|
|
Evolution of mixed cultures of the pathogenic yeasts Candida albicans and Candida guilliermondii
Hirko, Dominik ; Heidingsfeld, Olga (vedoucí práce) ; Schierová, Michaela (oponent)
Cílem této práce bylo zjistit, jak se mění kokultury kvasinek Candida albicans a Candida guilliermondii v průběhu času, jednak za kontrolních podmínek a též pod vlivem flukonazolu. Tyto druhy jsou oportunní fungální patogeny, které se značně liší ve své citlivosti k nejčastěji používanému antimykotiku - flukonazolu. Po krátkém úvodu do společných rysů studovaných druhů, jejich mechanizmu patogeneze a léčby infekcí, které způsobují, se tato práce věnuje růstovým křivkám obou mikroorganizmů za vybraných podmínek a taktéž procesu umělé evoluce pomocí modelu pasážování kokultur. Poté byly tyto populace C. albicans a C. guillieromondii zkoumány pomocí qPCR a chromogenních médií. qPCR analýza odhalila, že za kontrolních podmínek v kulturách převládá C. albicans (CA). Možným důvodem je 20 % kratší generační doba, jak ukazuje růstová křivka. V přítomnosti flukonazolu bylo možno pozorovat dva trendy. Jeden souvisí s přirozenou rezistencí C. guilliermondii (CG) a vedl k tomu, že CG byla na konci pasážování dominantní. Druhý trend vedl k dominanci CA, přestože tato kvasinka je za normálních okolností k flukonazolu citlivá. Na základě tohoto zjištení byla testovaná minimalní inhibiční koncentrace (MIC50) náhodně vybraných kolonií CA. V experimentu, kde ve 12. pasáži CA převládla, došlo až k 10- násobnému...
|
|
|
Sekvenční analýza genomů viru KE, kmen Hypr, v různých pasážích v hostiteli \kur{in vivo}.
ŠIMONOVÁ, Zuzana
Srovnávala jsem genomové sekvence tří variant klíšťové encefalitidy, kmene Hypr. Konkrétně to byly: Hypr5 - pětkrát pasážovaný virus na mozcích sajících myšek, Hypr50/V - varianty vysocepasážovaná v laboratoři ve Vídni in vivo a Hypr50/CB - vysocepasážovaná varianta v laboratoři v Českých Budějovicích in vivo. Obě vysoce pasážované varianty byly také pasážované v mozcích myší. Zaměřila jsem se na změny nukletidových sekvencí ve vysocepasážovaných variantách Hypr50/CB a Hypr50/V v porovnání s variantou Hypr5 a z nich vyplývající změny aminokyselinových sekvencí ve virových proteinech. Zaznamenala jsem několik změn identických pro obě vysocepasážované varianty a to v proteinech E, NS3 a NS5 a několik unikátních změn jen v jedné z variant v proteinech E, NS1, NS2A, NS2B a NS3. Nukleotidová substituce byla taktéž nalezena v 5'UTR oblasti virového genomu.
|
host ::
RSS.