|
|
Analýza aminokyselinové větve biosyntetické dráhy antibiotika linkomycinu
Smutná, Yvona ; Najmanová, Lucie (oponent)
Analýza aminokyselinové větve biosyntetické dráhy antibiotika linkomycinu Abstrakt Linkomycin a jeho deriváty jsou svými antibiotickými vlastnostmi využitelné v humánní i veterinální medicíně k léčbě infekcí způsobených grampozitivními patogeny. Molekula linkomycinu se skládá ze dvou podjednotek, a to methyllinkosamidu a propylprolinu, spojených peptidovou vazbou. Cílem práce bylo přiřadit gen lmbX k biosyntetické dráze propylprolinu, založeném na inaktivačních pokusech. Gen lmbX byl inaktivován pomocí technologie REDIRECT: PCR targeting system in Streptomyces coelicolor. Pro inaktivaci byl vybrán kmen S. lincolnensis, na němž bylo testováno, zda po inaktivaci produkuje do fermentačního média LM pomocí UPLC analýzy. Zastavená produkce LM byla poté obnovena obohacujícím experimentem. Bylo prokázáno, že uvedeným postupem došlo k inaktivaci genu a produkce LM byla potlačena. Obohacujícím experimentem PPL byla produkce LM obnovena a byl gen lmbX přiřazen k biosyntéze PPL.
|
|
|
Vliv exprese genu lmr(C) na biosyntézu linkomycinu u Streptomyces lincolnesis: Rezistence nebo produkce?
Veselá, Ludmila ; Balíková Novotná, Gabriela (vedoucí práce) ; Beranová, Jana (oponent)
Rod Streptomyces produkuje víc jak polovinu známých bioaktivních látek, čímž se řadí mezi významné bakteriální rody. Streptomyces lincolnensis ATCC 25466 ve svém genomu obsahuje biosyntetický genový klastr pro biosyntézu linkomycinu. Vedle biosyntetických a regulačních genů klastr obsahuje také tři rezistenční geny, lmr(A), lmr(B) a lmr(C), u kterých se předpokládá zapojení v ochraně před toxicitou syntetizovaného antibiotika. Protein Lmr(C) patří mezi ARE proteiny obecně udílející rezistenci ke klinicky důležitým třídám antibiotik: makrolidům, streptograminům, linkosamidům a pleuromutilinům. ARE proteiny jsou vedle producentů těchto antibiotik přítomny také u patogenních mikroorganismů. Přesto mechanismus rezistence udílený těmito proteiny, které sice spadají mezi ABC transportéry, ale na rozdíl od nich postrádají transmembránovou doménu, není charakterizován. Tím se ARE proteiny stávají zajímavým předmětem výzkumu. Prostřednictvím delečních mutant v rezistenčních genech lmr(A), lmr(B) a lmr(C) jsme zjišťovali vliv těchto genů na produkci linkomycinu a rezistenci k linkosamidům, linkomycinu a klindamycinu, a to se zvláštním zřetelem na funkci lmr(C). Zjistili jsme, že delece genu lmr(C) zásadně neovlivňuje produkci a ani rezistenci k linkomycinu, avšak má výrazný vliv na rezistenci ke...
|
|
|
Analýza aminokyselinové větve biosyntetické dráhy antibiotika linkomycinu
Smutná, Yvona ; Najmanová, Lucie (oponent)
Analýza aminokyselinové větve biosyntetické dráhy antibiotika linkomycinu Abstrakt Linkomycin a jeho deriváty jsou svými antibiotickými vlastnostmi využitelné v humánní i veterinální medicíně k léčbě infekcí způsobených grampozitivními patogeny. Molekula linkomycinu se skládá ze dvou podjednotek, a to methyllinkosamidu a propylprolinu, spojených peptidovou vazbou. Cílem práce bylo přiřadit gen lmbX k biosyntetické dráze propylprolinu, založeném na inaktivačních pokusech. Gen lmbX byl inaktivován pomocí technologie REDIRECT: PCR targeting system in Streptomyces coelicolor. Pro inaktivaci byl vybrán kmen S. lincolnensis, na němž bylo testováno, zda po inaktivaci produkuje do fermentačního média LM pomocí UPLC analýzy. Zastavená produkce LM byla poté obnovena obohacujícím experimentem. Bylo prokázáno, že uvedeným postupem došlo k inaktivaci genu a produkce LM byla potlačena. Obohacujícím experimentem PPL byla produkce LM obnovena a byl gen lmbX přiřazen k biosyntéze PPL.
|
host ::
RSS.