|
|
Vibrační optická aktivita 3-aminoquinuclidinu
Jílek, Štěpán ; Profant, Václav (vedoucí práce) ; Kaminský, Jakub (oponent)
1 Práce se zabývá studiem chirální molekuly 3-aminochinuklidinu (AQN), která je významným farmakoforem. Deriváty této molekuly tvoří základ pro řadu biologicky významných látek a léčiv: modulátorů aktivity serotoninových receptorů, látek pro zobrazení neuronální aktivity a léků potlačujících vedlejší účinky při chemoterapii (antiemetika). Molekula AQN je chirální a informace o její absolutní konfiguraci a enantiomerní čistotě je proto velmi významná pro její využití ve farmaceutickém průmyslu. Struktura AQN obsahuje primární a terciární aminovou skupinu a v závislosti na pH se může vyskytovat ve třech nábojových stavech. V této práci jsme se zaměřili na charakterizaci AQN pomocí metod vibrační spektroskopie - infračervené absorpce a Ramanova rozptylu, včetně jejich chirálních variant - vibrační cirkulární dichroismus (VCD) a Ramanova optická aktivita (ROA), ty všechny v kombinaci s kvantově chemickými simulacemi. Značná pozornost byla věnována výběru vhodného rozpouštědla a nastavení ideálních experimentálních podmínek. Na základě pH závislosti Ramanových spekter jsme určili pKA disociační konstanty charakterizující přechody mezi jednotlivými nábojovými stavy AQN, které byly dále charakterizovány pomocí ROA a VCD. Zkoumány byly i vlastnosti AQN v různých fázích (vodní roztok, krystalická a skelná fáze)....
|
|
|
Vibrational optical activity of biomolecules
Ješko, Eduard ; Baumruk, Vladimír (vedoucí práce) ; Kaminský, Jakub (oponent)
Diplomová práca je zameraná na štúdium konformácie molekuly dimethyl tartrate použitím metód vibračnej optickej activity (VOA), a to konkrétne vibračného cirkulárneho dichroizmu (VCD) a Ramanovej optickej activity (ROA). Na základe teoretickej analýzy oboch VOA metód a súčasného stavu výskumu v oblasti študovanej molekuly bola vzorka molekuly dimethyl tartrate rozpustená v rozličných rozpúšťadlách a jej vlastnosti boli skúmané pomocou VCD a ROA spektrometrov. Experiment bol doplnený ab initio výpočtami a následne boli experimentálne spektrá porovnávané s vypočítanými spektrami. Na základe výsledkov porovnávania boli podrobne popísané možné konformácie študovanej molekuly vo vodnom prostredí.
|
|
|
Izotopicky značené peptidy poskytující rozlišená strukturní data pomocí infračervených specter. Strukturní limity optické spektroskopie
Keiderling, T. A. ; Huang, R. ; Kubelka, J. ; Bouř, Petr ; Setnička, V. ; Hammer, R. P. ; Etienne, M. A. ; Silva, R. A. G. D. ; Decatur, S. M.
Izotopické značení, převážně pomocí substituce 13C na amidové C=O skupině, dovoluje prostorově podrobnější určení peptidové konformace pomocí IČ. To je dokumentováno na příkladů helixů a listů (beta-hairpin) peptidů.
|
host ::
RSS.