|
|
Strukturní charakterizace interakcí podjednotek GBAF chromatin remodelujícího komplexu
Naušová, Karolína ; Veverka, Václav (vedoucí práce) ; Rozbeský, Daniel (oponent)
Epigenetika je vědní obor zabývající se studiem dědičných změn fenotypu, které nejsou zapříčiněny změnou sekvence DNA. Mezi hlavní mechanismy tohoto podoboru genetiky se řadí mimo jiné i remodelace chromatinu zprostředkovaná ATP- dependentními chromatin remodelujícími komplexy, které mají zásadní vliv na expresi genů, a tím i chod organismu. Savčí variantou ATP-dependentního chromatin remodelujícího komplexu SWI/SNF je BAF komplex, který se může podílet jak na aktivaci, tak i na represi genové exprese. Rozeznávány jsou celkem 3 hlavní varianty tohoto komplexu, mezi které se řadí i nekanonický BAF, známý také jako "GLTSCR1 podjednotku obsahující BAF, GBAF". Každý komplex je složen z až 15 podjednotek, z nichž některé jsou specifické pouze pro jednu z variant komplexu. Mutace v genech kódující tyto komplexy vedou k řadě genetických poruch nebo k rozvoji rakovinného bujení. Nekanonický BAF obsahuje specifické proteinové podjednotky BRD9 (z angl. Bromodomain containing protein 9), GLTSCR1 (z angl. Glioma tumor suppressor candidate region 1) nebo GLTSCR1L (z angl. GLTSCR1-like), bez kterých není schopen vzniku. Přestože přesná funkce GBAF komplexu nebyla doposud objasněna, bývá často spojován se synoviálním sarkomem či rhabdoidním tumorem. V těchto nádorových buňkách je narušena funkce dvou ze tří BAF...
|
host ::
RSS.