Hlavní stránka > Výsledky hledání: keywords:"melting of nucleic acids"
Hledej:
Tipy pro vyhledávaní :: Rozšířené hledání
Hledej ve sbírkách:
Seřadit podle: Zobrazit výsledky: Výstupní formát:
Národní úložiště šedé literatury Nalezeno 2 záznamů.  Hledání trvalo 0.01 vteřin. 
Termodynamika tvorby komplexů miRNA
 Vacková, Anežka ; Štěpánek, Josef (vedoucí práce) ; Mojzeš, Peter (oponent)
Práce se týká mikroRNA (miRNA), což jsou krátké řetězce RNA, které svou vazbou na cílovou mRNA molekulu regulují expresi genetické informace. Vzniklé komplexy miRNA a mRNA mají zpravidla podobu neúplného duplexu, kde jsou krátké úseky Watson-Crickových bázových párů přerušovány vnitřními smyčkami, nekomplementárními páry nebo výdutěmi. Obsahem práce je studium vlivu anomálních strukturních útvarů, vnitřní smyčky a výdutě, na strukturní stabilitu komplexu tvořeného miRNA označované Let7 s jejím cílovým úsekem LCS1 na mRNA lin-41 z Caenorhabditis elegans. Řešení práce spočívalo ve změření teplotních závislostí UV absorpčních spekter směsných roztoků výše uvedených RNA sekvencí a jejich mutovaných analog a v analýze spektrálních změn pomocí metody singulárního rozkladu a následným fitováním s použitím termodynamického modelu. Výsledkem jsou určené termodynamické charakteristiky komplexů a spektrální změny spojené se zvýšením teploty komplexu a s jeho rozpadem.
Úplný záznam
Komplexy miRNA s cílovou RNA sekvencí
 Homolka, Radim ; Štěpánek, Josef (vedoucí práce) ; Římal, Václav (oponent)
miRNA jsou krátké molekuly RNA post-transkripčně regulující genovou expresi prostřednictvím vazby na cílovou mRNA. Z toho pak plyne vztah miRNA k řadě fyziologických dějů a nejrůznějším onemocněním, např. některým nádorům či virovým infekcím. V této diplomové práci byly studovány teplotně indukované rozpady oligonukleotidových duplexů simulujících vazbu miRNA na příslušnou mRNA. Pro tyto účely byly využity techniky UV absorpční spektroskopie a spektroskopie Ramanova rozptylu. Měřeny byly teplotně závislé série spekter, které pak dále byly zpracovány pomocí faktorové analýzy. Záměrem bylo interpretovat stanovené hodnoty termodynamických parametrů ve vztahu ke stabilitě duplexů a vlivu vnitřních struktur v těchto komplexech. Také byla testována vhodnost použitého přístupu pro studium komplexů oligonukleotidů. Ukázalo se, že na základě faktorové analýzy teplotně závislých sérií UV spekter lze dobře určit termodynamické parametry rozpadu duplexů. Ramanova spektra jsou zatížena velkou chybou, přesto na nich lze pozorovat některé strukturní změny spojené s přechodem. Bylo zjištěno, že výduť přítomná ve studovaném komplexu snižuje flexibilitu tohoto duplexu i energetickou výhodnost jeho vzniku.
Úplný záznam

Chcete být upozorněni, pokud se objeví nové záznamy odpovídající tomuto dotazu?
Přihlásit se k odběru RSS.
Digitální repozitář :: Hledej :: Nový záznam :: Personalizace :: Nápověda
Powered by Invenio v1.1.2
Spravuje admin.invenio@techlib.cz
Tato stránka je dostupná také v následujících jazycích:
Česky  English