovým systémem pro údržbu vlastního genomu přes hydrogenosomy se schopností produkovat molekulární vodík a konečně mitosomy, které zcela ztratily jak genom, tak většinu původních mitochondriálních funkcí a proteinů. Srovnávání různých podob dnešních mitochondrií můžeme použít pro studium jejich evoluce. Jejich jedinými společnými znaky jsou dvojitá membrána, syntéza železo-sirných center pomocí ISC dráhy a centrální komponenty dráhy pro import proteinů. Proto předpokládáme, že právě tyto znaky představují původní a nezbytné vlastnosti mitochondrií. Mitosomy parasitických protist byly objeveny u zcela nepříbuzných druhů, vznikly tedy nezávisle a přesto byly u všech zachovány podobné proteiny mitochondriálního importu. Tyto komponenty jsou proto považovány za esenciální a nenahraditelné. Import proteinů do mitosomů byl dlouhou dobu považován za zcela minimalistický. Nicméně nejnovější studie ukazují, že mitosomální proteomy obsahují druhově-specifické...
|
|
|
Volně žijící améby jako původci nákaz člověka
Markovičová, Ivana ; Nohýnková, Eva (vedoucí práce) ; Doležal, Pavel (oponent)
Volně žijící améby jako původci nákaz člověka jsou celosvětově rozšířené organismy se schopností dvojího života a to jak v přírodě, která je jejich přirozeným prostředím, tak uvnitř napadeného organismu. Cílem této bakalářské práce je shrnout základní dostupné informace volně žijících patogenních druhů Naegleria fowleri, Balamuthia mandrillaris a patogenního rodu Acanthamoeba, které napadají CNS a jsou původci vzácných, avšak závažných onemocnění, často vedoucích ke smrti pacienta. Vyjímkou je zde akantamébová keratitida, která v neléčených případech vede ke snížení vizu či úplné slepotě. V jednotlivých kapitolách se práce věnuje způsobu přenosu, mechanismu patogeneze a patofyziologii za účelem přiblížení patogenity těchto tří volně žijících améb.
|
|
|
Testing of adhesive properties of plasticized polyesters using rotational rheometer
Ogadah, Chiazor Ugo ; Šnejdrová, Eva (vedoucí práce) ; Doležal, Pavel (oponent)
Title of thesis: Testing of adhesive properties of plasticized polyesters using rotational rheometer Author: Ogadah Chiazor Ugo Department: Pharmaceutical Technology Supervisor: PharmDr. Eva Šnejdrová, Ph.D. In this thesis, the rheological and adhesive properties of three polyesters intended for use as drug carriers in polymeric drug delivery systems were studied. The theoretical section summarizes the polymers used as drug carriers. Plasticizers, mechanism of action, types and uses and finally bioadhesion mechanism, application of the bioadhesive preparations, and methods of testing bioadhesion are reviewed. In the experimental section, ethyl salicylate, ethyl pyruvate and triethyl citrate were selected as the plasticizers to decrease the viscosity of the polyesters for easy processability, and setting of the optimal adhesive properties. Flow properties of the plasticized systems was measured with a rotational rheometer at temperature 37o C and a shear rate range from 0.10 to 100 s-1 . The analysis of the viscosity curves revealed that the resulting plasticized systems are mostly Newtonian. All tested plasticizers decrease the viscosity of the systems. The most effective is ethyl pyruvate. The adhesive properties were determined by the "pull away test" on the rotational rheometer, and evaluated as...
|
|
|
Řízení provozu ve vysokorychlostních sítích v prostředí DPDK
Doležal, Pavel ; Fukač, Tomáš (oponent) ; Vrána, Roman (vedoucí práce)
Předmětem této bakalářské práce je plánování síťového provozu ve vysokorychlostních sítích. V práci je popsán framework DPDK, který lze využít pro rychlé zpracovávání paketů. Jsou popsány obecné mechanismy plánování síťového provozu a plánování provozu v Linuxu pomocí nástroje tc. Dále je představen návrh a implementace plánovače síťového provozu v prostředí DPDK pro sítě o šířce pásma 10 Gbps. Pro plánovač je použit komplexní mechanismus hierarchického modelu zásobníku žetonů. Systém byl otestován pomocí generátoru síťového provozu Spirent.
|
host ::
RSS.