|
|
Development and validation of methods for GMO detection
Hodek, Jan ; Ovesná, Jaroslava (advisor) ; Konopásek, Ivo (referee) ; Pazlarová, Jarmila (referee)
The present work is focused on the issue of genetically modified organisms (GMOs) detection in the plants and derived products. Existing legislation in the European Union regulates monitoring of GMO and lays down rules for their labeling and traceability. The aim was to contribute to solving certain issues of critical points in GMO detection. The first point was DNA extraction. The problem was adressed to the example of DNA extraction from the fruit of papaya and candied papaya. For both food products the suitability of the selected extraction methods was verified and confirmed by amplification of a specific DNA sequence by PCR. The second critical point was related to PCR inhibitors. We observed the effect of real-time PCR inhibition due to the influence of the residual EDTA and the residual amount of heavy metal ions, which were present in laboratory plastic. In both examples, the inhibition affects the PCR efficiency. Another critical point in the GMO detection is use of screening elements. That work was focused on false positive results. Development of new methods for GMO detection was another goal of this work. We have developed the method for garden pea taxon-specific gene quantification by real-time PCR. The method was tested on 13 cultivars of garden pea and several related plants of...
|
|
|
Ecotoxicological evaluation of contaminated water and soil and use of biotests for bioremediation
Hubálek, Tomáš ; Novotný, Čeněk (advisor) ; Pazlarová, Jarmila (referee) ; Malachová, Kateřina (referee)
2 2. Abstract The aim of this thesis is to identify the ecotoxicity of contaminated soil and water during bioremediation. Different test organisms were selected for the battery of ecotoxicity tests such as the bacterium Vibrio fischeri, the terrestrial plants Sinapis alba, Lactuca sativa, and Hordeum vulgare, the water plant Lemna minor, the earthworm Eisenia fetida, and the crustaceans Daphnia magna and Heterocypris incongruens. A comparison of individual biotests with various organisms and endpoints should demonstrate their suitability and sensitivity for the ecotoxicity evaluation of contaminated soil and water. The bioassays were used for the evaluation of the bioremediation of hydrocarbon-contaminated soil, composting of PAH-contaminated soil and remediation of contaminated groundwater. The ecotoxicity of hydrocarbon-contaminated soil originating from a brownfield was evaluated during a 17-month biodegradation pilot test (experiment I). The initial concentration of total petroleum hydrocarbons (TPH) in the soil was 6380 μg.g-1 dry weight; the concentration of TPH in the soil decreased by 65.5 % after bioremediation. The highest toxicity was detected in the first period of bioremediation; however, certain toxic effects were detectable during the whole bioremediation process. The contact tests were the...
|
|
| |
|
| |
|
|
Zabezpečení laboratorní detekce geneticky modifikovaných organismů včetně mikroorganismů
Vysoká škola chemicko-technologická v Praze, Ústav biochemie a mikrobiologie, Praha ; Zdeňková, Kamila ; Pazlarová, Jarmila ; Demnerová, Kateřina
Spolupráce při přípravě metodik vzorkování a stanovení přítomnosti GMO pro účely kontroly, pokračování spolupráce na přípravě ISO normy vzorkování GMO v rámci skupiny WG 34, účast na práci mezinárodní komise pro akreditaci GMO laboratoří, informace o stavu přípravy příslušných norem na mezinárodní úrovni, zejména v EU, operativní stanovení přítomnosti GMO v rostlinných popřípadě mikrobiálních materiálech ve vzorcích dodaných ČIŽP, rozvíjení mezinárodní spolupráce v rámci ENGL (referenční laboratoř EK pro stanovení GMO), účast na mezinárodních laboratorních porovnáních, prezentované výsledky.
|
|
| |
|
|
Zabezpečení laboratorní detekce geneticky modifikovaných organismů včetně mikroorganismů
Vysoká škola chemicko-technologická v Praze, Ústav biochemie a mikrobiologie, Praha ; Zdeňková, Kamila ; Pazlarová, Jarmila ; Demnerová, Kateřina
Cílem projektu bylo ověřování metodik vzorkování a stanovení přítomnosti GMO pro účely kontroly, účast na práci mezinárodní komise pro akreditaci GMO laboratoří, zapojení do přípravy příslušných norem na mezinárodní úrovni, zejména v EU, operativní stanovení přítomnosti GMO v rostlinných, příp. mikrobiálních materiálech ve vzorcích dodaných ČIŽP, uchovávání referenčních vzorků pro potřeby objednatele a ČIŽP, spolupráce se Společným výzkumným ústavem Evropské komise (Joint Research Centre EC) v Ispře, plnění úkolů v rámci evropské sítě detekčních laboratoří GMO (European Network of GMO Laboratories - ENGL), zprostředkování informací objednateli, spolupráce s ČIŽP při školení pracovníků a metodické konzultace pro pracovníky ČIŽP, poskytování podkladů SZÚ CHŘP Brno pro zpracování přehledu metod pro průkaz a stanovení GMO a GM produktů v laboratoři FPTB a podkladů pro zpracování přehledu uchovávaných referenčních vzorků.
|
guest ::
