|
|
Návrh fantomu kapilárního řečiště pro testování akumulace buněk a blokace cév
Eichner, Dominik ; Skopalík, Josef (oponent) ; Čmiel, Vratislav (vedoucí práce)
Tato bakalářská práce popisuje přilnavost buněk, označených železitými nanočásticemi, ke stěně kapiláry, na kterou působí magnetická síla. Nejprve popisuje krevní řečiště a rychlost protékající krve. Dále se věnuje obecné charakteristice nanočástic využitelných v medicíně, popisu využitých mikroskopů a v poslední řadě metodám správné kultivace buněk in vitro. Praktická část pak testuje přilnavost buněk při různých rychlostech v různě velkých kapilárách za pomocí magnetických sil.
|
|
|
Zařízení pro měření koncentrace intracelulárního vápníku v LabVIEW
Kormanovskaya, Elena ; Kolářová, Jana (oponent) ; Čmiel, Vratislav (vedoucí práce)
Diplomová práce se zabývá osvojením metod pro měření koncentrace intracelulárního vápníku, a takže odpovídajícím zařízením v prostředí LabVIEW. Práce se skládá ze dvou částí. V první teoretické části je představena teorie k principu fluorescence, fluorescenčním metodám a indikátorům pro měření koncentrace intracelulárního vápníku. Jsou navrženy postupy měření pomocí fluorescenčního mikroskopu, kamery a barviva pro měření. Představeno literární řešení problémy. V druhé části je představen praktický postup řešení úlohy, jeho realizace, který zahrnuje blokové schémata měřicího zařízení v LabVIEW.
|
|
|
Zařízení pro měření koncentrace intracelulárního vápníku v LabVIEW
Pochlopeň, Timotej ; Ronzhina, Marina (oponent) ; Čmiel, Vratislav (vedoucí práce)
Diplomová práce se zabývá osvojením metod pro měření koncentrace intracelulárního vápníku, a takže odpovídajícím zařízením v prostředí LabVIEW. V této práci je představena teorie k principu fluorescence, fluorescenčním metodám a indikátorům pro měření koncentrace intracelulárního vápníku. Jsou navrženy postupy měřeni pomoci fluorescenčního mikroskopu, kamery a barviva pro měření. Uvedena teorie ke konfokální mikroskopii a jsou porovnány tyto dvě metody. Představeno literární řešení problémy. V praktické části je popsán program s grafickým uživatelským rozhraním sloužící k akvizici a analýze dat pro měření dynamiky koncentrace intracelulárního vápníku. V experimentální části je popsaná příprava a měření s buňkami a vyhodnocení experimentů.
|
|
|
Metody měření koncentrace intracelulárního vápníku
Číhal, Martin ; Ronzhina, Marina (oponent) ; Čmiel, Vratislav (vedoucí práce)
Tato práce má za cíl seznámení se problematikou měřením intracelulárního vápníku. V práci je shrnuta teorie ohledně historie fluorescenčních indikátorů, dále také typy fluorescenčních indikátorů a metody měření. Dále jsou zde uvedeny jednotlivé kroky měření na fluorescenčním mikroskopu. Je zde také vytvořen program pro vyhodnocení Ca2+ koncentrace v buňkách vytvořený v matlabu.
|
|
|
Utilization of spectroscopy in study on stress-resistance of bacteria on the sigle-cell level
Köbölová, Klaudia ; Venerová, Tereza (oponent) ; Sedláček, Petr (vedoucí práce)
This diploma thesis deals with the possibilities of stress resistance analysis of the Cupriavidus necator H16 and PHB-4 bacterial cells by spectroscopic methods and by testing the suitability of acridine orange as a viable dye. Based on research in literature, suitable analytical methods have been proposed, namely flow cytometer and fluorescence microscope. The first part of the experimental work was focused on the fluorescence microscope, which confirmed the basic character of acridine orange. Three stress factors, 50% and 70% ethanol, and acidic pH (pH = 1) were selected for viability monitoring. The bacteria fluoresced with green color after exposure to ethanol and red spots were found next to the cells, indicating their loss of integrity. In an acidic environment, the bacteria fluoresced red because of a partial DNA breakdown. The results were verified by the combination of propidium iodide with SYTO9 and the acridine orange suitability proved to be useful in this method. Image records were processed using image analysis. In the second part, acridine orange was used to monitor fluorescence using a flow cytometer. The result of the measurement was fluorescence expressed as histograms for individual channels, where fluorescence was characterized by median and mean intensity. By comparing the methods used, the acridine orange appears to be a more suitable fluorescent dye for the microscope than for a flow cytometer in which it was more difficult to obtain cell viability information. In the last part of the experimental work interesting photophysical properties of acridine orange were investigated.
|
|
|
Utilization of spectroscopy in study on stress-resistance of bacteria on the sigle-cell level
Köbölová, Klaudia ; Venerová, Tereza (oponent) ; Sedláček, Petr (vedoucí práce)
This diploma thesis deals with the possibilities of stress resistance analysis of the Cupriavidus necator H16 and PHB-4 bacterial cells by spectroscopic methods and by testing the suitability of acridine orange as a viable dye. Based on research in literature, suitable analytical methods have been proposed, namely flow cytometer and fluorescence microscope. The first part of the experimental work was focused on the fluorescence microscope, which confirmed the basic character of acridine orange. Three stress factors, 50% and 70% ethanol, and acidic pH (pH = 1) were selected for viability monitoring. The bacteria fluoresced with green color after exposure to ethanol and red spots were found next to the cells, indicating their loss of integrity. In an acidic environment, the bacteria fluoresced red because of a partial DNA breakdown. The results were verified by the combination of propidium iodide with SYTO9 and the acridine orange suitability proved to be useful in this method. Image records were processed using image analysis. In the second part, acridine orange was used to monitor fluorescence using a flow cytometer. The result of the measurement was fluorescence expressed as histograms for individual channels, where fluorescence was characterized by median and mean intensity. By comparing the methods used, the acridine orange appears to be a more suitable fluorescent dye for the microscope than for a flow cytometer in which it was more difficult to obtain cell viability information. In the last part of the experimental work interesting photophysical properties of acridine orange were investigated.
|
|
|
Návrh fantomu kapilárního řečiště pro testování akumulace buněk a blokace cév
Eichner, Dominik ; Skopalík, Josef (oponent) ; Čmiel, Vratislav (vedoucí práce)
Tato bakalářská práce popisuje přilnavost buněk, označených železitými nanočásticemi, ke stěně kapiláry, na kterou působí magnetická síla. Nejprve popisuje krevní řečiště a rychlost protékající krve. Dále se věnuje obecné charakteristice nanočástic využitelných v medicíně, popisu využitých mikroskopů a v poslední řadě metodám správné kultivace buněk in vitro. Praktická část pak testuje přilnavost buněk při různých rychlostech v různě velkých kapilárách za pomocí magnetických sil.
|
|
|
Metody měření koncentrace intracelulárního vápníku
Číhal, Martin ; Ronzhina, Marina (oponent) ; Čmiel, Vratislav (vedoucí práce)
Tato práce má za cíl seznámení se problematikou měřením intracelulárního vápníku. V práci je shrnuta teorie ohledně historie fluorescenčních indikátorů, dále také typy fluorescenčních indikátorů a metody měření. Dále jsou zde uvedeny jednotlivé kroky měření na fluorescenčním mikroskopu. Je zde také vytvořen program pro vyhodnocení Ca2+ koncentrace v buňkách vytvořený v matlabu.
|
|
|
Zařízení pro měření koncentrace intracelulárního vápníku v LabVIEW
Pochlopeň, Timotej ; Ronzhina, Marina (oponent) ; Čmiel, Vratislav (vedoucí práce)
Diplomová práce se zabývá osvojením metod pro měření koncentrace intracelulárního vápníku, a takže odpovídajícím zařízením v prostředí LabVIEW. V této práci je představena teorie k principu fluorescence, fluorescenčním metodám a indikátorům pro měření koncentrace intracelulárního vápníku. Jsou navrženy postupy měřeni pomoci fluorescenčního mikroskopu, kamery a barviva pro měření. Uvedena teorie ke konfokální mikroskopii a jsou porovnány tyto dvě metody. Představeno literární řešení problémy. V praktické části je popsán program s grafickým uživatelským rozhraním sloužící k akvizici a analýze dat pro měření dynamiky koncentrace intracelulárního vápníku. V experimentální části je popsaná příprava a měření s buňkami a vyhodnocení experimentů.
|
|
|
Zařízení pro měření koncentrace intracelulárního vápníku v LabVIEW
Kormanovskaya, Elena ; Kolářová, Jana (oponent) ; Čmiel, Vratislav (vedoucí práce)
Diplomová práce se zabývá osvojením metod pro měření koncentrace intracelulárního vápníku, a takže odpovídajícím zařízením v prostředí LabVIEW. Práce se skládá ze dvou částí. V první teoretické části je představena teorie k principu fluorescence, fluorescenčním metodám a indikátorům pro měření koncentrace intracelulárního vápníku. Jsou navrženy postupy měření pomocí fluorescenčního mikroskopu, kamery a barviva pro měření. Představeno literární řešení problémy. V druhé části je představen praktický postup řešení úlohy, jeho realizace, který zahrnuje blokové schémata měřicího zařízení v LabVIEW.
|
host ::
RSS.