|
|
Adenosine methylation (m6A) in plant mRNA
Holoborodko, Anastasiia ; Růžička, Kamil (vedoucí práce) ; Náprstková, Alena (oponent)
V eukaryotických organismech je známo více než 200 interních posttranskripčních modifikací RNA. Nejběžnější modifikací v mRNA je N6-methyladenosin (m6A). V rostlinách m6A ovlivňuje mnoho aspektů procesování mRNA, jako je její stabilita, sestřih, alternativní polyadenylace či export z jádra a translace. Za zápis, odstranění a percepci m6A jsou zodpovědné proteinové komplexy obsahující methyltransferázy (tzv. writery), demethylázy (erasery) a proteiny obecně vázající m6A (readery). Dynamické regulace pomocí m6A mají významný́ vliv na vývoj rostlin. m6A také hraje roli v reakci na abiotický stres a virovou infekci. Tato práce shrnuje současné znalosti o m6A v rostlinách a také s přihlédnutím k nejnovějším poznatkům z živočišných experimentálních modelů.
|
|
|
m6A RNA methylation in eukaryotic cells
Petržílková, Hana ; Staněk, David (vedoucí práce) ; Folk, Petr (oponent)
N6-metylace adenosinu (m6 A) je nejčastější modifikací mRNA u eukaryot. Na RNA je vytvářena metyltransferázami během transkripce, navíc může být odstraněna konkrétními demetylázami. Přítomnost těchto demetyláz umožňuje vratnost modifikace a její potenciální dynamičnost, proto by se N6-metyladenosin mohl účastnit regulace genové exprese. Od objevu první m6 A-specifické demetylázy FTO, m6 A modifikace začala být oblíbeným tématem ve výzkumu biologie RNA. N6- metyladenosin je přítomen v mRNA ale také v různých nekódujících RNA. Analýza distribuce m6 A na mRNA odhalila obohacení kolem 3' nepřekládané oblasti a pravděpodobně kolem sestřihových míst. Zatím byly objeveny dvě m6 A metyltransferázy, METTL3/METTL14 metyltransferáza je hlavním metyltransferázovým komplexem a metyltransferáza METTL16 metyluje jen malou skupinu RNA. Také jsou známy dvě demetylázy - FTO a ALKBH5. Navíc byly identifikovány proteiny vázající m6 A, které spolu sdílí strukturní doménu YTH. m6 A slouží jako buněčný signál ovlivňující různé kroky metabolismu RNA, například sestřih RNA, jaderný export, translaci nebo odbourávání RNA. Některé tyto vlivy jsou zprostředkovány m6 A-vázajícími proteiny, ale mohou se účastnit i jiné mechanismy. Přítomnost m6 A modifikace na RNA může také ovlivňovat sekundární strukturu dané RNA a tím i...
|
host ::
RSS.