|
|
Non-contrast MRI perfusion imaging
Kruml, Ondřej ; Jiřík, Radovan (referee) ; Krátká, Lucie (advisor)
This bachelor paper is focused on the magnetic resonance perfusion imaging technic without the usage of an external contrast media. This paper contains a look at the basic functional principle of the magnetic resonance. The focus is then set set on the Arterial Spin Labeling (ASL) technic. The basic principle of ASL uses protons from the water mocelules in arterial blood as an endogenous contrast agent. This technic can be used for obtaining a perfusion map of any tissue without the usage of invasiont echnics or contrast agents. The quantification of perusion was done applying the FAIR-RARE scheme, which belongs to the large family pulsed ASL.
|
|
|
Biological sequence classification utilizing lossless data compression algorithms
Kruml, Ondřej ; Provazník, Ivo (referee) ; Škutková, Helena (advisor)
Tato diplomová práce se zabývá možností využití bezeztrátových kompresních algoritmů ke klasifikaci biologických sekvencí. Nejdříve je představena literární rešerše o bezeztrátových kompresních algoritmech, která byla využita k výběru slovníkového algoritmu vytvořeného A. Lempelem a J. Zivem v roce 1976 (LZ77). Tento algoritmus je běžně používán k datové kompresi a v předkládané práci byl modifikován tak, aby umožnil klasifikaci biologických sekvencí. K algoritmu byly navrženy další modifikace, které rozvíjí jeho klasifikační možnosti. V průběhu práce byla sestavena sada datasetů biologických sekvencí, která umožnila podrobné testování algoritmu. Algoritmus byl porovnán s klasickými zarovnávacími metodami: Jukes-Cantor, Tamura a Kimura. Bylo ukázáno, že algoritmus dosahuje srovnatelných výsledků v oblasti klasifikace biologických sekvencí a dokonce je u 20% datasetů překonává. Lepší výsledky dosahuje zejména u sekvencí, jež jsou si vzájemně vzdálené.
|
|
|
Non-contrast MRI perfusion imaging
Kruml, Ondřej ; Jiřík, Radovan (referee) ; Krátká, Lucie (advisor)
This bachelor paper is focused on the magnetic resonance perfusion imaging technic without the usage of an external contrast media. This paper contains a look at the basic functional principle of the magnetic resonance. The focus is then set set on the Arterial Spin Labeling (ASL) technic. The basic principle of ASL uses protons from the water mocelules in arterial blood as an endogenous contrast agent. This technic can be used for obtaining a perfusion map of any tissue without the usage of invasiont echnics or contrast agents. The quantification of perusion was done applying the FAIR-RARE scheme, which belongs to the large family pulsed ASL.
|
|
|
Biological sequence classification utilizing lossless data compression algorithms
Kruml, Ondřej ; Provazník, Ivo (referee) ; Škutková, Helena (advisor)
Tato diplomová práce se zabývá možností využití bezeztrátových kompresních algoritmů ke klasifikaci biologických sekvencí. Nejdříve je představena literární rešerše o bezeztrátových kompresních algoritmech, která byla využita k výběru slovníkového algoritmu vytvořeného A. Lempelem a J. Zivem v roce 1976 (LZ77). Tento algoritmus je běžně používán k datové kompresi a v předkládané práci byl modifikován tak, aby umožnil klasifikaci biologických sekvencí. K algoritmu byly navrženy další modifikace, které rozvíjí jeho klasifikační možnosti. V průběhu práce byla sestavena sada datasetů biologických sekvencí, která umožnila podrobné testování algoritmu. Algoritmus byl porovnán s klasickými zarovnávacími metodami: Jukes-Cantor, Tamura a Kimura. Bylo ukázáno, že algoritmus dosahuje srovnatelných výsledků v oblasti klasifikace biologických sekvencí a dokonce je u 20% datasetů překonává. Lepší výsledky dosahuje zejména u sekvencí, jež jsou si vzájemně vzdálené.
|
guest ::
