|
|
Detection of Correlated Mutations
Ižák, Tomáš ; Bendl, Jaroslav (oponent) ; Martínek, Tomáš (vedoucí práce)
This work explores existing possibilities and methods of correlated mutations detection in proteins. At the beginning a theoretical background into explored area is provided. Exploitation of detected correlated mutations lies in a protein's tertiary structure prediction or searching functionally important sites. A state-of-the-art of existing tools and methods follows. In this work, methods based on statistics (for example Pearson correlation coefficient or Pearson's chi^2 test), Information theory (Mutual information - MI) and likelihood models (ELSC or Spidermonkey) are examined. The next part is devoted to the searching for an optimal algorithm for correlated mutations detection. To combine results from multiple different algorithms, is proposed as an optimal solution. It is also advised to exploit physico-chemical properties of amino acids during the detection. In practical part, the algorithm for detection of correlated mutations was developed. It is based on physico-chemical properties of amino acids and phylogenetic trees. Results gained using this method were compared with results gained from CAPS, CRASP and CMAT tools.
|
|
|
Detection of Correlated Mutations
Ižák, Tomáš ; Bendl, Jaroslav (oponent) ; Martínek, Tomáš (vedoucí práce)
This work explores existing possibilities and methods of correlated mutations detection in proteins. At the beginning a theoretical background into explored area is provided. Exploitation of detected correlated mutations lies in a protein's tertiary structure prediction or searching functionally important sites. A state-of-the-art of existing tools and methods follows. In this work, methods based on statistics (for example Pearson correlation coefficient or Pearson's chi^2 test), Information theory (Mutual information - MI) and likelihood models (ELSC or Spidermonkey) are examined. The next part is devoted to the searching for an optimal algorithm for correlated mutations detection. To combine results from multiple different algorithms, is proposed as an optimal solution. It is also advised to exploit physico-chemical properties of amino acids during the detection. In practical part, the algorithm for detection of correlated mutations was developed. It is based on physico-chemical properties of amino acids and phylogenetic trees. Results gained using this method were compared with results gained from CAPS, CRASP and CMAT tools.
|
|
|
Plagiátorství v textových dokumentech: Plagiátorské postupy
Hejdusová, Kateřina ; Přibil, Jiří (vedoucí práce) ; Váchová, Lucie (oponent)
Tato bakalářská práce se zabývá postupy, které v současnosti využívají plagiátoři při vytváření textových dokumentů. Práce je zaměřena především na dokumenty v českém jazyce. Proto byl pro aplikační část vybrán český software. V úvodu práce je definováno několik základních pojmů, které jsou důležitým pilířem pro pochopení celého tématu. V teoretickém základu je rozebíráno několik v současnosti používaných plagiátorských postupů. Kromě vymezení daných typů je rovněž uvedeno několik jejich příkladů. Dále jsou představeny současné nástroje pro odhalování plagiátorství. Práce se zaměřuje na české i zahraniční řešení. Cílem aplikační části bylo zjištění, do jaké míry je schopen softwarový prostředek odhalit plagiátorství v textových dokumentech. K tomuto účelu bylo využito českého systému Theses.cz, ve kterém bylo analyzováno několik uměle vytvořených plagiátů. V závěru práce jsou rozebrány výsledky ověřování efektivity.
|
host ::
RSS.