Hlavní stránka > Výsledky hledání: keywords:"Sca5"
Hledej:
Tipy pro vyhledávaní :: Rozšířené hledání
Hledej ve sbírkách:
Seřadit podle: Zobrazit výsledky: Výstupní formát:
Národní úložiště šedé literatury Nalezeno 2 záznamů.  Hledání trvalo 0.00 vteřin. 
Strukturně- a sekvenčně-závislá identifikace funkčně významných aminokyselin v proteinové rodině.
 Peclinovská, Iveta ; Novotný, Marian (vedoucí práce) ; Pleskot, Roman (oponent)
Skupina malých GTPáz tvoří přes dvacet proteinových rodin v super třídě P-loop a má v buňce velmi rozličné funkce. Malé GTPázy regulují tvorbu vezikulárních váčků, cytoskelet a jaderný transport. Podílejí se též na buněčné proliferaci a signalizaci. Cílem mé práce je nalézt významné aminokyseliny, které rodiny definují a navzájem od sebe odlišují. Zaměřuji se na rodiny Arf, Rab, Ran, Ras a Rho. U rodiny Rho se dále věnuji třídám Rho, Rac a Cdc42. Aminokyseliny budou identifikovány za pomoci vybraných bioinformatických programů Consurf a Sca5. Cílem je také otestovat specializovaný nástroj P2RANK vyvinutý na MFF UK Praha, který predikuje vazebná místa pro ligandy v jednotlivých rodinách. Nalezené aminokyseliny mohou mít velkou úlohu ve funkční divergenci jednotlivých rodin a tříd malých GTPáz a mohou být základem pro další studii věnující se např. rakovinnému bujení v buňkách. Powered by TCPDF (www.tcpdf.org)
Úplný záznam
Existují sekvenční determinanty funkční divergence GTPáz?
 Kraus, Ondřej ; Novotný, Marian (vedoucí práce) ; Potocký, Martin (oponent)
Malé GTPázy jsou významné proteiny ovlivňující řadu buněčných dějů. Ve své práci se zabývám porovnáním pěti nejvýznamnějších proteinových rodin malých GTPáz - Arf, Rab, Ran, Ras a Rho, abych identifikoval aminokyseliny zodpovědné za velkou funkční rozdílnost jednotlivých rodin. K jejich vzájemnému porovnání jsem využil strukturní data z databáze PDB a sekvence z databáze UniProt. Pomocí programu ConSurf a programu Sca5 jsem objevil dříve nepopsané skupiny aminokyselin specifických pro jednotlivé rodiny malých GTPáz. Na příkladu malých GTPáz jsem také provedl pilotní studii použitelnosti B-faktorů jako indikátorů síly vazby v proteinové struktuře. První výsledky nejsou zcela průkazné, ale ani použitelnost B-faktorů jako indikátorů síly vazby nevylučují. Powered by TCPDF (www.tcpdf.org)
Úplný záznam

Chcete být upozorněni, pokud se objeví nové záznamy odpovídající tomuto dotazu?
Přihlásit se k odběru RSS.
Digitální repozitář :: Hledej :: Nový záznam :: Personalizace :: Nápověda
Powered by Invenio v1.1.2
Spravuje admin.invenio@techlib.cz
Tato stránka je dostupná také v následujících jazycích:
Česky  English