|
|
Molekulární simulace vodných roztoků alifatických alkoholů
Peštuka, Martin ; Žídek, Jan (oponent) ; Janeček, Jiří (vedoucí práce)
Cílem této bakalářské práce bylo provést série molekulárně dynamických simulací vodných roztoků alifatických alkoholů v nekonečném zředění. Pro práci s molekulárně dynamickými simulacemi bylo nutné seznámit se s programovým vybavením umožňujícím molekulárně dynamické simulace spustit a poté vyhodnotit. V rámci této práce byly simulovány soubory obsahující 300, 400, 500 a 1000 molekul vody a jednu molekulu alifatického alkoholu. Z výsledků simulací byly určovány změny objemu simulačního boxu spojené s vložením jedné molekuly alkoholu do systému (odpovídající parciálnímu molárnímu objemu) a radiální distribuční funkce mezi jednotlivými páry atomů. Výsledky byly porovnány s experimentálními daty.
|
|
|
Vliv propan-2-olu na strukturu cytochromu c v kyselé oblasti pH
Drahorád, Jan ; Hudeček, Jiří (vedoucí práce) ; Martínek, Václav (oponent)
: Ve své práci se věnuji konformačním změnám cytochromu c - jeho denaturaci a případnému vytvoření stavu "molten globule". Zkoumal jsem vliv propan - 2 - olu na konformaci cytochromu c v kyselé oblasti pH. Součástí práce je literární rešerše na téma cytochrom c : Cytochrom c je mitochondriální periferní hemoprotein, který slouží jako přenašeč elektronů v dýchacím řetězci. Mimo jiné má také funkci v apoptóze. Jeho vlastnosti jsem zkoumal pomocí spektrofotometrických metod, zvláště pak pomocí absorpčních spekter a jejich derivací. Zaměřil jsem se na rozsah vlnových délek 250 - 310 nm, 300 - 500 nm a 450 - 650 nm. Proměřoval jsem pufry s rozpuštěným cytochromem c při pH 1,90; 2,10; 2,30 a 2,60 a zkoumal konformační změny zapřičiněné perturbací propan - 2 - olem až do 20% objemového zlomku. Největší konformační změny se dějí při perturbaci při pH 2,30.
|
|
|
Vliv propan-2-olu na strukturu cytochromu c v kyselé oblasti pH
Drahorád, Jan ; Hudeček, Jiří (vedoucí práce) ; Martínek, Václav (oponent)
: Ve své práci se věnuji konformačním změnám cytochromu c - jeho denaturaci a případnému vytvoření stavu "molten globule". Zkoumal jsem vliv propan - 2 - olu na konformaci cytochromu c v kyselé oblasti pH. Součástí práce je literární rešerše na téma cytochrom c : Cytochrom c je mitochondriální periferní hemoprotein, který slouží jako přenašeč elektronů v dýchacím řetězci. Mimo jiné má také funkci v apoptóze. Jeho vlastnosti jsem zkoumal pomocí spektrofotometrických metod, zvláště pak pomocí absorpčních spekter a jejich derivací. Zaměřil jsem se na rozsah vlnových délek 250 - 310 nm, 300 - 500 nm a 450 - 650 nm. Proměřoval jsem pufry s rozpuštěným cytochromem c při pH 1,90; 2,10; 2,30 a 2,60 a zkoumal konformační změny zapřičiněné perturbací propan - 2 - olem až do 20% objemového zlomku. Největší konformační změny se dějí při perturbaci při pH 2,30.
|
|
|
Vliv propan-2-olu na strukturu cytochromu c v kyselé oblasti pH
Drahorád, Jan ; Hudeček, Jiří (vedoucí práce) ; Martínek, Václav (oponent)
: Ve své práci se věnuji konformačním změnám cytochromu c - jeho denaturaci a případnému vytvoření stavu "molten globule". Zkoumal jsem vliv propan - 2 - olu na konformaci cytochromu c v kyselé oblasti pH. Součástí práce je literární rešerše na téma cytochrom c : Cytochrom c je mitochondriální periferní hemoprotein, který slouží jako přenašeč elektronů v dýchacím řetězci. Mimo jiné má také funkci v apoptóze. Jeho vlastnosti jsem zkoumal pomocí spektrofotometrických metod, zvláště pak pomocí absorpčních spekter a jejich derivací. Zaměřil jsem se na rozsah vlnových délek 250 - 310 nm, 300 - 500 nm a 450 - 650 nm. Proměřoval jsem pufry s rozpuštěným cytochromem c při pH 1,90; 2,10; 2,30 a 2,60 a zkoumal konformační změny zapřičiněné perturbací propan - 2 - olem až do 20% objemového zlomku. Největší konformační změny se dějí při perturbaci při pH 2,30.
|
|
|
Molekulární simulace vodných roztoků alifatických alkoholů
Peštuka, Martin ; Žídek, Jan (oponent) ; Janeček, Jiří (vedoucí práce)
Cílem této bakalářské práce bylo provést série molekulárně dynamických simulací vodných roztoků alifatických alkoholů v nekonečném zředění. Pro práci s molekulárně dynamickými simulacemi bylo nutné seznámit se s programovým vybavením umožňujícím molekulárně dynamické simulace spustit a poté vyhodnotit. V rámci této práce byly simulovány soubory obsahující 300, 400, 500 a 1000 molekul vody a jednu molekulu alifatického alkoholu. Z výsledků simulací byly určovány změny objemu simulačního boxu spojené s vložením jedné molekuly alkoholu do systému (odpovídající parciálnímu molárnímu objemu) a radiální distribuční funkce mezi jednotlivými páry atomů. Výsledky byly porovnány s experimentálními daty.
|
host ::
RSS.