|
Aptamery ovlivňující podjednotky eIF4F
Kopperová, Dana ; Feketová, Zuzana (vedoucí práce) ; Schierová, Michaela (oponent)
Eukaryotický translační iniciační faktor 4F se skládá ze tří podjednotek - eIF4A, eIF4G a eIF4E. Tyto podjednotky hrají klíčovou roli při iniciaci translace. eIF4G na svém povrchu váže jiné translační faktory. eIF4A je RNA dependentní helikáza, bez níž není iniciace translace možná. Také afinita eIF4E k čepičce je zvýšená pokud s eIF4G tvoří komplex. Pomocí metody Selex byly vytvořeny vysoce afinitní a specifické molekuly, které vážou různé povrchy a jiné molekuly v buňce - tzv. aptamery. Aptamer vázající eIF4A brání ATP hydrolýze. Proti eIF4G existuje více aptamerů, které jeho aktivitu ovlivňují různým způsobem, ale důsledek je stejný - bránění translaci. Také aptamer vázající eIF4E brání translaci a to tím, že znemožňuje vazbu na čepičku. Uvedené translační faktory jsou detekovatelné v nestandardních hodnotách při diagnóze nádorových onemocnění. Jejich aptamery by mohly být řešením při léčbě těchto onemocnění.
|
|
Aptamery - vazebné a regulační vlastnosti molekul RNA
Oplová, Michaela ; Půta, František (vedoucí práce) ; Dzijak, Rastislav (oponent)
Aptamery jsou jednořetězcové ribo- či deoxyribonukleotidy, obvykle délky 20-80 nukleotidů, které prostřednictvím intramolekulárních interakcí zaujímají komplexní trojrozměrné struktury a s vysokou afinitou specificky váží malé cílové molekuly. Generovány jsou in vitro pomocí revoluční technologie SELEX (z angl. systematic evolution of ligand by exponential enrichment) a jejími modifikacemi. Skutečnost, že lze připravit aptamery vážící prakticky jakoukoliv cílovou molekulu, vzbudila značnou pozornost vědecké a medicínské komunity, neboť z aptamerů činí slibné diagnostické a terapeutické nástroje. Aptamery existují i přirozeně; aptamerové domény byly opakovaně nalezeny jako součást regulačních elementů genové exprese bakterií, kde fungují jako specifické receptory buněčných metabolitů. Doména TPP byla nalezena rovněž u rostlin, hub a zelených řas.
|
|
Aptamery ovlivňující podjednotky eIF4F
Kopperová, Dana ; Schierová, Michaela (oponent) ; Feketová, Zuzana (vedoucí práce)
Eukaryotický translační iniciační faktor 4F se skládá ze tří podjednotek - eIF4A, eIF4G a eIF4E. Tyto podjednotky hrají klíčovou roli při iniciaci translace. eIF4G na svém povrchu váže jiné translační faktory. eIF4A je RNA dependentní helikáza, bez níž není iniciace translace možná. Také afinita eIF4E k čepičce je zvýšená pokud s eIF4G tvoří komplex. Pomocí metody Selex byly vytvořeny vysoce afinitní a specifické molekuly, které vážou různé povrchy a jiné molekuly v buňce - tzv. aptamery. Aptamer vázající eIF4A brání ATP hydrolýze. Proti eIF4G existuje více aptamerů, které jeho aktivitu ovlivňují různým způsobem, ale důsledek je stejný - bránění translaci. Také aptamer vázající eIF4E brání translaci a to tím, že znemožňuje vazbu na čepičku. Uvedené translační faktory jsou detekovatelné v nestandardních hodnotách při diagnóze nádorových onemocnění. Jejich aptamery by mohly být řešením při léčbě těchto onemocnění.
|