|
|
Studium vazebné interakce tyrosinkinasových inhibitorů se sérovým albuminem
Rodová, Marie ; Indra, Radek (vedoucí práce) ; Heidingsfeld, Olga (oponent)
jsou protinádorová léčiva užívaná k léčbě pacientů s karcinomem štítné žlázy v případě vandetanibu a v případě sunitinibu pro pacienty renálním buněčným karcinomem, gastrointestinálním stromálním tumorem a nádorem slinivky břišní. Patří do skupiny tyrosinkinasových inhibitorů a jejich aktivita spočívá antiangiogenních účincích a inhibici proliferace a přežití nádorových buněk prostřednictvím VEGFR a u vandetanibu ještě navíc prostřednictvím EGFR a RET. V předkládané diplomové práci byla studována vazebná interakce sérového albuminu TKI sunitinibem a vandetanibem za použití BSA, HSA a krevní plasmy. Kromě rozdílu různými sérovými albuminy (čistý B čistý H i povaha a lokalizace vazebné interakce. Dále byl studován vliv přítomnost dalších ligandů a fotosenzitivita samotného sunitinibu. Za použití spektroskopických metod, jako je UV VIS absorpce nebo fluorescenční zhášení, byly stanoveny Stern BSA a HSA. Data zhášení VIS absorpce naznačovaly tvorbu komplexu BSA je dostačující pro účinný přenos léčiva do jeho specifického cílového místa prostřednictvím krevního oběhu. Silná vazebná afinita byla potvrzena i metodou HPLC za použití centrifugačních filtrů. Z termodynamických parametrů bylo pro oba TKI při vazbě SA i BSA předpovězeno primární zapojení hydrofobních interakcí. Data zhášení přítomnosti markerů...
|
|
|
Vazba organických barviv na proteiny. Možnosti využití v rámci praktika z biochemie.
Hynková, Anna ; Hudeček, Jiří (vedoucí práce) ; Koblihová, Jitka (oponent)
V předložené bakalářské práci byla experimentálně ověřována možnost vytvoření nové úlohy pro pokročilé biochemické praktikum, tematicky zaměřené na studium vazby nízkomolekulární látky (barviva) na makromolekulu proteinu. Prvotním záměrem bylo v tomto směru modifikovat existující úlohu "Studium kinetiky dialýzy". Výsledky experimentů ale ukázaly, že fluorimetrické měření v podmínkách praktika je nedostatečně reprodukovatelné a měření absorbance málo citlivé. Proto byla vytvořena úloha nová: "Vazba bromfenolové modři na sérový albumin", ve které je studována stechiometrie této vazby pomocí tzv. Jobova výnosu. Po optimalizaci postupu byl vytvořen návod, který je přílohou této práce. Klíčová slova: fluorescein, bromfenolová modř, sérový albumin
|
|
|
MRI contrast agents for angiography
Urbanovský, Peter ; Kotek, Jan (vedoucí práce) ; Vojtíšek, Pavel (oponent)
Súčasná diagnostická metóda magnetickej tomografie (MRI) používa kontrastné látky typu T1 založené na komplexoch Gd3+ . Pre vysokú toxicitu voľného Gd3+ sú požadované jeho komplexy, ktoré sú termodynamicky stále, kineticky inertné a ľahko vylúčiteľné. Táto práca zhŕňa poznatky o novej kontrastnej látke založenej na ligande typu DO3APR (1,4,7,10-tetraazacyklododekán-1-methyl(alkyl)fosfínová-4,7,10-trioctová kyselina) s postrannou hydrofóbnou dibenzylamino skupinou, ktorá je schopná reverzibilnej interakcie s makromolekulou sérového albumínu. Stabilita suprakomplexu je závislá na hodnote pH, t.j. na protonizácii pendantnej amino skupiny komplexu (pKA = 5,6) a táto interakcia bola potvrdená z 1 H-NMRD profilu a fluorescenčnou analýzou. Látka bola testovaná pre jej angiografické vlastnosti in vivo na modelu potkana. Ďalej boli charakterizované komplexy ligandu s niektorými trojmocnými lanthanoidmi (Nd3+ , Eu3+ , Tb3+ , Dy3+ , Er3+ ) rôznymi metódami (XRD, luminiscencie, UV-VIS, 1 H-, 17 O- a 31 P-NMR). Po odstránení benzylových skupín bol získaný ligand, ktorého Ln3+ komplexy vykazujú pH závislý PARACEST efekt. Tieto komplexy boli charakterizované metódami XRD, luminiscenčne a 1 H- a 31 P-NMR. Ďalej boli pripravené nové ligandy s modifikovanou dĺžkou pendantného ramena a s postrannou dibenzylamino...
|
|
|
Vazba organických barviv na proteiny. Možnosti využití v rámci praktika z biochemie.
Hynková, Anna ; Hudeček, Jiří (vedoucí práce) ; Koblihová, Jitka (oponent)
V předložené bakalářské práci byla experimentálně ověřována možnost vytvoření nové úlohy pro pokročilé biochemické praktikum, tematicky zaměřené na studium vazby nízkomolekulární látky (barviva) na makromolekulu proteinu. Prvotním záměrem bylo v tomto směru modifikovat existující úlohu "Studium kinetiky dialýzy". Výsledky experimentů ale ukázaly, že fluorimetrické měření v podmínkách praktika je nedostatečně reprodukovatelné a měření absorbance málo citlivé. Proto byla vytvořena úloha nová: "Vazba bromfenolové modři na sérový albumin", ve které je studována stechiometrie této vazby pomocí tzv. Jobova výnosu. Po optimalizaci postupu byl vytvořen návod, který je přílohou této práce. Klíčová slova: fluorescein, bromfenolová modř, sérový albumin
|
|
|
Vazba nízkomolekulárních ligandů na sérový albumin
Buša, Michal ; Hudeček, Jiří (vedoucí práce) ; Vaněk, Ondřej (oponent)
V předložené bakalářské práci byla experimentálně ověřena možnost rozšíření úlohy pro pokročilé biochemické praktikum, tematicky zaměřené na studium vazby nízkomolekulární látky (barviva) na makromolekulu albuminu. Úloha s názvem: "Vazba bromfenolové modři na sérový albumin" má pomoci studentům v pochopení základních metod pro studium vazby ligandů na protein a stechiometrie komplexu. Vazba barviva na protein je zkoumána pomocí Jobova a nově i Scatchardova výnosu. Po optimalizaci podmínek byl vytvořen nový návod, který je přílohou této práce.
|
|
|
ANALYSIS OF NON-ENZYMATIC POSTTRANSLATIONAL MODIFICATED (GLYCATED) ALBUMIN BY NANO-LC/MS/MS
Šťastná, Zdeňka ; Pataridis, Statis ; Sedláková, Pavla ; Mikšík, Ivan
Posttranslational modifications of proteins are important reactions, which significantly affect the function of proteins in the organism. In principle, they can be divided into enzymatic and non-enzymatic modifications. Non-enzymatic reactions include glycation (earlier called nonezymatic glycosylation), which plays an important role in the development of chronic complications of diabetes mellitus, uremia, in the process of aging and degeneration of the brain.This work deals with the study of glycated albumins (human serum albumin and bovine serum albumin). Methodologically we used nano-liquid chromatography coupled to Q-TOF mass spectrometer. In vitro modified proteins were cleavaged by trypsin and arising peptides were separated on C18 nano column with trap-column. Peptides and their modifications were analysed by high-resolution Q-TOF mass spectrometer MaXis with precision determination of mass below 2 ppm. We found some modifications of proteins. Besides well known carboxymethyllysine new ones were determined - create mass shift 78, 132 and 218. Origin of these modifications is discussed and possible structure is presented. All found modifications were allocated to the structure of proteins and reactivity to various oxo-compounds was also examined
|
host ::
RSS.